甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测_图文

美洲虎xk82010阅兵式>1区212甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测
目的:比较新型甲型H1N1流感病毒分离株HA、NA氨基酸序列之间的差异,分析HA、NA蛋白可能的抗原性细胞表位。方法:从GenBank中选取28株世界各地的新型甲型H1N1流感病毒分离株并下载各株HA、NA的氨基酸序列;使用Clustal X和MEGA 2.0软件对氨基酸序列的进行进化树分析;用Protean软件预测HA、NA蛋白的B细胞表位;用NetMHC 2.2预测T细胞抗原表位。结果:世界范围的毒株之间氨基酸序列相对保守,HA及NA均只有少数位点的变异,HA蛋白氨基酸序列之间较NA蛋白氨基酸序列之间变异较大;预测HA蛋白具有8个B细胞表位和10个T细胞表位;NA蛋白有12个B细胞表位和7个T细胞表位。结论:HA、NA蛋白的少数区域抗原性相对比较稳定,可以作为检测以及疫苗研究的靶区域。
标签: H1N1流感病毒; 抗原表位; 血凝素; 神经氨酸酶
2009年4月,在美国首次报道了两例感染新型甲型H1N1流感病毒患者[1],同时在墨西哥出现了呼吸道感染的流行[2]。美国爆发的甲型H1N1流感迅速在北美洲地区蔓延,并很快波及亚洲、欧洲。新型甲型H1N1流感病毒是由禽流感、猪流感和人流感三种流感病毒的基因片段间的变异或重组产生的[3],已经引起世界性的大流行。
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叶丹阳博客甲型H1N1流感能不断引起流行是由于其抗原性不断发生漂移所致[4],其中最重要是血凝素(hemagglutinin,HA) 和神经氨酸酶 (neuraminidase,NA) 的变异[5]。血凝素是流感病毒最重要的蛋白,它的裂解性、受体特异性和糖基化是决定流感病毒感染性和致病性的重要因素。神经氨酸酶是病毒囊膜表面的另一种重要的糖蛋白,在决定病毒毒力和宿主特异性方面也具有重要作用,与HA共为流感病毒亚型分型的主要依据,NA同时也是抗流感病毒的重要作用靶点[6]。目前,国内虽然已经开发了H1N1流感疫苗并接种了2000多万人,但是,接种所致的不良反应事例的出现同样给健康的人们带来了灾难。有针对性地改造毒素的相应蛋白、获得更为安全有效的疫苗成为解决问题的关键,而解析甲型H1N1流感病毒HA、NA蛋白的抗原性表位成为关键的突破口。

本文发布于:2024-09-23 14:33:54,感谢您对本站的认可!

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标签:流感病毒   蛋白   表位   抗原性
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