分子动力学计算(武汉理工大学实验报告)

点击 按钮。在 CASTEP Transition State Search 对话框中,确保Search protocol 被设置为 Complete LST/QST, Quality 被设置为 Medium。关闭CASTEP Transition State Search 对话框。确保其余设置与执行时几何结构优化计算时相同。选择 Job Control 选项卡,确保 Automatic 复选框未被选中,输入 TS 作为Job description。点击 Run 按钮,关闭 CASTEP Calculation 对话框。
确保TS.xsd 为活动文档,在工具栏上点击CASTEP 按钮,然后选择Analysis,或者从菜单栏选择 Modules | CASTEP | Analysis。从 CASTEP Analysis 对话框顶部列表中选择 Energy evolution,点击 View。一个包括过渡态搜索历史的图表文件 TS CASTEP TSSearch\d 显示出来。从工具栏选择Chart Viewer Selection Mode 工具,双击 TS.xtd。点击图上的不同点,以查看轨迹文件中相应的结构。才智中南
第二部分:实验调试与结果分析
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三、调试过程(包括调试方法描述、实验数据记录,实验现象记录,实验过程发现的问题等)
立方体31.建立气体H2模型。为使缩放过程明显,将H-H键长设为0.8埃
Calculation中设置如下,模拟结构中原子在计算力影响下的移动
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2.(1)输入 Pd 金属的晶体结构
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>输入阻抗

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