原核表达重组质粒pBBR1-MCS-EGFP的构建 (实验方案)
1、实验材料
质粒和菌株:真核表达质粒pEGFP-N1,原核表达质粒pBBR1-MCS,宿主菌E.coil S17-1。
主要试剂:限制性内切酶BamH I、Kpn I;T4 DNA连接酶;DNA Marker(2000,10000);DNA胶回收试剂盒;质粒小提试剂盒;DNA纯化试剂盒;PCR用试剂;链霉素(E.coil S17-1抗性);卡那霉素(pEGFP-N1抗性);LB培养基等。 二、实验步骤
1、pEGFP-N1质粒的提取
(1)含pEGFP-N1的重组菌(pEGFP-N1/DH5α)的复苏
将冻存的重组菌接种LB培养液,37℃,160rpm振荡培养过夜。用接种环挑取少许菌液划线
接种LB+Km平板上(100mL LB培养基高压冷却至不烫脸,加入50mg/mL的卡那霉素储存液100μL ),37℃培养24小时观察细菌生长状况,然后再进行传代。
(2)挑取单个菌落接种LB+Km液体培养基,37℃振荡培养过夜。用质粒提取试剂盒提取pEGFP-N1质粒,0.8%琼脂糖电泳(10kb Marker)检测提取效果。 2、引物设计与合成
根据EGFP基因序列并参考pEGFP-N1载体序列和pBBR1-MCS多克隆位点信息,设计一对特异性引物F1、R1,用来克隆EGFP基因编码区,如下所示:
F1:5,-CGGGGTACCGATGGTGAGCAAGGGCGAG-3,
(Kpn I酶切位点序列及其保护性碱基)
R1:5,-CGCGGATCCATTCTTGTACAGCTCGTCCAT-3,
(BamH I酶切位点序列及保护性碱基)
引物送由生物公司合成
3、目的基因EGFP的PCR扩增与产物回收
以含EGFP基因的质粒为模板,用特异性引物F1、R1扩增EGFP基因。25μL PCR扩增反应体系:12.5μL 2×Taq PCR MasterMix;2μL模板(质粒);20μmol/L上下游引物各0.5μL;9.5μLddH2O。扩增反应条件为:95℃5min;94℃30s,63℃30s,72℃30s,35个循环;72℃10min;4℃终止反应。(条件需摸索)。 取5μL PCR产物,用1%琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统拍照。
PCR扩增产物经1%琼脂糖凝胶电泳后,用胶回收试剂盒回收EGFP目的基因。
4、大肠杆菌S17-1感受态细胞的制备
(1)将摇菌过夜的种子液3mL加入到100mL LB(无NaCL)液体培养基中转摇4.5h。
(2)冰浴40min。
(3)分装到2个50mL 离心管,12000r/min,离心10min。
(4)分别用 0.1mol/L 职业化意识CaCl2 10mL香茅醇重悬,12000r/min,离心10min伊斯兰之声。
(5)重复步骤(4)3次。
(6)分别加入 0.2mol/L CaCl2 300μL,50%甘油 300μL 混匀。
(7)每管100μL 分装EP管中,-80℃保存。
5、目的基因EGFP和pBBR1-MCS表达载体的双酶切
双酶切体系为:
EGFP的回收产物或pBBR1-MCS 10μL
10×Buffer K 5μL
Kpn I 1.5μL
BamH I 1μL
ddH2O 82.5μL
合计 100μL
37℃水浴office20026h,经1%琼脂糖凝胶电泳检测(单一条带,应分别与目的基因EGFP和pBBR1-MCS 质粒片段大小差不多)后,DNA纯化试剂盒纯化回收酶切产物,电泳检测回收效果。
6、原核表达重组质粒pBBR1-MCS-EGFP的构建
(1)将上述回收纯化的EGFP和pBBR1-MCS质粒利用T4 DNA连接酶连接。
20μL酶连体系:10×T4 Buffer 2μL
T4 连接酶 0.5μL
EGFP片段 10降膜吸收塔μL
pBBR1-MCS质粒片段 5μL
ddH2O 2.5μL
点动混匀16℃连接过夜。
(2)连接产物转化大肠杆菌S17-1感受态细胞
(10μL加入100μL感受态细胞中(加两管,第三管不加 作空白对照),冰中放置30min;42℃水浴45s,再在冰中放1min.向三管均加入890μLLB液体培养基,37℃振荡培养60min,混匀;将1、2管各涂布于一块LB+SM+KM平板上。第三管平均涂布LB和LB+SM+KM平板上。培养过夜鉴定,空白的LB+SM+KM应不长菌,其余3块均长菌。),37℃振荡培养1h,均匀涂布LB+Sm(50ug/mL)+pBBR1-MCS载体抗性(待定)平板,37℃过夜培养。 7、重组表达质粒的鉴定
(1)荧光鉴定:将过夜培养的平板至4℃冰箱1-2天后,在自然光下即可肉眼观察到绿菌落并拍照。
挑取转化平板上的单个菌落,接入LB+Sm(50ug/mL)+pBBR1-MCS载体抗性(待定)液体管,37℃摇菌过夜。取2μL菌液滴在载玻片并盖好盖玻片后,置于荧光显微镜下观察菌
液的产荧光情况并拍照。
(2)质粒PCR鉴定:以质粒pBBR1-MCS-EGFP为模板,利用EGFP特异性引物进行PCR扩增。
25μL PCR扩增反应体系:依次添加9.5μLddH2O;20μmol/L上下游引物各0.5μL;2μL模板(质粒);12.5μL 2×Taq PCR MasterMix。扩增反应条件为:95℃5min;94℃30s,63℃30s,72℃30s,35个循环;72℃10min;4℃终止反应。(条件需摸索)。取5μL PCR产物,用1%琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统拍照。
(3)双酶切鉴定:
依次加入82.5 μL ddH2O ,5μL10×仿明清家具Buffer K,10μL pBBR1-MCS-EGFP , Kpn I 1.5μL,BamH I 1μL至0.5mL EP管。点动混匀。37℃水浴6h,经1%琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶成像系统拍照。
(4)测序鉴定:将经酶切和质粒PCR鉴定为阳性的重组质粒进行测序鉴定。
三、需要购买:
限制性内切酶BamH I、Kpn I(待定)。