基于支持向量机的蛋白质与核酸相互作用在线预报方法[发明专利]

专利名称:基于支持向量机的蛋白质核酸相互作用在线预报方法
专利类型:发明专利
甘氨胆酸发明人:袁友浪,陆文聪,刘亮,钮冰,彭淳容
申请号:CN200910053871.9
申请日:20090626
公开号:CN101630346A
公开日:
水乡茶居20100120
专利内容由知识产权出版社提供
灶神之妻
摘要:本发明公开了一种基于支持向量机对蛋白质与核酸相互作用在线预报方法,该方法包括如下步骤:1.建立蛋白质序列数据集的训练样本集;2.蛋白质序列数据集转换;3.支持向量机训练生成的蛋白质特征数据集;4.需要预报蛋白质序列的读入、数据转换及蛋白质与核酸相互作用分类类型在线预报。该方法能实现对未测出是否与核酸作用的蛋白质是否与核酸作用,验证结果表明,对与rRNA、RNA、DNA作用蛋白质的10折交叉验证预报准确率分别达到93.75%、83.41%、81.85%。外部测试集验证所得模型分别有93.8%、84.2%、81.9%的预测正确率,在线预报时,用户只需在预报网页界面提供要预报的蛋白质序列,对其数据转换,完成支持向量机的训练和目标类型的预报,输出预报结果。
申请人:上海大学
地址:200444 上海市宝山区上大路99号
宋坚>线圈匝数>耐火
国籍:CN
代理机构:上海上大专利事务所(普通合伙)
代理人:陆聪明

本文发布于:2024-09-24 03:26:19,感谢您对本站的认可!

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标签:预报   蛋白质   核酸   数据   专利   支持   向量   序列
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