【doc】计算机在毒理学研究中的应用

计算机在毒理学研究中的应用2一,
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序列同源性,因而它被称为5一HT.5
HT1E和5HT1受体大约只有60%的同源性,
它们在脑内的表达不同,与配体结合特性也有
显着差别,所以用5-HT.达名称似乎更为恰
早熟禾属当.人的5一HT】F受体类似物现在已被克隆.
5一HT2受体及其亚型满足如下全部新的
特征判据;严密的序列同源性,存在类似的外
显子/内含子基因模式,相同的转导系统和类
似的功能作用.现在已知道至少有三种5-HT,
受体亚型,其名称为1992年9月在美国休斯
敦举行的5一HT协会受体命名委员会会议
(SCRNCM)所接受.5-HT^受体亚型指经
典的5一HT2受体.几年前,5一HTR受体亚
型被描述为能介导5一HT的收缩作用,最近
5一HT2日受体已被克隆.5-HT2c受体相当于
过去的5一HT.c受体,这种名称转变很少会混
淆,但为避免将来造成混乱,建议5一HT.这
名称不再使用.
5一HT受体自成一族,它们属于配体门
控离子通逋受体类,这已从电生理研究中作出
推断井被克隆研究所证实.研究表明,从小鼠
的NCB20细胞克隆的受体亚基与乙酰胆碱烟
碱受体一亚基族有显着的同源性,在表达
国外医学药学分册
征.如果其它亚基能被确定,那么,就能象烟
碱受体那样,用希腊字母下标表示不同的亚基
(如,5一HT是最先被克隆的一亚基).至
夸还没有关于5一HL受体结构信息的报道.iis
但至少有两个理由认为,这种受体组成了另外
族与G蛋白偶连的5一HT受体族.首先,
5一HTd受体的功能特征有别干5一HT.和
5一HT2受体;其次,5一HTd受体(不同干
5一HT.受体)确实连接到腺苷酰环化酶上.
虽然没有令人信服的证据证明5一HL受体亚
型的存在,但已开始得到有效和选择性拮抗剂
(和放射性配体).
根据受体特征的新分类方法认为至少有四
组5一HT受体}前两组都有受体亚型,但仅
根据经典的药理学不易进行分类.希望以上提
出的受体特征一体化判据(功能,结构和转
导)是一种较健垒的方法,它不仅适用于
5一HT受体,也适用于其它中枢神经递质的分
类.根据新的分类方法,仍有一些孤立的
5-HT受体存在,这可能由于目前掌握的知识
所限.相信不远的将来,孤立受体的数目将不
断减少,而名称表也会不断发生变化.
[Tren出Pharma~ol&1993.14(6】:233~336
译夏叔泉校]
机预测化合物致癌性的准确率为49%~59%.而专家的预测准确率为65%~84%.
这个试验中可H得出结论,即对那些明显具有或不具有致癌性的化舍物,计算机和专家
都能很好地判断.一旦化舍物的致癌显着性下降,则人和计算机郝处于不利地位,但人
能峙更有效地做琏进工作因为研究在墟续,计算机程序将开发出更好的学习包,操作
也将越来越改进.计算机预测毒性能选到85%的正确性.如此的经济,保证7计算机在当代毒理学研究中的地位.
关键词计算机管理j毒理学
l毒理学数据的计算机管理
近-一个世纪以来,人们已经获得了大量的
77/
毒理学数据.在美国,国立职业安垒与健康研
究所(NIOSH)汇总了70年代以来有关毒性
994年第2I卷第4期
数据的科学文献.化学物质毒性登记处
(RTEcs)在1993年初已收集了l19000种
化学物质的毒性数据106000个,及致癌,致
畸,致突变等试验结果30000个.该数据库
于1978年首次提供长途电话查询服务,井与
大多数主要的商业共享系统联网.数据库的检
索非常方便,可根据化学物质的名称或CA登洪江市实验中学
录号进行检索.在化学情报系统和科技网络
smw工法桩
中,还可根据化学结构或亚结构进行检索.
摇滚狂潮
RTECS同时提供所有数据的文献来源.
由国立医学图书馆管理的TOXLINE数
据库,汇集毒理学各个领域的论文摘要.迄
夸,该数据库已收集了1980年以来的
ll2l479篇文摘,l965~1980年间的707236
篇文摘亦在收载中.这些数据库差不多涉及了毒理学的所有基本文献,已成为研究毒理学的日常工具.某些虽然应用面较窄,但与毒理学
有关的新数据库也值得一提.如有关重金属和外源性有机物在植物中残留量的一个数据库, 收集了在350多种植物中,发现的900种有机物和21种重金属残留量的37000项数据.这
些教据取白1926年以来发表的论文,在另外
个稍微不同的领域内,两个研究团体各自建
立了代谢过程的数据库.Sandoz研究院建立
的数据库,将代谢途径当作一组相关的反应,
包含400种物质的原型数据库以及它们的代谢转化和分解转化.该数据库的优点在于不仅包含了化合物本身,而且还包含了它们的生化性质.另一个由Kan~s州立大学建立的数据库
也是原型的,并使用商业数据库管理系统以便查对.
2数据的计算机传递——计算机用于新
药申请
符台FDA要求的新药申请可能包含长达100000页的数据,其中多数为毒理学数据.
这些数据大部分虽然由FDA和制药公司各自用计算机进行处理,但数据的传递仍用硬拷贝.自从5年前FDA提出数据的计算机传递
235?
目标以来,该领域的研究非常活跃.许多发达
国家,如加拿大和德国,也与美国一样,为了abs223
提高效率,试图使用计算机辅助数据传递.尚
存在的问题包括如何管理图表和数据,如何建立标准化软件和如何使以不同形式提供的资料具有法律效力尽管这些问题中的任何一个都可能是不易对付的,但减少重阅时间所带来的潜在经济效益势必促进这些系统不断发展.
3定量构效关系研究
定量构效关系(QSAR)研究的目的在于
从一组已知生物活性的化合物,建立活性与结构之间的数学关系式.典型的做法是,先设定
个结构与活性的相关方程,然后用回归方法
隶得方程中的待定系数.最近十多年来,此类
软件发展迅速.如Enslein等建立了"计算机
辅助毒性预测"程序(TOPKAT),K~pman
和Roscnkranz建立了"计算机自动结构评估" 程序(cASE),以及Juts等建立了"模式识别
技术用于数据自动分析"程序(ADAFT).
3.1ToPKAT
TOPKA T使用一个含有化合物的结构和
毒性的知识数据库,建立结构碎片和结构参数与毒性的OsAR模型.
化台物的化学结构以简便输入法输入程
序.在该方法中,以简单的线状字符串表示结构.如ClCCl(=O)0表示环丙酸;
C1CCCCC1C(=o)o表示苯甲酸.知识数据库
装入后,将在化合物的化学结梅基础上产生描

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标签:受体   结构   数据库   研究   数据
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