利用UCSCXena做TCGA数据库的生存曲线分析

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UCSC的分析⼊⼝
打开UCSC Xena⽹站:。(⽹页速度可能不太稳定)
点击界⾯的GET STARTED,在打开的界⾯右上⾓点Launch Xena Browser,界⾯如图,进⼊分析界⾯。
利⽤UCSC分析TCGA数据库中乳腺癌样品
1. 在serch a study中选择TCGA Breast Cancer (BRCA),Done。
2. Select Data Type中选择Genomic。
微粒算法3. Add Gene or Position中输⼊⽬的基因的名字。
4. Assay Type中按照需要选择。如,Gene Expression。
核糖体蛋白5. 可以继续选择Assay Type,如,Copy Number。
otcbb
魔堂
6. 在栏⽬中点击左上⾓菜单图标,选择Kaplan Meier Plot。
联合国千年发展目标
凝胶谱法结果如图
2019/1/11

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