(完整版)提取细胞RNA的步骤

(完整版)提取细胞RNA的步骤
提取细胞RNA的步骤:
1) 六孔板每孔细胞中加入1ml Trizol,冰上放置5min,头吹打。
2) 将各孔裂解液吸到1.5 ml EP管中,加入氯仿0.2ml/管,用力振摇15s。15-30℃下孵育2-3min,离心(4℃,12,000g,15min)。
3) 离心后液体分为三层(上层-无水样层为RNA,中层白为DNA和底层红为蛋白质),小心吸取上层无液体移入一新的EP管中。
4) 加入等体积异丙醇,0.4-0.5ml,混匀,15-30℃下孵育10-30min,离心(4℃,12,000g,10min)。其中如果加入等体积异丙醇后,置于试管架上用PE手套密封后,放于4℃冰箱中,沉淀30min效果更好。
5) 去上清,沉淀加入75%乙醇1ml,漩涡振荡30s,离心(4℃,7,500g,5min)。
6) 小心去上清,管内沉淀在超净台中鼓风静置干燥3-5min。最好是用头吸取上清,尽量
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7) 加入20ul DEPC水溶解,分装5ul/管,-70℃冰箱保存。
8) 细胞总RNA的鉴定:0.9-1.2%琼脂糖电泳鉴定细胞总RNA,观察出现条带及各条带亮度。紫外分光光度计测定:分别测定细胞总RNA在260nm和280nm处的光密度值(OD),并计算RNA 的含量和纯度。
1、实验目的
提取人体细胞的总RNA和mRNA。
2、本实验所需试剂
1)、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件,
2)、PBS缓冲液,TRIZOL试剂,
3)、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管,
4)、新的氯仿、异丙醇和乙醇,
诘问式5)、mRNA分离试剂盒:Oligotex mRNA Mini :70022, QIAGEN。
6)、新配的电泳缓冲液,专跑RNA的琼脂糖(Agarose)。
3、实验流程
3.1 细胞总RNA的提取
1)、6孔板细胞(CNE-2)汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂(Gibco公司)1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5分钟(观察:液体变粘稠,细胞脱壁)。
2)、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml EP管中,加新开的氯仿0.2 ml,轻摇15秒。
3)、室温静置2-3分钟后,12000 rpm,15 min,4℃,离心。然后取上清无水相(约0.6 ml)到EP管(DEPC处理过),加0.5 ml新开的异丙醇,室温下静置10分钟。
4)、12000 rpm,10分钟,4℃,离心。观察总RNA在管底的白沉淀,弃去上清(小心别丢了沉淀),75%乙醇1.0 ml洗涤(用DEPC水新配制)后,7500 rpm,5 min,4℃离心。5)、去上清,点离,用小Tip吸干液体。气干沉淀5-10分钟,DEPC处理水20-30 ul加入,中打匀,55-60℃水浴10分钟溶解总RNA,测OD值。
6)、电泳。
大丰市实验小学3.2 从总RNA中分离mRNA(Oligotex mRNA Mini :70022, QIAGEN)
1)、取上述提取的总RNA若干(少于0.25 mg)到一个新的无RNase 的EP管中,用无RNase的水定容到250 ul。
2)、加入Buffer OBB 250 ul, Oligotex Suspension 15 ul。用Tip打匀或用手弹匀。
3)、70℃水浴,3分钟(裂解RNA的二级结构)。
4)、20-30℃条件下,静置10分钟(让Oligotex与mRNA结合)。
5)、高速离心2分钟,小心吸走上清(该上清要保留),留下约50 ul的上清在原管里。6)
、用Buffer OW2 400 ul重悬含Oligotex/mRNA复合物的沉淀,然后将这些加到套有1.5 ml EP管的SPIN柱子上,高速离心1分钟。
罗恩老师的奇迹教育7)、将SPIN柱子移到一个新的EP管上,加Buffer OW2 400 ul到柱子,高速离心1分钟,丢掉滤过液。
解放军理工大学气象学院8)、将SPIN柱子移到一个新的EP管上,加20-100 ul热的(70℃)Buffer OEB到柱子上,用Tip来回吸打3-4次,高速离心1分钟。
9)、为保证最大的mRNA产量,可再次重复第8步。
10)、电泳。
4、mRNA的应用:
RT-PCR, Northern杂交,cDNA文库构建, mRNA末端快速扩增(RACE),差异表达(DDRT-PCR),引物延伸反应(Primer Extension),体外转录(In Vitro RNA Transcription), RNA 标记(RNA labeling),RNA酶保护试验(RNase and S1 Nuclease Protection Assay),RNA微注射(RNA Microinjection)

本文发布于:2024-09-21 15:21:12,感谢您对本站的认可!

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