骨髓增生异常综合征患者血清蛋白质组学特征研究

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・临床研究-骨髓增生异常综合征患者血清蛋白质组学特征研究
钟立业刘天浩李扬秋耿素霞陆泽生翁建宇吴穗晶罗成伟杜欣
摘要目的:利用铜螯合磁珠(magneticbeads小asedimmobilizedmeta】a珩nit),captureCu)分离低峰度蛋白,以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(mat血.assistedlaserdesorption/ionizationtime—of-nightmassspectmmetry,
MALDI.TOF—Ms)技术分别检测骨髓增生异常综合征(mvelodvsplasticsyndmmes,MDs)患者和正常人血清蛋白质
链的质量指纹谱.探索用于MDS辅助诊断的客观方法。方法:收集16例MDS患者(MDs组)和10例正常人(正常
对照组)的血清蛋白标本.应用铜螯合磁珠进行蛋白分离。通过MAI。DI.TOF—Ms测定标本的蛋白质谱图,对比分析差异蛋白峰.并建立诊断模型。结果:分子质量1.02—10.25ku范围内共检测到信噪比>3的峰146个,经统计分析,MDS组和正常对照组之间差异明显,有显著性
差异峰12个(尸<0.05),利用快速分类算法建立诊断模型,模型
的识别准确率和交叉验证敏感性分别达93.27%和89.94%。各亚型对比分析,各组间区域交叉,组间差异不明显;
根据ll盘床分型.将难治性贫血伴幼稚细胞增多型(RAEB型)与其他类型MDs比较,发现RAEB型患者血清中有
1个差异低表达蛋白峰,分子质量约l466.57,经鉴定为纤维蛋白原N端片段。结论:MALDI.TOF.Ms技术平台可
用于寻MDS相关的血清蛋白质标志物.其蛋白质谱诊断模型可以区分MDs与正常人。有助于MDS的,临床辅助诊断。RAEB型患者与其他类型的MDs中存在差异表达蛋白.提示进展型MDs与其他类型MDs有异质性。
关键词骨髓增生异常综合征;蛋白质组学;血清;质谱
StIIdy
on辩邝mproteomicspectrainpatients、vithmyelodys
pI雒ticsyndrom嚣ZH0ⅣG厶・弘’,£,U7妇l一^∞,£,y伽舻giu,GE,vGSM・石缸,£u压-s^e昭,形EM!五∞一yu,形uJsuili昭,£“O仇,学加ei,Duxi凡.乖眈JD们脚m矿He,n以0209y,&,蹴r
q厂0wo如gy,cⅧ7增如昭Ac础my矿胁如以&拓Mes/G脚愕d0昭Ce耻以舶印j删,G呦铲胁l正5l0080.Chtnn
【Abstract】objectiveToinvestjgatewhetherserumpmteomepmfilingmayserveasanoninvasiveplatfb丌nforestablishinganobjectivemodelsthatmaybebene矗cialtosemlo矛cdiagnosisofmyelodysplasticsyndmmes(MDs).
Met量lodsserums帅pleswerecolJectedfrom16patient8withMDsand10healthysubjects.Serumpeptideswere
sep啪tedandpu一6ed、^dthapu^ncationkitofmagneticbeads—basedimmobilizedmetaJafnnitycaptuI七on
thesuIfaceof叫perp眦magneticmicmparticles(MB-IMACCu).Wegeneratedserumproteomeprofilesbymatrix—assistedlaserdesorption—ionizationtime-of_flightmass8pectmmetry(MALDl-TOF-MS)andidenti6edapm6lethatdistinguishesMDsf南mhealthysubjects,anddiagnosticmodelswereestablishedbysta“sticalanalysisbasedondifkrentexpressedproteinpeaks.ResIIltsAtotaJof146efkctivepmteinpeakswere
detectedatmoIecularrangef而m1.02to10.25ku,amongwhich12prDteinpeaksweredif!fbrentsignincantlybetweentheMDspatientsandtheheahhysubjects(P<0.05).7I'hediagnosticmodelswereestablishedbympidclassificationappmach.Therecognitioncapabilityandcrossvalidationofthemodelwere93.27%and89.94%respectively.However,therewasnot
significantdjf玷renceforpeptidemass右ngerprinfinginpatientswithdifferentsubl丫pes“MDS.AccordingtoclinicalclassincationofMDS,t|leproteinpeaksinRAEB
comparedwithitinothersubtypesofMDS,therewasasigni6cantlydifferentexpressedpmteinpeakinl446.57betweentllem,whichwasidenti丘edasapieceof6brinogenpeptide.7rheexpressionsofnb—nogeninpa“entswithRAEBwerelowerthanpatients“thothersubtypesofMDS.ConclusionsMALDI—TOF—MStechniquecanhelptoidentifyserumproteomicbiomarke瑁relatedtoMDS.T1lediagnosticmodelscandiscriminateMDSpatientsfromhealthysubjectse仃bctiveIyandserveasanoninvasivediagnosticplatf0唧.Thedifferentexpressionoffib^nogenbetweenRAEBandothersubtypessu韶ested
hetemgeneityofetiopathogenisisbetweenadVancedMDSandothersubtypesofMDS.
