蛋白纯化缓冲液-万金油Buffer与镍柱

蛋白纯化缓冲液-万金油Buffer与镍柱
j.d.塞林格"万金油"buffer三打白骨精教学设计
Dr. Burgess 这人特有意思,喜欢吹嘘他发现的小trick。比如,他得意说他是全美国最早用coomassie blue染蛋白胶的人。据他说,六几年的时候他看到一个澳洲的老兄的一片文章,讲述一种新奇的染料叫考马市亮蓝, 比当时流行的染料amido black灵敏十倍以上。所以他就写了一封信要了一些,结果效果奇好。我们听得都目瞪口呆。
不过Burgess最自豪的,还是他的“万金油”buffer。他告诉我们说,他几十年了,总喜欢用这个buffer 的配方,什么蛋白都喜欢这种buffer, 可以说到了包治百病的神奇地步。尽管他吹得神乎其神,配方却十分简单。这个buffer叫TGE,就是Tris, glycerol 和EDTA。配方是这样的:
50mM Tris pH 7.9岐山县中医医院
0.5mM EDTA
50mM NaCl
5% glycerol
Tris EDTA NaCl 这三样都没什么,真正关键的是5%glycerol。有了这个glycerol, 很多蛋白,尤其是酶会十分稳定。这个稳定的效果是十分惊人的。Dr.Burgess就此跟我们讲了他的经历。六十年代的时候,他还是个小博士后,在watson 实验室里干,主要是纯化细菌RNA polymerase的各个亚基。那时候一个大问题是RNA polymerase纯化出来后十分不稳定, 放冰上, 过30分钟,活性还会损失一半。Burgess有一次不小心出了错误,把纯化出来的RNA polymerase和glycerol 混合了。结果意外发现,RNA polymerase 变得十分十分的稳定。稳定到什么程度呢,就是你把这个酶加上50%glycerol,用平信从美国寄十几天到澳洲,活性还有7~80%!另外Burgess也提到,如果要保存的蛋白有二硫键,加一点DTT,防止蛋白形成非天然的二硫键, 也会对蛋白质的稳定有好处。
为了让我们对这个"万金油"buffer的好处有感性认识, Burgess设计了一个实验让我们做。他之前已经准备好了在大肠杆菌中表达的GFP包涵体(inclusion body)。我们把包涵体分成两部分,一部分用guanidinium hydrochloride(盐酸胍)溶解变性,另一部分用sarkosyl (N十二烷基肌氨酸钠)溶解变性。然后把这些溶解的GFP溶液分到一个96孔板上,每个孔10微
升,然后加入20倍的refolding buffer 来稀释,稀释了之后,变性的GFP就开始重折叠。我们有一个hampton 卖的refolding 试剂盒,内有十几种不同配方的refolding solution。我们试了所有这些buffer 同时还试了TGE, TGE+15% glycerol, TGE+35% glycerol, TGE+45% glycerol,这四种buffer。由于GFP折叠好了才能发荧光,用一个fluorescence plater reader,我们可以实时监控折叠的效果。结果让人很吃惊,Hamton卖的这个试剂盒,虽然配方都很fancy,但是一塌糊涂,没有一种溶液能让GFP重折叠的很好。相比之下,TGE 的四种溶液都很好,GFP重折叠的效率是hampton kit的几十倍。最强的是TGE+35% glycerol。
另外,不论是用Gudn HC变性还是用sarkosyl来变性,TGE+glycerol 的重折叠的效果都很好。实验结果出来后,看着我们惊讶的表情,Burgess脸上都笑开花了,呵呵。这个实验我还学到的一个教训是,不能迷信商业化的kit, 很多kit吹得很牛,但并不一定真的好用。
Ni 柱重生一般常用的步骤是:
1. ddH2O洗5CV,6M盐酸胍洗1-2CV(这里流速慢点,浸泡也行的,我一般第一个CV泡1h,再加等体积的盐酸胍浸泡2h),多洗点柱体积就更好了。如果填料实在很脏的话,可
以用NaOH洗,但要先查该款Ni柱的基架耐受的NaOH浓度。
2. ddH2O洗10CV,然后用100mM EDTA洗1-2CV(流速要慢点,要把Ni柱洗白,Ni充分的被EDTA 螯合下来)
张之香china 农村妇女nomex3. ddH2O洗10CV,然后用200mM NiSO4上柱1-2CV(流速要慢,让Ni充分挂柱,或者1CV直接浸泡过夜也行)
4. ddH2O洗10CV,然后20%乙醇洗2CV,4度保存即可。以上柱体积的量可以适当增加点,效果更好点。
还有就是蛋白不挂柱子,不一定就是柱子的问题,有可能是蛋白本身的问题,也有可能是缓冲液不合适影响了蛋白的性质。如果真是填料一点都不结合目的蛋白,那柱子得有多脏啊。。。。你可以取点柱子,加点loading buffer煮一下,跑个SDS-PAGE看看,是否上面残留量很多蛋白,当然柱子看起来得是蓝/绿的,确认还有Ni的存在。
2008年奥运会会徽

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