一、翻译并解释名词：(10x4分)
一个位点的序列变异。
2. Effective population size (Ne) 有效种大小
在一个具有相等性比、随机交配的理想种中表现出与特定统计（全部成体数目）规模相对应的真实的种杂合性随时间丧失的速率相同的个体数。
3. F-statistics F 统计检验
用于评估个体间、亚种间和整个种间杂合性的分布的统计方法，被广泛应用于定量亚种的遗传分化。 4. Genetic load 遗传负荷
相对于理论最佳值来说降低了的基因型适合度。
5. Hardy-Weiberg equilibrium哈温平衡
当所有等位基因频率是已知的时候，在一个大的随机交配种中的纯合子和杂合子的预期比例。假设没有迁移、突变或选择作用，哈温平衡定律则认为等位基因频率从一个世代到下一个世代应该保持不变。
6. Bottleneck effect瓶颈效应
种的规模大为缩小，随后常常有一个（种的）恢复。
7. Selection sweep选择扫荡。
课件：Occurrence of a beneficial mutation，Only individuals carrying the mutation reproduce，‘Population bottleneck’，Mainly affects linked loci。
8. IAM 无限等位基因模型
其中突变不是以可预料的方式一个接一个发生，而大多数突变是像产生SNP（单核苷酸多态性）那样出现的。
9. Linkage disequilibrium (LD) 连锁不平衡。
术语表：
Linkage equilibrium 连锁平衡：由重组促成的情形，其中遗传位点在繁殖期相互独立分离。当两个位点上的等位基因一起分离时，如他们在同一个染体上的物理位置太接近时，则发生不平衡。
百度：
连锁平衡：HLA 不同基因座位的各等位基因在人中以一定的频率出现。在某一体中，不同座位上某两个等位基因出现在同一条染体上的频率高于预期的随机频率的现象，称连锁不平衡 (linkage disequilibrium) 。由于 HLA 贵州财经学院学报不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传，而连锁的基因并非完全随机地组成单体型，有些基因总是较多地在一起出现，致使某些单体型在体中呈现较高的频率，从而引起连锁不平衡。
10. Metapopulation复合种
http代理种再分为多个同类，至少其中的一些偶尔灭绝，随后通过从其他同类迁入再建立种。
11. Microsatellite微卫星
带有单序列（通常为2-，3-或4-核苷酸）重复多次的遗传位点。
12. MtDNA 线粒体DNA
存在于线粒体中的环状染体。
13. Non-synomous mutation非同义突变
由一个三联密码变化使特定氨基酸改变的突变。
14. PCR聚合酶链式反应
用寡核苷酸引物和耐热的DNA聚合酶扩增大量DNA序列的一种方法。
15. SNP单核苷酸多态性
在DNA序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基的等位基因。
16. RFLP限制性片段长度多态性
用限制性酶和凝胶电泳鉴定DNA序列多态性的方法。
17. Transition转换
一个嘌呤核苷酸被另一个嘌呤核苷酸替代，或一个嘧啶核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代的突变。
18. Transversion颠换
一个嘌呤核苷酸被另一个嘧啶核苷酸取代或相反过程的突变。
19. Molecular ecology分子生态学
课件:分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学
科,其研究内容包括种在分子水平的遗传多样性及遗传结构，生物器官变异的分子机制、生物体内有机大分子对环境因子变化的响应、生物大分子结构、功能演变与环境长期变化的关系以及其它生命层次生态现象的分子机理等。分子生态学的理论和方法对传统学科有巨大的促进作用，同时，对解决诸如转基因、克隆技术应用中的生态安全、环境与人类健康等重大问题将产生深刻的影响。
20. Functional ecological and evolutionary genomics(FEEG)
生态和进化基因组学？？
21. Phylogeographic
Phylogeographiy 亲缘地理学
研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
22. Monophyly 单系
类中的所有个体是从同一个祖先来的，并且从这个祖先来的所有存活的后代都在这个类
中。
23. Intron 内含子
真核生物的结构基因间的非编码DNA序列。内含子被转录但它们的RNA拷贝在功能产生期间被切除。
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24. Introgression 渐渗杂交
等位基因从一个种或物种向另一个种或者物种的扩散，而产生像种间或物种间的近交或杂交这样的结果。
25. Genetic drift 遗传漂变
《生物多样性导论》：在有性生殖的体中，每个世代的基因库是对上一个世代基因库的随机抽样和复制。在世代交替过程中，不同的等位基因遗传到下一代的偶然性对种遗传结构有可能产生显著影响。 Wright把这种由于配子产生及结合过程中的随机性导致的基因频率的波动称为遗传漂变(genetic drift)，也称随机漂变、遗传偏离或Wright效应。
