TOP实验室秘籍:质粒扩增及提纯的步骤详解

TOP实验室秘籍:质粒扩增及提纯的步骤详解
小灵子,我,即将毕业的医学研三狗,分享一下从师以及大神那里学来的提质粒方法,第一次做,算比较成功,虽然其中过程非常曲折。中间问了身边好多同学,都不是很会,研一上课的时候学实验,老师也只是简单讲了一下提纯的步骤,所以我这个科研小白还是打算来和大家分享一下,希望对有需要的同学有所帮助,也希望大家能够多多交流,万一有大神指点呢!
Day1
第一天最重要的是什么!当然是准备工作!
准备工作
1. 配液体 LB(这个东西我们这么叫,但是同科室专门做菌的小管它叫脑心脊液,也是我比较困惑的一点)蛋白胨 10g, 酵母 7.5g, NaCl15g,去离子水定容到 1000ml —— actually,用不了那么多,两个样最多用 300ml,剩下的近期没有其他人用,扔掉我们还很心痛,所以暂时还放在我们 4℃ 冰箱里保存着呜呜呜——所以,如果没有那么多样品的话,
建议可以按比例减掉的哟!
2. 配 CaCl 2 :4.44g CaCl 2 + 500ml 去离子水 (当然一次就用一点点,也可以按比例递减的)不过没用完,没结晶的话以后也可以用。
3. 配固体培养基:蛋白胨 1g , 酵母 0.5g, NaCl 1g , 琼脂1g,去离子水定容到 100ml。
4. 玻璃珠(这个是涂我们的小菌菌用的,我觉得用接种环、干净的棉签、小木棍都可以,实验室有啥用啥,能省就省!)
5. 一套头(作为科研狗就别问我一套头是什么意思了!)
6. 玻璃培养皿 (讲道理,塑料的10cm皿也可以)。
7. 离心管( 15ml 的多来点!)
8. 一盒Ep管( 1.5ml 的就够了)
9. 配抗生素:
Ampicillin :工作液 100μg/ml ,可以先配成 100μg/μl ,用时 1:1000
韦氏测试Kanamycin :工作液 25μg/ml ,可以先配成 25μg/μl ,用时 1:1000(不一定每个质粒都一样哦,记得看它带来的说明书)
PS:固体培养基先不要高压,凉了就凝了!其他的速度高压,烘干放在超净台里等待我们接下来的实验hiahia~
步骤一:摇菌
将大肠杆菌(一点就够~具体我反正是加了 10μl )3~4ml LB 培养基中, 37℃ 过夜,剧烈摇晃~ 150-200r 就可以啦。SHAKE! JUST SHAKE! LET’S SHAKE!(我用的是大肠杆菌,其他菌种,作为一个菜鸟我也不是很清楚了!如果实在不知道就去多问一问吧、自己查去!哈哈哈哈哈)
Day2:又是新的一天!
步骤一:菌种活化
把我们昨天摇的菌拿出来,观察一下下它活没活——如果活了它会又臭又浑浊的~但是会很开心~小菌菌它活了~
琼脂糖凝胶菌:LB=1:1000 (大神表示其实 1:100~1:300 比较好,能活化的快一点) 37℃,110r 剧烈摇, 1~1.5 小时 (可能 3h更好一些)
目的:让菌液的 OD 值在 0.3~0.6 之间,处于对数期。
步骤二:高压灭菌
高压灭菌,请根据自己实验室的情况在活化菌种的三个小时里,高压固体培养基。
高压完的固体 LB 冷却到手温—这个温度需要自己掌握,我第一次做的时候就翻车了,因为冷却到手温再加抗生素再倒就已经来不及了,前几个皿还算可以,剩下的直接给我凝在了锥形瓶里,所以第二次老师弟帮我问了度娘,说手心不烫手背烫的温度就可以了(当然这个有点迷幻我没做到)
后来我又问了实验室养菌的美丽小,她表示 50~60℃ 就可以,她加很多种抗生素,那
些抗生素该好用还是会好用的,于是我做的时候就放心大胆地只要 温度降到在我手可以忍受的程度了,就开始加抗生素然后倒平皿!
所以真正的实验步骤开始了:以下步骤请在超净台中完成。
高压后的固体培养基冷却到实验者自己可以忍受的温度,按质粒说明书上所带的抗生素浓度加入抗生素,倒入平皿中,打开排风扇,打开平皿盖等凝固,凝固后盖上平皿盖,倒置平皿。
PS:磨叽的我又来了!倒平皿的时候请把皿拿起来半盖盖子胳膊肘放在台子上,皿举在你的眼睛前面,这样能保证你的手不会污染皿,也能保证你能看到倒了多少培养基进去。像这样:
培养基的量就是不能太薄到一挑就破了,也不能太多,要不其他皿该不够了。
然后培养基倒完了不能有气泡,要平整—老师弟在我耳边这样念叨。
步骤三
