选择性识别平行性G-四联体的方酸类近红外荧光探针的研究

第30卷第2期化㊀学㊀研㊀究Vol.30㊀No.22019年3月
CHEMICAL㊀RESEARCH
Mar.2019
选择性识别平行性G⁃四联体的方酸类近红外荧光探针的研究
王雅萱,宋㊀慧,罗金荣,李㊀玮,张玲玲,魏涌标∗
(广西医科大学药学院,广西南宁530021)
收稿日期:2018-08-15.
基金项目:国家自然科学基金(81760620),广西省自然科学基金项
目(2016GXNSFAA380208)和省部共建药用资源化学与药物分子工程国家重点实验室资助课题(CMEMR2017⁃
B13).
作者简介:王雅萱(1994-),女,硕士研究生,研究方向为药物化学.
通讯联系人,E⁃mail:ybwei2008@126.com,yong⁃ye@
163.com.
摘㊀要:G⁃四联体是抗肿瘤药物筛选的一个重要靶点.开发针对某些拓扑结构的G⁃四联体荧光探针对于研究其结构和生物学功能具有十分重要的意义.设计㊁合成了四个方酸类花菁荧光染料即CSTS,CSBE,CSEM和CSBM,并检测了其对不同类型DNA的选择性识别作用.结果表明,所合成的四个化合物在缓冲溶液中几乎没有荧光发射,加入正平行G⁃四联体之后荧光增强大约1000倍;而加入反平行G⁃四链体或单双链DNA荧光仅仅增强几十倍,说明其可以特异性识别平行G⁃四联体.但流式实验结果显示,CSTS不能透过细胞膜,同时存在高荧光背景的缺点,因此无法应用于活体分析.而另外三个不带阴离子侧链的衍生物则容易进入细胞,进入细胞的难易顺序为CSBE>CSEM>CSBM>CSTS.高选择性㊁低背景荧光和易进入细胞等优点使CSBE具有作为近红外荧光探针检测生物样品中正平行G⁃四联体的潜力.
关键词:方酸衍生物;近红外;荧光探针;G⁃四联体;细胞摄入中图分类号:O644.1
文献标志码:A
文章编号:1008-1011(2019)02-0132-08
SelectiverecognizingparallelG⁃quadruplexsquaraine
near⁃infraredfluorescentprobes
WANGYaxun SONGHui LUOJinrong LiWei ZhangLingling WEIYongbiao∗
SchoolofPharmaceuticalSciences GuangxiMedicalUniversity Nanning530021 Guangxi China
Abstract G-quadruplexisanimportanttargetofanti-tumorgrug.ThedevelopmentofG⁃quadruplexfluorescentprobesforcertaintopologicalstructuresisofgreatsignificanceforstudyingtheirstructureandbiologicalfunctions.Inthispaper,foursquarainecyaninefluorescentdyes,namelyCSTS,CSBE,
CSEMandCSBM,weredesignedandsynthesized.Theirstructuresweredeterminatedby1HNMRandMS.Littlefluorescenceemissionwasfoundinthebuffersolutioncontainingoneoffoursquarainecyaninefluorescentdyes.However,thefluorescenceemissionwasenhancedapproximately
1000⁃foldafteraddinganormalparallelG⁃quadruplexandonlyenhancedseveraltensoftimeswiththeanti⁃parallelG⁃quadruplexfluorescenceorsingle⁃strandedDNA.TheresultsindicatedthatsquarainecyaninefluorescentdyeshavetheabilitytoselectivelyrecognizeofparallelG⁃quadruplex.FlowcytometryexperimentsshowedthattheCSTScouldnotinvadethecellsandhadthedisadvantagesofhighfluorescencebackgroundwhichcouldnotbeappliedtomlecularpobesforbologicalimaging.Theotherthreeder
ivativeswithoutananionicsidechainareeasilyaccessibletocells.Theorderof
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㊀difficultyinenteringcellsisfollowingas:CSBE>CSEM>CSBM>CSTS.Duetothehighselectivity,lowfluorescencebackgroundandeasy⁃to⁃accesscells,CSBEhavethepotentialasanear⁃infraredfluorescentprobetodetectthepositiveparallelG⁃quadruplexinbiologicalsamples.
