柑橘家的混乱八卦史,都上《Nature》了!

柑橘家的混乱八卦史,都上《Nature》了!
作者:史军
来源:《中国科技教育》2018年第04
        如果用一个字形容柑橘家族里那些个亲戚之间的事情,那就是,如果要再加一个形容词的话,那就是特别乱。整个柑橘家亲戚的故事堪比神话。在我之前的文章《柑橘家的不堪往事》(——我刊2013年第2期)中曾经用当时已经发表的研究成果,梳理过柑橘家谱的草图。简单说,当时人们认为,庞大的柑橘家族虽然人丁兴旺,但是除了少数成员之外,绝大多数品种都是宽皮橘(CitrusreUculata声阻抗mol comfort)、柚(C.maxima)和香橼(C.medica,也叫枸橼)这3个野生种的后代。然而,柑橘家实在是太乱了,这张草图里还有很多不确定的地方。所以长久以来,给柑橘家族编制一个靠谱儿的家谱,仍然是科学家们日思夜想的事儿。这事儿是因为柑橘不但好吃,还是世界水果贸易的重头。随着技术手段的进步,在吃了大量橘子、橙子和柚子,再进行了大量的中兴u720DNA分析之后,美国能源部联合基因组研究所的科学家终于理清了柑橘家的家谱,在《自然》杂志上发了一篇超长论文,加上附件足足有20页。
        这篇超长论文的内容总结起来大概就这么几句话:第一,我们吃的柚子是柚子,香橼是
香橼,橙子是橙子,但橘子不一定是橘子;第二,世界上所有的柑橘都是相亲相爱的一家人,香橼只当爸,柚子只当妈,橘子既当爸也当妈;第三,柑橘全家很可能都是喜马拉雅山人800万年前下山之后,东去宝岛,南去澳洲,一切随缘。
        柑橘家的家谱为啥那么难查,那是因为这个家族实在是太乱了。也就是说,柑橘家的任意两个物种,甚至是杂交出现的新物种搞在一起都是很正常的。混乱的背景就此形成。在这个过程中,人类也来添乱,在水果种植中经常使用的嫁接和芽变筛选,就是两个超级麻烦的影响因素。很多无记载的栽培柑橘,根本就不知道它们跟原生种到底有啥关联。
        想搞清楚柑橘家里的关系,只能依靠基因对比分析。但研究人员对DNA右旋氨基物位点的艰苦筛选和分析,是个超级麻烦、超级需要时间的工作。虽然柑橘类水果的基因组规模一般只有人类基因组规模的江西财经大学学报1/8,但以过去的技术,测定这样的一个基因组,至少也得23年的时间。还好,新技术的出现把这个时间缩短到了不到半个小时。于是,研究人员这次一口气测定了台湾三党是哪三党30个柑橘类野生和栽培品系的全基因组,再把已经发表的另外30套全基因组数据通通下载回来一起分析,终于得出了一个接近真实的柑橘家谱。

本文发布于:2024-09-20 11:49:28,感谢您对本站的认可!

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标签:柑橘   基因组   分析   水果   家谱   超长   时间
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