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NEB公司提供的保护碱基序列表

NEB公司提供的保护碱基序列表：
铁锰结核
Enzyme
Oligo Sequence
Chain 
Length
% Cleavage
2 hr
20 hr
AccI
GGTCGACC 
CGGTCGACCG 
CCGGTCGACCGG
8 
10 
12
0 
0 
0
0 
0 
0
AflIII
CACATGTG 
CCACATGTGG 
CCCACATGTGGG
8 
10 
12
0 
>90 
>90
0 
>90 
>90
AscI
GGCGCGCC 
AGGCGCGCCT 
TTGGCGCGCCAA
8 
10 
12
>90 
>90 
>90
>90 
>90 
>90
AvaI
CCCCGGGG 
CCCCCGGGGG 
TCCCCCGGGGGA
8 
10 
12
50 
>90 
>90
>90 
>90 
>90
BamHI
CGGATCCG 
CGGGATCCCG 
CGCGGATCCGCG
8 
10 
12
10 
>90 
>90
25 
>90 
>90
BglII
CAGATCTG 
GAAGATCTTC 
GGAAGATCTTCC
8 船舶
10 
12
0 
75 
25
0 
>90 
>90
BssHII
GGCGCGCC 
AGGCGCGCCT 
TTGGCGCGCCAA
8 
10 
12
0 
0 
50
0 
0 
>90
BstEII
GGGT(A/T)ACCC
9
0
10
BstXI
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA 
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
22 
24 
27
0 
25 
25
0 
50 
>90
ClaI
CATCGATG 
GATCGATC 
CCATCGATGG 
CCCATCGATGGG
8 
8 
10 
12
0 
0 
>90 
50
0 
0 
>90 
50
Enzyme
Oligo Sequence
Chain 
Length
% Cleavage
2 hr
20 hr
EcoRI
GGAATTCC 
CGGAATTCCG 
CCGGAATTCCGG
8 
10 
12
>90 
>90 
>90
>90 
>90 
>90
HaeIII
GGGGCCCC 
AGCGGCCGCT 
TTGCGGCCGCAA
8 
10 
12
>90 
>90 
>90
>90 
>90 
>90
HindIII
CAAGCTTG 
CCAAGCTTGG 
CCCAAGCTTGGG
8 
10 
12
0 
0 
10
0 
0 
75
KpnI
GGGTACCC 
GGGGTACCCC 
CGGGGTACCCCG
8 
10 
12
0 
>90 
>90
0 
>90 
>90
MluI
GACGCGTC 
CGACGCGTCG
8 
10
0 
25
0 
50
NcoI
CCCATGGG 
CATGCCATGGCATG
8 
14
0 
50
0 
75
NdeI
CCATATGG 
CCCATATGGG 
CGCCATATGGCG 
GGGTTTCATATGAAACCC 
GGAATTCCATATGGAATTCC 
GGGAATTCCATATGGAATTCCC
8 
10 
12 
18 
20 
22
0 
0 
0 
0 
75 
75
0 
0 
0 
0 
>90 
>90
NheI
GGCTAGCC 
CGGCTAGCCG 
CTAGCTAGCTAG
8 
10 
12
0 
10 
10
0 
25 
50
NotI
TTGCGGCCGCAA 
ATTTGCGGCCGCTTTA 
AAATATGCGGCCGCTATAAA 
ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT 
AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
12 
16 
20 
24 
28
0 
10 
10 
25 
25
0 
10 
10 
90 
>90
Enzyme
Oligo Sequence
Chain 
Length
% Cleavage
2 hr
20 hr
NsiI
TGCATGCATGCA 
CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
12 
22
10 
>90
>90 
>90
PacI
TTAATTAA 
GTTAATTAAC 
CCTTAATTAAGG
8 
10 
12
0 
0 
0
0 
25 
>90
PmeI
GTTTAAAC 
GGTTTAAACC 
GGGTTTAAACCC 
AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
8 
10 
12 
24
0 
0 
0 
75
0 
25 
50 
>90
PstI
GCTGCAGC 
TGCACTGCAGTGCA 
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA 
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
8 
14 
22 
24 
26
0 
10 
>90 
>90 
0
0 
10 
>90 
>90 
0
PvuI
CCGATCGG 
ATCGATCGAT 
TCGCGATCGCGA
8 
10 
12
0 
10 
0
0 
25 
10
SacI
CGAGCTCG
8
10
10
SacII
GCCGCGGC 
TCCCCGCGGGGA
8 
12
0 
50
0 
>90
SalI
GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC 
GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG 
ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA
28 
30 
32
0 
10 
10
0 
50 
75
ScaI
GAGTACTC 
AAAAGTACTTTT
8 
12
10 
75
25 
75
SmaI
CCCGGG 
CCCCGGGG 
CCCCCGGGGG 
TCCCCCGGGGGA
6 
8 
10 
12
0 
0 
10 
>90
10 
10 
50 
>90
Enzyme
Oligo Sequence
Chain 
Length
% Cleavage
2 hr
20 hr
SpeI
GACTAGTC 
GGACTAGTCC 
CGGACTAGTCCG 
CTAGACTAGTCTAG
8 
10 
12 
14
10 
10 
0 
0
>90 
>90 
50 
50
SphI
GGCATGCC 
CATGCATGCATG 
ACATGCATGCATGT
8 
12 
14
0 
0 
10
0 
25 
50
StuI
AAGGCCTT 
GAAGGCCTTC 
AAAAGGCCTTTT
8 
10 
12
>90 
>90 
>90
>90 
>90 
>90
XbaI
CTCTAGAG 
GCTCTAGAGC 
TGCTCTAGAGCA 
CTAGTCTAGACTAG
8 
10 
12 
14
0 
>90 
75 
75
0 
>90 
>90 
>90
XhoI
CCTCGAGG 
CCCTCGAGGG 
CCGCTCGAGCGG
8 
10 
12
0 
10 
10
0 
25 
75
XmaI
CCCCGGGG 
CCCCCGGGGG 
CCCCCCGGGGGG 
TCCCCCCGGGGGGA
8 
10 
12 
14
0 
25 
50 
>90
0 
75 
>90 
>90
四. Fermentas公司提供的关于保护碱基的资料，其实这个更有参考价值~
太多了，请参考：
www.fermentas/en/support/technical-reference/restriction-enzymes/cleavage-efficiency
NEB公司的请参考：
b/nebecomm/tech_reference/restriction_enzymes/cleavage_linearized_vector.asp
b/nebecomm/tech_reference/restriction_enzymes/cleavage_olignucleotides.asp#A
Table. Cleavage Efficiency Close to the Termini of PCR Fragments
中国经纪人登录
Enzyme
Bp from the recognition site to fragment end
1
2
3
4
5
AanI (PsiI)
0
0-20
20-50
AarI
20-50
50-100
AasI (DrdI)
50-100
AatII
0
0-20
20-50
50-100
Acc65I (Asp718I)
0-20
50-100
AdeI (DraIII)
50-100
AjiI (BmgBI)
50-100
AluI
0-20
20-50
50-100
Alw21I (BsiHKAI)
50-100
Alw26I
50-100
Alw44I
0
20-50
50-100
ApaI
50-100
BamHI
50-100
BauI (BssSI)
0-20
20-50
50-100
BclI
0
50-100
BcnI (NciI)
20-50
lonely boy
50-100
BcuI (SpeI)
50-100
BfiI (BmrI)
50-100
BfmI (SfcI)
50-100
BfuI (BciVI)
50-100
BglI
20-50
50-100
BglII
0
50-100
Bme1390I (ScrFI)
20-50
50-100
BoxI (PshAI)
0
50-100
BpiI (BbsI)
50-100
Bpu10I
20-50
50-100
Bpu1102I (BlpI)
50-100
BseDI (BsaJI)
0
50-100
BseGI (BtsCI)
50-100
BseJI (BsaBI)
0
50-100
BseLI (BslI)
0
50-100
BseMI (BsrDI)
0-20
50-100
BseMII (BspCNI)
50-100
BseNI (BsrI)
0
50-100
BseSI (Bme1580I)
50-100
BseXI (BbvI)
20-50
50-100
Bsh1236I (BstUI)
50-100
Bsh1285I (BsiEI)
havd-686
0-20
50-100
语音芯片
BshNI (BanI)
50-100
BshTI (AgeI)
20-50
50-100
Bsp119I (BstBI)
50-100
Bsp120I (PspOMI)
20-50
50-100
Bsp1407I (BsrGI)
20-50
50-100
Bsp143I (Sau3AI)
50-100
Bsp68I (NruI)
0
50-100
BspLI (NlaIV)
50-100
BspOI (BmtI)
0
20-50
50-100
BspPI (AlwI)
0
50-100
BspTI (AflII)
0
0-20
50-100
Bst1107I (BstZ17I)
0-20
50-100
BstXI
0
50-100
Bsu15I (ClaI)
50-100
BsuRI (HaeIII)
0-20
20-50
50-100
BveI (BspMI)
0-20
50-100
CaiI (AlwNI)
0
0-20
50-100
Cfr10I (BsrFI)
20-50
50-100
Cfr13I (Sau96I)
50-100
Cfr42I (SacII)
50-100

本文发布于:2024-09-21 13:23:42，感谢您对本站的认可！

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