Keywords:squaraines;nearinfrared;fluorescentprobe;G⁃quadruplex;cellularuptake
㊀㊀肿瘤是严重威胁人类生命和健康的常见病和多发病,是仅次于心脑血管疾病的人类的第二大死因.与肿瘤发生㊁发展密切相关的药物靶点 G⁃四联体受到越来越密切的关注.大量研究发现,可形成G⁃四联体的序列在人基因组中广泛存在,如染体端粒的末端以及一些重要的癌基因启动区,包括c⁃myc㊁c⁃myb㊁bcl⁃2㊁Rb㊁PDGF㊁c⁃kit㊁kRAS㊁VEGF㊁HER2/
neu㊁RET等[1].更重要的是,最近,研究人员在人细胞中首次观察到了DNA和RNAG⁃四联体,证明了G⁃四联体确实在体内存在[2,3].然而,这一领域的研究还处于早期阶段,大多数G⁃四联体的结构和功能还不清楚[4].所以,研究和开发新型的可以识别某一类结构的G⁃四联体的有机小分子,对于基础研究㊁诊断以及都具有十分重要的意义.
乐益民研究人员在设计㊁合成新型的G⁃四联体特异性
配体方面[5-8]和光学探针方面都付出了很大的努力[9-11].大多数G⁃四联体配体具有平面芳香骨架结构,可以通过π⁃π堆积的方式与G⁃四联体结合,这
些分子通常具有较强的紫外或荧光信号响应,所以
其中一些配体被开发成G⁃四联体特异性探针.然
而,在现有报道的G⁃四联体配体中,很少对G⁃四联
体具有很好的选择性,并且具有选择性的配体又很
少具有良好的光学信号响应[12-13].最近,长波长(近红外)荧光探针由于其对生物样品低的光损伤㊁
好的组织穿透力以及最小的生物大分子背景荧光干
扰[14],其在检测㊁标记㊁诊断和分析中都具有十分重
要的应用.
图1㊀CSBE,CSME,CSBM及CSTS的结构式
Fig.1㊀StructureofCSBE,CSME,CSBMandCSTS
㊀㊀方酸染料是一类在近红外区具有尖锐和强烈的
紫外吸收以及荧光发射,并且具有良好的光稳定
性[15-18]的花菁类染料,由中间四原子组成的缺电子
环状核心和富电子的芳香杂环部分组成[19].由于优
良的光学特性,方酸菁染料被广泛的应用于光电导
体㊁光数据存储㊁光电装[20-21]㊁生物活体显像[22]㊁光
动力[23-25]和生物荧光探针[10,26-27]等研究领域,
但却很少见方酸染料被用于核酸的光学探针.最近
我们设计㊁合成了方酸衍生物CSBE,CSEM,CSBM
和CSTS(图1),紫外光谱㊁荧光光谱分析发现所有
化合物在690nm处有吸收,710nm处有荧光发射,
处于近红外区.并研究了它们与G⁃四联体DNA的相
互作用,发现其特异性识别平行G⁃四联体的化合
物.流式实验发现CSTS难以进入活细胞,而新设计
合成的三个衍生物则容易进入细胞CSBE>CSME>
CSBM>CSTS,其中CSBE最容易进入细胞.
1㊀实验部分
1.1㊀仪器与试剂
方酸二乙酯㊁丙二腈㊁2⁃甲基⁃1,3⁃苯并噻唑及4⁃
溴丁酸甲酯购自百灵威公司.其他的常用溶剂以及
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化学试剂购买后未经纯化直接使用.CSTS,CSBE,CSME和CSBM溶解在DMSO中作为储备液备用,浓度为10mol/L.人血清白蛋白(HSA)购自MPBiomedicals公司,采用称重的方法溶解在0.1mol/L
PBS缓冲溶液中配制成100μmol/L母液.所有溶液使用UPHW⁃III⁃90TUP水净化系统(中国成都)制备的去离子水配置.
HNMR和13CNMR使用Bruker400MHzNMR核磁共振仪,以TMS为作为内标;ESI-MS使用岛津公司的LC-MS2010A型质谱仪;紫外光谱使用岛津公司UV-1800型紫外分光光度计记录,使用10mm光程比皿;荧光光谱使用日立公司F-4600型荧光仪记录,激发和发射狭缝宽度为5nm.
1.2㊀实验步骤
分别以方酸二乙酯㊁2⁃甲基⁃1,3⁃苯并噻唑为起
始原料合成得到中间体1
和2,然后中间体1和2在甲苯与正丁醇的混合溶剂中进一步脱水缩合合成目标化合物(图2).
