004-分子间氢键

004-分子间氢键
004分子间氢键
(1)出形成氢键的原子对(供氢的原子写在前)。怎样?下边envi C10---H10……O3863计划
C7----H7……..O3
(2)出形成氢键的原子对的相应操作码。
(供氢的原子后的数字越大,查的范围就越大)
Xp程序→f mol/n→kill$q→grow→envi c10 2
C10---H10……O3 1455
→envi c7 2
C7----H7……O3 2675
→symm 1555 +x,+y,+z
2555 -x,-y,-z
换算出相应的操作码
C10---H10……O3 x-1,+y,+z
C7----H7……O3 1-x,2-y,-z
(3)
在Ins文件中输入指令
htab c10 o3_$1
eqiv $1 x-1,+y,+z
htab c7 o3_$2
eqiv $2 1-x,2-y,-z
XL程序→Xl
结果记录在CIF文件中(倒数第二段)
svd
htab c10 o3_$1
eqiv $1 x-1,+y,+z
htab c7 o3_$2
eqiv $2 1-x,2-y,-z
胡 温
htab c23 o4_$3
eqiv $3 1-x,2-y,1-z碳酸铵
htab c18 o3_$4
eqiv $4 +x,1.5-y,0.5+z
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
avas_geom_hbond_distance_DA
超声波振子_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
C10 H10 O3 0.93 2.64 3.412(18) 140.3 1_455 C7 H7 O3 0.93 2.48 3.373(15) 162.1 3_675 C23 H23 O4 0.93 2.44 3.30(2) 154.2 3_676 C18 H18 O3 0.93 2.53 3.412(17) 158.4 4_576

本文发布于:2024-09-21 01:28:02,感谢您对本站的认可!

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