【Keywords】Myelodysplasticsyndmmes;P1.oteomics;semm;Massspec£m
骨髓增生异常综合征(myelodysplasticsyndromes,MDS)是一组多能造血干细胞水平上突变的获得性克
基金项目:广东科技计划基金项目(编号:2006836005009)
作者单位:5l0080广州市.广东省医学科学院,广东省人民医院肿瘤中心血液科[钟立业.耿素霞,陆泽生.翁建宇,吴穗晶,罗成伟,杜欣(钟立业,吴穗晶为暨南大学医学院血液病研究所在读博士研究生)];510120广州市,中山大学附属第二医院肿瘤科(刘天浩);510632广州市,暨南大学医学院血液病研究所(李扬秋)隆性疾病,以全血细胞减少及骨髓病态造血为主要表现.30%的患者可以转化为白血病。¨。目前MDS诊断分型主要依靠着细胞形态学,源于形态学本身复杂性及主观性的限制.MDS的诊断存在着困难。有研究证实.MDS患者细胞遗传学异常以及基因超甲基化后,直接导致了蛋白表达的质与量的异常,可表现为患者血清中生长因子及细胞因子等水平异常[2]。因此,通过全面了解MDS患者血清蛋白质肽链的质量指纹谱
万方数据
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特征,可以建立一种新的实验室方法.为临床提供新的客观依据,协助MDS的I临床诊断。
1材料与方法
1.1实验材料
1.1.1标本所有血清标本均来自广东省人民医院。本研究包括MDs组及正常对照组,MDs组16例,其中难治性贫血伴幼稚细胞增多型(refractorvanemiawithexcessblastsintransformation,RAEB)8例。难治性血细胞减少伴多系病态造血型(refractorycytopeniawithmultilineagedysplasia,RCMD)6例,难治性贫血伴铁粒幼细胞增多型(refractorycytopeniawichringedsideroblasts,RAS)2例;正常对照组10例。MDS组本为2006年7月至2008年2月广东省人民医院住院患者,诊断标准按照2001年wHO的血液髓性肿瘤的诊断及分型标准【3]。正常对照组为研究期间的正常体检人员。MDS组男11例,女5例,平均年龄65岁:正常对照组男6例,女4例,平均年龄56岁。各组研究对象
于超颖
均无影响血清蛋白质含量的其他疾病。1.1.2试剂及主要仪器铜螯合磁珠(MB.IMACCu)试剂盒购自德国布鲁克・道尔顿公司:AutoFlexMALDITOF/TOF质谱仪产于德国布鲁克・道尔顿公司。1.2方法
1.2.1血清标本制备晨起空腹。干燥管采集研究对象静脉血5mL,立即1500r/min离心10min.吸取血清,分装后置于一80℃冰箱中待用,避免反复冻溶。使用时取出分装的血清样品.冰上融化,4℃12000r/min离心10min,除去血清中的不溶物。
1.2.2血清蛋白分离(1)取出MB.IMACCu悬浮液1管,摇动并完全混匀磁珠悬浮液1min;(2)取出5“L磁珠加入200“L样品管,再加入50斗LMB.IMACCu结合缓冲液,将样品管放入磁珠分离器,在前后相邻两孔间反复移动样品管;(3)样品管在磁珠分离器上停留20s,使磁珠富集于管壁;(4)小心吸去样品管中的溶液后,并重复上述步骤两次;(5)向样品管中加入20斗L缓冲液使磁珠重新悬浮,再加5斗L血清,用吸打混匀;(6)室温放置5min后,将样品管再放人磁珠分离器静置20s,使磁珠与悬浮的液体分开;(7)用吸去悬浮的液体,再向样品管中加入100斗L清洗缓冲液,反复移动样品管;(8)使样品管在磁珠分离器上静置20s,用吸去悬浮的液体;(9)重复(7)、(8)步骤两次,将完全吸走悬浮液。从磁珠分离器上取下样品管,并向样品管中加入10恤L洗脱缓冲液,混匀贴壁的磁珠,反复吸打混匀,室温静置5min;(10)样品管放人磁珠分离器,磁珠贴壁20s,磁珠与洗脱液分离;(11)将
洗脱下来的多肽样品溶液移人干净的0.5mL样品管.可用于直接质谱分析或冻存一20℃24h内质谱分析。1.2.3质谱检测取磁珠处理最后得到的洗脱样品溶液,先点l斗L,室温放干;再点l¨L基质,室温放
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干后即可进行质谱分析。仪器参数:离子源电压20kV.脉冲离子提取电压18.8kV。离子提取延迟时间100ns.基质抑制m/z<700.质量范围m/z960~10400.激光频率50Hz,激光能量40%。每个样品任取16个点,每个点轰击50个激光脉冲,共采集800个激光脉冲累加得到各个样品的质谱图。