图2㊀CSBE,CSME,CSBM和CSTS的合成Fig.2㊀SyntheticrouteofCSBE,CSME,CSBMandCSTS
1.2.1㊀三乙基铵3⁃(二氰基亚甲基)⁃2⁃乙氧基⁃4⁃氧代环丁⁃1⁃烯醇(化合物1)的合成
将340mg(2mmol)方酸二乙酯溶解在9mL的
无水苯中并不断搅拌,加入132mg(2mmol)丙二腈后5min内逐滴加入0.26mL三乙胺.乳浊液在室温下搅拌30min后旋转蒸发掉溶剂,粗产品用硅胶柱谱纯化,乙酸乙酯ʒ甲醇=10ʒ1体积比作为淋洗剂,得到500mg的产品,产率86%.1
HNMR(400
MHz,MeOD)δ4.73(q,J=7.1Hz,2H),3.24(q,J=7.3Hz,5H),1.46(t,J=7.1Hz,3H),1.33(t,J=7.3Hz,8H).聚四氟乙
1.2.2㊀3⁃(4⁃甲氧基⁃4⁃氧代丁基)⁃2⁃甲基苯并[d]噻唑⁃3⁃鎓(化合物1)的合成
2⁃甲基⁃1,3⁃苯并噻唑(1.0g,6.7mmol)与4⁃溴
有机食品商城
丁酸甲酯(6.7mmol)混合后120ħ加热5h;反应完毕后加入大量石油醚,过滤沉淀得到最终产品
1.1g,产率61%.
1.2.3㊀合成CSBE,CSME和CSBM的通法
以体积比甲苯ʒ正丁醇ʒ喹啉=5ʒ5ʒ1为溶剂,542mg(2mmol)化合物2和化合物1(丙二腈取代的方酸衍生物,291mg,1mmol)在配有分水器的装置中反应8h.冷却至室温后,反应体系加入到过量的乙醚中,离心的办法分离出沉淀,以二氯甲烷ʒ甲醇=4ʒ1作为淋洗剂,硅胶柱谱分离得到粗产品.粗产品使用高效液相谱分离,以0.1mmol/L的醋酸三乙胺/甲醇做淋洗剂梯度洗脱.
1.3㊀吸收光谱
所有的紫外吸收光谱使用SpectraMaxM5型酶
标仪测量,用10mm光程石英比皿.10mol/L化合物与60mol/L不同种类的DNA混合,终体积为
400L,室温静置30min后测量吸收光谱.1.4㊀荧光滴定
荧光光谱使用日立F⁃4600型荧光谱仪测定,激
发光和发射光的狭缝宽度均为5nm,电压为800V,扫描速度120nm㊃min-1.化合物
与不同种DNA的荧光滴定实验在Tris⁃HCl缓冲溶液中进行.1mol/l化合物与不同浓度的DNA(0.2,0.4,0.6,0.8,1.0,
1.2,1.6,2.0,2.5,3.0,4.0和5.0mol/L)混合,室温静置30min后进行荧光光谱的测量.荧光滴定曲线使用独立结合位点模式的非线性拟合方程(1)进行拟合,其中F0为化合物分子没有DNA存在时的荧光强度,Fmax为荧光滴定饱和时候的荧光强度.A=(KaCdye)-1,x=nCDNA(Cbye-1),n为所滴定的DNA上假定的结合位点数.参数Q和A通过Origin8.5软件中LevenberG⁃Marquardt拟合程序算出,改变n的数值使数据得到最好的拟合,即R2最大.
F/F0=1+Q-1
2A+1+x-(A+1+x)2-4x[]次氯酸钠
(1)
1.5㊀细胞培养
Lovo细胞购自中国医学科学院基础医学研究
所细胞资源中心.细胞均在细胞培养基DMEM(Hy⁃
clone)含10%胎牛血清(FBS,Gibco)和1%青链霉素孵育.细胞在培养箱中37ħ,5%CO2条件下常规培养.
1.6㊀细胞膜通透性考察将Lovo细胞接种到12孔板中孵育24 48h.然
后加入10mol/L的CSTS,CSBE,CSME或CSBM,分别孵育15㊁30和45min.孵育完后,用PBS
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㊀洗三遍,用PBS溶液悬浮细胞,然后流式分析.上样前细胞悬浮液经过100μm的细胞过滤网过滤.
