蛋白质采用酚提取法。两克植物组织在液氮下磨成粉末,并且在冰浴中与6ml 冰冻提取buffer(250mM蔗糖,20mM Tris-HCl ph 7.5,10mM EGTA,1m黎强案
M PMSF,1mM DTT)摇匀10分钟。加入等量的冰冻Tris-HCl(PH7.5)苯酚的饱和溶液,混合液在冰浴中摇匀10min。离心(20min,15,000g ,4℃),提取酚相溶液重复两次。蛋白质用三倍于酚相体积的含有100mM醋酸铵的甲醇溶液中过夜(-2橡皮婚姻
0℃)。沉淀的固体用冰冻的含有13mM的DTT丙酮溶液洗涤三次,然后低压冻干。 把蛋白斑从凝胶上手动切下,凝胶内消化采用胰蛋白酶,步骤如下:切下的胶条在25%(v/v)酒精洗涤,并且在7%(v/v)的醋酸中过夜(室温),然后胶条用含有50mM NHHCO3的50%(v/v)甲醇溶液褪1h(40染料激光℃).蛋白用含10mM DTT的100mM NHHCO3 溶液中还原1h(60℃戒毒),并且在黑暗中用含有40mM 乙酰胺的100mM NHHCO3 乙酰化30min(室温)。把凝胶切碎,冻干,然后在浸泡在还有10ng 测序级的改胰蛋白酶的25mM NHHCO3溶液中过夜(37℃)。经过消化,收集多肽。固体小球用0.1%TFA的50%(v/v)的乙腈溶液洗涤三次以收集剩余的多肽。提取液中的多肽用ZipTipC 18P™.去除盐分。
液相谱检测用surveyor LC system 进行。C18从Column Technology 购得。流动A相由0.1%的蚁酸水溶液,流动相B则由0.1%的蚁酸乙腈溶液。胰蛋白酶肽混合物用流动相B 2-98%的浓度梯度提取180min。串联质谱检测用配备了电喷雾接口并且在阳离子模式下运行的LTQ线性离子阱回旋组合质谱仪。毛细管的温度设定为170℃,喷射电压设定为3.4kv中国海军护航11年。得到的图谱用Bio-Works 3.1 software suite 的TurboSEQUEST program在NCBI的蛋白数据库中搜索写复位信号。如果没有可信的候选匹配就搜索十字花科的拟南芥蛋白数据库。湿度