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取出摇好活化的菌,取 1~1.5ml 加入 Ep 管中, 4℃ , 1000r , 1min(这个我觉得取决于你要提几个质粒,样品多的话取两管 1.5ml 的)。
步骤四
用头吸出培养基,加入 200μl 预冷过的 4℃ CaCl2 , 吹打混匀,分装 5 0μl 一管,制备感受态。
步骤五
把分装出的 EP 管在冰上静置 20min ,加入质粒 50~100ng (我觉得如果质粒浓度本身就高可以多加一点,毕竟少于1μl量太小不好掌握,别浪费就行),再冰上静置 20min , 热激42℃,90s (务必精准迅速!),插回冰上,静置 10min 。
热激是为了打开孔道,让质粒进入,插回冰上是为了关闭孔道,让质粒出不来~hiahia~(这一步是很重要的一步,隐藏着很多细节,比如你什么时候制冰,什么时候开恒温水浴箱,原始的质粒什么时候出来,我就提醒到这里啦,根据自己实验室情况看着办吧)。
步骤六
加入无抗生素 LB 每管 500μl , 37℃ 慢摇( 80r ), ‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍1h。
目的:转进去质粒的细菌表达出抗性蛋白,使细菌耐对应的抗生素。
步骤七
涂板,这时候就是要用到玻璃珠或者接种环balabala的,加入适量菌液(我怕菌不算太多,加了 80μl ,一般 50μl 就够,太多了菌落容易疯长不好挑菌),玻璃珠就轻轻来回摇就可以了,你能看到培养基上菌液划过的痕迹。接种环或者别的就自己想吧,反正涂开就行。
Like this ~
步骤八
倒置平板, 37℃ 孵箱过夜。
PS:今天的实验要设置好对照,需要有加抗生素培养基的空白对照,加了菌种的阴性对照,和你的样品。如果明天一看空白对照和阴性对照长了菌,恭喜你不用继续往下做了,
要不就是污染了,要不就是抗生素不好使。如果明天你的样品没长出来菌,恭喜你也做不下去了,要不就是抗生素加多了,要不就是质粒没进去哈哈哈哈!(以上代表个人观点,如有不对请告诉我!)
linpackDay3:又是新的一天!
步骤一
取出平皿,观察菌落是否生长, 4℃ 倒置放(先保存一会, 37℃ 时间久了菌落会太多)
步骤二
将抗生素按说明书浓度加入 LB 培养基中,培养基 3~4ml ,挑出菌落,连头一起打入(注意是单个菌落,我问了一个可爱的老师什么叫单个菌落,我们一致认为就是长得小的哈哈哈)
为了以防万一,第一次做这个实验的我选择挑了两个看着顺眼的小菌落~
步骤三
37℃ ,剧烈摇 150r 过夜。
PS:挑菌的时候用头,尽量不要扎破培养基,并且挑一半留一半,我觉得轻轻刮下来就好,毕竟只是为了把小菌菌挑出来继续长。这步时间很少,空隙做就好,晚上离开实验室之前给它摇上就行,因为菌摇的时间不宜太长, 15~17h 比较好,太久的话菌会老化也会变得太多。
前面忘记说了,因为大肠杆菌的特性,这种离心管摇的时候要拧松但是拔不下来。然后摇的时候离心管斜着插,保证能摇起来。
大概图中介个亚子:
Day4:又又又是新的一天!
今天我们就要用到 21 世纪科研工作者的福音:试剂盒,今天需要先小提一下先验证一下扩增的质粒是否和原质粒一致,第二天再进行质粒大提。
质粒小提不要把菌液都用了,否则大提就没有菌啦!4ml我就用 1.5ml ,一个 EP 管的量就可以啦。
步骤一: 质粒小提
东方轮船公司质粒小提:下面附上说明书(我和老师弟一致认为这玩意太好用了)。
金雕复仇PS:小提的时候就不用在超净台里面啦!只要按照说明书操作就可以啦,注意试剂顺序不要加反什么的。离心时间和加入液体的体积按自己菌液的情况加入,我,身为一个天秤,在保证实验能进行下去的情况下都取了比较中间的值~
质粒小提的这个试剂盒不是去内毒素的,价格很便宜,毕竟只是为了初步验证质粒质量,如何验证呢?蛋白用 WB ,核酸当然用琼脂糖 ~
步骤二: 琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳:自己好好查一下配 LB 培养基的琼脂和琼脂糖!试剂上多数都是英语,用翻译软件的时候一定要看清楚不要弄反了,琼脂糖好贵的呢!

本文发布于:2024-09-21 17:41:01,感谢您对本站的认可!

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