KaKs分析与纯化选择

遗传漂变KaKs分析与纯化选择

htv-2ω = dN/dS, the ratio of nonsynonymous/synonymous substitution rates

迈克尔哈内克dN/dS就是Ka/Ks，⾮同义替换率/同义替换率

赵凌子ω < 1 的区域：negative purifying selection （负向）纯化选择；⾮同义替换率⼩于同义替换率，此时⼤多数⾮同义替换是有害的，⼤部分⾮同义替换被purify。絮凝剂

ω = 1 的区域：neutral evolution 中性进化；⾮同义替换率等于同义替换率，核酸替换⽆关痛痒，不受到强烈选择，此时进化主要由遗传漂变主导；

ω > 1 的区域：positive selection 正选择；此区域发⽣的⾮同义替换对物种有利，并且受到环境的正选择保留了下来。

⼤多数情况（基因组区域）下 ω < 1 。

本文发布于:2024-09-20 14:48:40，感谢您对本站的认可！

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