2㊀结果与讨论
2.1㊀化合物在水中的聚集
方酸类花菁染料自聚集在许多论文中报道了[28-30],大多数菁染料通过范德华力和π-π堆积相互作用在水溶液中自聚集,其在溶液中的自聚集行为受到染料的结构特征㊁温度㊁溶剂极性以及离子强度等的影响.菁染料在醇溶液或浓度很低的水溶液中主要以单体形式存在[31],此时吸收光谱中的特征峰归属为单体的吸收峰.而在水溶液中,
随着菁染料浓度的增加,可能在单体吸收峰短波长方向出现较宽的吸收峰(H⁃band),或在其长波长方向出现强烈而尖锐,有共振荧光的吸收峰(J⁃band).H⁃band和J⁃band分别归属于菁染料形成的两种不同结构的聚集体  H⁃聚集体与J⁃聚集体.J⁃聚集体表现出红移吸收和有效荧光发射(与单体相比),H⁃聚集体显示蓝移吸收和不良发射[32-33]
CSBE㊁CSME和CSBM在DMSO溶液中分别在
690nm左右出现了尖锐的强吸收峰,说明他们在DMSO中是以单体的形式存在的.在水中,他们具有一个在610nm左右的吸收峰以及在650 700nm范围内的肩峰,较短波长处的吸收峰被认为是染料形成H⁃聚集态的吸收峰,而在650 700nm范围内的肩峰被认为是染料单体的吸收峰[34].这些结果说明这些染料在水与DMSO的混合溶剂中
主要以H⁃聚集体和单体两种形式存在.前期研究表明增加水的量会导致CSTSH⁃聚集体和单体的吸收峰均出现减弱,说明CSTS分子可能从二聚体向更高级的聚集形态转变.CSBE㊁CSME和CSBM在DMSO中都具有很强的荧光发射;而在水中,几乎没有荧光发射(图3),说明聚集导致了
荧光猝灭.这些结果说明这三个方酸衍生物由于具有刚性的π平面骨架结构,在强极性溶液中具有强烈的形成H⁃聚集体的倾向.
图3㊀在DMSO和水的混合溶剂中,CSBE,CSME和CSBM(10μmol/L)的聚集实验,λex=670nm.(a)吸收光谱;(b)荧光光谱
Fig.3㊀Absorption(a)andfluorescencespectra(b)ofCSBE,CSMEandCSBM(10μmol/L)
inmixedsolventofDMSOandwater,excitationat670nm.
2.2㊀在不同DNA存在下的紫外可见光谱及荧光光谱
将6倍物质的量浓度的DNA加入到溶液中,化合
物CSBE,CSME,CSBM及CSTS的吸收峰都出现了增强,说明其与DNA间发生相互作用.加入不同类型的DNA后化合物分子的吸收光谱的变化不同.加入正平
行结构G⁃四联体时,发生明显的红移或产生新的吸收峰(图4);然而,反平行结构G⁃四联体㊁ssDNA和dsD⁃NA引起了吸收光谱的变化小的多,说明所用化合物与正平行结构G⁃四联体DNA的作用强于其他形式的DNA.
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㊀化㊀学㊀研㊀究2019年
图4㊀CSBE,CSME,CSBM及CSTS(10μmol/L)与平行(a)及反平行(b)DNA(50μmol/L)作用后的吸收光谱,
其中点状线表示的是不存在DNA的情况下化合物的吸收
Fig.4㊀AbsorptionspectraofCSBE,CSME,CSBM,andCSTS(10μmol/L)withparallel(a)andantiparallel
(b)DNA(50μmol/L),wherethedottedlinesindicatethecompoundintheabsenceofDNA
㊀㊀我们进一步测量了化合物的荧光激发光谱和发射光谱(图5).当在660nm激发时,没有DNA存在下,化合物几乎没有荧光;在22AG(Na+)㊁ss/ds⁃DNA和TBA
(反平行
G⁃四联体)的存在下,只观察到非常弱的荧光;而正平行G⁃四联体与化合物作用后出现了非常强的荧光.
图5㊀CSBE,CSME,CSBM及CSTS(1μmol/L)与不同种类DNA(6μmol/L)作用后的激发光谱(a)及发射光谱
家俬
(b).其中激发光谱中发射波长为λem=710nm,发射光谱的激发波长为λex=660nm
Fig.5㊀Excitationspectra(a)andemissionspectra(b)ofCSBE,CSME,CSBMandCSTS(1μmol/L)afterinteractionwithdifferent
kindsofDNA(6μmol/L).Theemissionwavelengthintheexcitationspectrum
isλem=710nm.Theexcitationwavelengthisλex=660nm
㊀㊀紫外光谱表明平行结构G⁃四联体发生明显的红移或产生新的吸收峰;然而,反平行结构G⁃四联体㊁ssDNA和dsDNA引起了吸收光谱的变化小的多.螺旋桨式平行结构G⁃四联体引起了非常强的荧光增强.反平行结构的G⁃四联体引起了很弱的荧光增强,ss/dsDNA只引起很弱的荧光增强.这些结果
说明所合成的化合物对G⁃四联体具有很好的选择性识别.
为了研究不同种类DNA与化合物的荧光响应,我们进行了荧光滴定实验,采用independe
nt⁃sitemodel(公式1)对滴定曲线拟和.各化合物的Ka值均在104
105数量级,比CSTS的Ka值相当[34](表1).

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