1.2.4差异蛋白质鉴定对于特殊异常表达蛋白进行单链蛋白肽测定,利用MALDlTOF/TOF质谱仪以单链测定模式进行能够肽链二级质谱分析。测定范围在m/z1000—4000。
1.2.5质谱数据的采集和分析应用MALDI.TOF.Ms专门的统计分析软件clinProT00ls进行分析。首先调入各组样品的数据.经过谱图的平滑和基线扣除.产生一张所有样品的平均谱图,在该平均谱图上标出大于一定信噪比(如S/N>3)的谱峰.再对这些谱峰的强度在各组进行统计分析。以£检验对MDS组与正常对照组进行比较,以方差分析或anderson.darling检验进行MDS组内各亚型组分析,P<0.05为差异有显著性。2结果
2.1MDS与正常人比较MDS患者和正常对照的血清蛋白指纹图谱经标准化后,经peakstatistic对两组人血清中蛋白峰的数量和相对强度进行统计分析。在分子质量1.02~10.25ku范围内共检测到S/N>3的峰146个,根据统计学主要参数分析,MDS组和正常对照组之间差异明显,有显著性差异峰12个(P<0.05),其中在MDS组中的高表达蛋白峰7个,低表达蛋白峰5个(表1)。经综合分析,利用快速分类算法建立诊断模型,模型的识别准确率和模型交叉验证敏感性分别达93.27%和89.94%。
橡皮垫圈表l两组血清中异常表达的蛋白质峰面积比较贾±s
2.2不同亚型MDS比较及差异蛋白鉴定MDS患者血清蛋白指纹图谱经标准化后.根据临床诊断分型结果.分别对RAEB型、RCMD型及RAS型MDS血清中蛋白峰的数量和相对强度进一步比较,结果显示,各组间区域交叉,组间差异不明显(P>0.05);但根据临床分型,将RAEB型与其他类型MDS比较,发
万方数据
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现RAEB型患者血清中有一个显著性差异的低峰蛋白(P<0.05),分子质量约1466.5
7(表2)。经二级质谱对该肽链进行分析鉴定,结果输入蛋白数据库比对后,确定该蛋白为纤维蛋白原N端片断,图1显示了
6000
4000
2000
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鉴定的二级质谱图。
表2RAEB型MDS患者中低峰蛋白i±s分子质量RAEB型MDs平均蛋[J峰面积其他类型MDS平均蛋白峰面积P值等离子炬
200400600800l0001200l400m/z图1MALDITOF/ToF肽链鉴定图
3讨论
蛋白质组学最早是在1994年由意大利的Sienna提出.近年来在各领域均得到广泛的应用.尤其在肿瘤的研究中尤为突出[3]。应用蛋白质组学技术对MDS辅助诊断已在部分研究中得到证实。2007年Manuel等[一]利用SELDI.TOF.Ms方法,检测分析了218例MDS患者血清蛋白质组学的特征,结果发现.MDS患者血清蛋白质谱具有鲜明的特征,有助于MDs的诊断。本研究选择了操作更为简便的磁珠法分离血清的低峰度蛋白.并改用目前重复性更好的MALDI.TOF.MS方法检测其肽链的质量指纹谱i5|,结果显示,与正常对照比较.MDS患者血清蛋白质组有明显异常的蛋白质峰,其谱型有特异性,而且通过建立诊断模型,其诊断识别准确率和模型交叉验证敏感性均在90%左右,说明该方法可行。本诊断方法基本着眼点是选择具有最佳诊断效力的蛋白质峰组合,通过建立分析模型辅助诊断.而不是评价单个蛋白质峰的诊断效力。
在MDS组内对比分析中.笔者并未发现具有进一步诊断分型意义的特异性的蛋白质谱型。由于本研究中各亚型标本数量有限,因此,对以MALDI.TOF.Ms血清蛋白质组学方法为基础的MDS临床分型价值,目前笔者不能给予合理的评估。根据目前wHO的MDS分型方法,通过对进展型MDS(RAEB型)与其他亚型的比较,本研究发现.RAEB型患者血清中存在一个异常低峰蛋白一纤维蛋白原片段,该蛋白的异常减低可能与此类患者凝血系统异常激活有关,这主要是由于RAEB型MDS患者常有明显的出血倾向,作为重要的凝血物质,纤维蛋白原在促进止血后,血清中的异常蛋
含量会明显减少。当然,其蛋白表达是否下降尚不能确定,也有待进一步探索。另外,该异常蛋白的出现也提示RAEB型有别于其他亚型的异质性,并且支持了Manuel等[4]的研究结果。
总之。以MALDI.TOF.MS技术平台为基础的血清蛋白质组学方法,可用于对MDs相关血清标志物的探寻。作为一种非侵入性的客观手段。其有助于MDS临床的辅助诊断。
4参考文献
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山东平度陈宝成事件
(收稿:2009-08一19编辑:吴淑金)
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