酵母双杂交方法步骤

1. 制备Y2HGold酵母感受态细胞
a. 活化酵母菌:从-70℃取出冻存的酵母菌种,划线于YPDA(无抗性)固体培养基,30℃,倒置培养2-3天;
b. 挑取2mm左右大小的单菌落,接种于15ml YPDA液体培养基中,30℃,200rpm震荡培养过夜(12-14h),至OD600大于1.2;
c. 取5ul菌液接种于50ml新鲜YPDA液体培养基中,30℃,200rpm震荡培养16-18h,使OD600约为0.2-0.3;
d. 室温700g离心5min,弃上清,重悬沉淀于100ml YPDA液体培养基内,30℃震荡培养3-4h,直至OD600达到0.4-0.5;
e. 转移菌液至50ml离心管内,室温离心700g,5min,弃上清;
f. 25ml无菌水悬浮细胞,700g,5min,弃上清;
g. 1ml 1×TE/ LiAc溶液重新悬浮细胞后,将悬浮物转移到2个1.5ml 离心管内,高速离心10
s,移液吸尽上清;
h. 将细胞重新悬浮于500ul 1×TE/ LiAc溶液,即酵母感受态细胞。周小青
注:酵母感受态细胞即刻用于转化,室温只可保存数小时。
2.转化Y2HGold酵母感受态细胞。
a. 1.5ml离心管中按顺序加入下列物质:
实验组
对照组
阳性对照
阴性对照
用量
pGBKT7-Mads
pGBKT7空载
pGBKT7-53
pGBKT7-Lam
200ng
pGADT7-T
100ng
变性鲑鱼精DNA
200ug
Y2H感受态细胞
100ul
1×TE/ LiAc/PEG4000
500ul
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注:鲑鱼精DNA使用前水浴煮沸20min,立即冰上冷却10min。
b. 头轻柔混合1-2min, 30℃恒温孵育30min(期间每10min颠倒混匀一次);
c. 加入30ul DMSO(二甲基亚砜),轻柔的混合均匀,不能剧烈震荡;
d. 42℃水浴15min(每5min中取出混匀一次)后,立即置于冰上2min。高速离心10s,移液吸尽上清;
e. 1ml YPD Plus 重悬细胞,30℃,180rpm震荡培养1h;
f. 高速离心15s,弃上清,1ml 0.9%NaCl溶液重悬细胞;
e. 取100ul稀释10倍的转化混合液涂布于相应的缺陷培养基,30℃倒置培养3-5天。
注:各个转化菌株所要涂布的缺陷性培养基如下表:
格雷戈里
转化菌株
缺陷培养基
作用
pGBKT7-Mads
SD/-Trp
毒性验证
SD/-Trp/X-a-gal/Aba
自激活验证
pGBKT7空载
SD/-Trp
毒性验证
pGBKT7-53
& pGADT7-T
SD/-Trp/X-a-gal/Aba
ap点
自激活阳性对照
pGBKT7-Lam & pGADT7-T
SD/-Trp/X-a-gal/Aba
自激活阴性对照
Yeast Mating
1. SD/-Trp培养基上选取直径大于2mm携带pGBKT7-Mads的Y2HGold单菌落(已PCR验证),接种于50ml SD/-Trp 液体培养基,30℃,200rpm震荡培养过夜(16-18h),使OD600大于0.8;
2. 3000rpm,离心5min,弃上清,用4-5ml SD/-Trp液体培养基重悬细胞,使密度大于1×108细胞/ml;
3. 将分装的1ml油棕cDNA文库从-70℃取出,22℃水浴融化;
4. 2L锥形瓶中加入1ml油棕cDNA文库和4-5ml细胞浓度达到1×108细胞/ml的诱饵菌液;
5. 用1ml 2×YPDA液体培养基冲洗文库管壁2次,冲洗液体加入2L锥形瓶中,最后加入45ml 2×YPDA液体培养基(含50ug/ml卡纳霉素);30℃,30-45rpm缓慢震荡20-24h;
6. 培养20h后,取出一滴菌液于载玻片上,显微镜下观察酵母形态,若细胞形态呈现“Mickey Mouse Face”则继续缓慢培养4h,直至酵母细胞形态恢复正常;
7. 将菌液转移至50ml离心管内,同时用50ml 0.5×YPDA液体培养基冲洗2L锥形瓶瓶壁2次,将2次冲洗的菌液转移至50ml离心管,3000rpm,离心10min,收集细胞,弃上清;
8. 加入10ml 0.5×YPDA液体培养基重悬细胞,记录菌体与悬浮液体积总和;
9. 从混合菌液中取100ul做1:10,1:100,1:1000,1:10000,1:100000稀释后,各取100ul稀释液涂布于SD/-Trp,SD/-Leu,SD/-Trp/-Leu固体培养基星光咏叹调上,30℃,倒置培养3-5d;
10. 将剩下的混合菌液全部均匀的涂布于SD/-Trp/-Leu/X-α-gal/Aba固体培养基上,30℃,倒置培养3-7d;
11. 3天后,观察菌落形态;菌落大于2mm圆润饱满且为的即为阳性候选克隆;
12. 10ul头蘸取蓝单克隆,稀释于5ul无菌水中,将稀释的克隆打入已划分好格子的SD/-Trp/-Leu/Ade/His/X-α-gal/Aba固体培养基上,30℃,倒置培养3-5d;
13. SD/-Trp/-Leu/Ade/His/X-α-gal/Aba固体培养基上选取依然为蓝的克隆接种于SD/-Trp/-Leu/Ade/His液体培养基,30℃,200rpm震荡培养16-20h。
14. 保存阳性克隆菌种,提取酵母质粒,质粒PCR验证目的条带 (通用引物T7/3AD);
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15. 将有目的条带的质粒转入大肠杆菌扩增,涂布于含有氨苄抗性的LB固体培养基从而筛选文库质粒;
16. 挑选单克隆于50ml LB液体培养基(含50mg/ml氨苄青霉素)扩大培养;
17. 取1ml扩培菌液送测序;
18. 在NCBI网站上进行Blastx分析。

本文发布于:2024-09-21 13:46:26,感谢您对本站的认可!

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