26. Haplotype 单（倍体）型
源于同一染体或染体单倍体组的一套等位基因。
27. ESU(Evolutionary Significant Unit) 进化显著单元
分类学上对保护重要类的一种尝试性定义。
28. Metagenomics 宏基因组学
百度： 宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其落功能。它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。其主要含义是： 对特定环境中全部为生物的总DNA（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。
29. CpDNA 叶绿体DNA
c86 存在于叶绿体内的环状染体。
30. Heterosis 优势，杂合体优势
杂合子比纯合子有较高的适合度的情形。
31. Recombination 重组
二倍体生物中减数分裂期间同源（配对）染体间的DNA交换。
32. rRNA 核糖体RNA
核糖体中的RNA分子…………
33. SNP 单核苷酸多态性
在DNA序列中一个特殊位点上出现不同核苷酸碱基的等位基因。
34. Sympatric speciation 同域发生（物种形成）
生活在同一地区的个体中形成的新物种。
35. Vicariance 地理隔离
种或物种被环境事件，如山脉形成造成的物理隔离
注：描黄部分为术语表中无相关解释的，仅供参考。
分子生态学简答题
1. 什么是分子生态学， 分子生态学的主要研究内容是什么？
教材的定义:分子生物学是应用分子生物学的原理和方法来研究生命系统与环境系统相互作用的生态机理及其分子机制的科学。它是生态学与分子生物学相互渗透而形成的一门新兴交叉学科。
学生科技网研究内容：包括种在分子水平的遗传多样性及遗传结构，生物器官变异的分子机制、生物体内有机大分子对环境因子变化的响应、生物大分子结构、功能演变与环境长期变化的关系以及其它生命层次生态现象的分子机理等。分子生态学的理论和方法对传统学科有巨
大的促进作用，同时，对解决诸如转基因、克隆技术应用中的生态安全、环境与人类健康等重大问题将产生深刻的影响。
2. 什么是宏基因组学，其主要研究过程如何？
宏基因组学（Metagenomics）又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其落功能。
宏基因组学的研究过程：
对特定环境中全部为生物的总DNA（也称宏基因组，metagenomic）进行克隆，并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质；或者根据rDNA数据库设计引物，通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。
3. 什么是生态和进化基因组学，其主要研究内容如何？
研究环境条件与基因组结构、功能、动态及进化相互关系的学科。
4. 什么是亲缘地理学，其研究内容是什么？
研究调控系谱世系的地理分布的原理和过程的科学。
5. 什么是数量性状？数量性状有那些类型？
数量性状又称为适应性性状，通常由互相影响的多个基因控制，并会明显受到环境的影响。在足够大的体中，数量性状的分布基本符合正态规律。
数量性状的类型：连续型、阈值型、间断型（或离散型）
连续型：数量性状的表现为连续分布，体中个体数足够多时，连续型数量性状基本符合正态分布，如：身高、体重、奶牛产奶量等。
阈值型数量性状：此种数量性状的表现会受到潜在风险因素的影响，具有最低或最高阈值，例如：生物的性成熟年龄，疾病的易感率等。
间断型数量性状：只能用离散的数值或数组表示其表现型的数量性状，如动物每胎产仔个数、果蝇足上的刚毛数等。
6. 影响种等位基因频率变化的进化过程有哪些？
种进化的主要动力有：突变、遗传漂变、选择、基因的迁移（基因流动）。
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突变：生物核酸序列上碱基种类或数目发生改变，导致新等位基因产生或原有等位基因丧失。
遗传漂变：由于进行有性生殖的生物的配子形成过程具有随机性，亲代的部分遗传信息在通过配子传递给子代时会由于这种不确定性而丢失，导致部分等位基因在整个种的下一代中频率降低甚至消失。遗传漂变现象在小种中表现尤其明显。
选择：外部自然环境对种等位基因的选择往往是定向的，若等位基因所控制的形状不能使生物较好地适应生存环境，自然选择就会逐步淘汰这些等位基因。
基因流动：种内个体在不同种之间进行迁移时，会造成不同种之间等位基因的混合。整体而言，大规模的种之间个体迁移能够调和等位基因频率分布的不均衡现象，有利于提高种等位基因多样性。
7. 什么叫选择扫荡？是如何产生的？
A selective sweep is the reduction or elimination of variation among the nucleotides in neighboring DNA of a mutation as the result of recent and strong positive natural selection.
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