生物化学与分子生物学 名词解释

第二章蛋白质
1、GSH
即谷胱甘肽,是由谷氨酸,半胱氨酸和甘氨酸通过肽键缩合而成的三肽。
2、蛋白质变性(protein denaturation)
蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,这种现象称为蛋白质变性。
3、α-螺旋(α-helix)
三代同堂蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基氧与多肽链C端方向的第3个残基(第n+3个)的酰胺氮形成氢键。在典型的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。
4、β-折叠片层(β-sheet)
是蛋白质中的常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链,这些肽链可以是平行排列(走向都是由N到C方向);或者是反平行排列(肽链反向排列)。
5、β-转角(β-turn)
也是多肽链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(α-螺旋和β-折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一般含有2~16个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环(loops)。常见的转角含有4个氨基酸残基,有两种类型。转角I的特点是:第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键;转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。
6、功能蛋白质组(functional proteome)
指的是特定时间、特定环境和实验各种下,基因组活跃表达的蛋白质。
7、肽键(peptide bond )
在蛋白质分子中,一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基脱水缩合后而形成的酰胺键称为肽键。
8、基序/模体(motif)
模体属于蛋白质的超二级结构,由2个或2个以上具有二级结构的的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,并发挥专一的功能。一种类型的模体总有其特征性的氨基酸序列。
9、结构域(domain)
在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。
10、氨基酸残基
在多肽链中的氨基酸,由于其部分基团参与了肽键的形成,剩余的结构部分则称氨基酸残基。它是一个分子的一部分,而不是一个分子。
11、蛋白质二级结构(secondary structure of protein)
指某段多肽链中主链骨架在局部空间有规律的盘绕和折叠,即蛋白质分子中某段肽链主链原子的相对空间位置,不包括与其他链段的相互关系及侧链构象的内容。
12、蛋白质三级结构(Tertiary structure of protein)
指在二级结构、模体的基础上,由于侧链R基团的相互作用,整条肽链进一步折叠和盘曲成球状分子,即整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
13、蛋白质四级结构(Quaternary structure of protein)
由两条或两条以上具有独立三级结构的多肽链以非共价键连接的空间排布和接触部位的布局称蛋白质的四级结构。
知识分享平台14、别构效应(allosteric effect)
当蛋白质(酶)与它的配体(某种小分子物质)结合后,引起蛋白质(酶)的空间结构(构象)发生改变,使其适合功能的需要,这种变化称别构效应或变构效应。
15、盐析(Salting out)
向某些蛋白质溶液中加入某些无机盐溶液后,可以使蛋白质凝聚而从溶液中析出,这种作用叫作盐析,可复原。
16、亚基(subunit)
倾慕系列有四级结构的蛋白质的每条具有独立三级结构的多肽链称为亚基或亚单位。
17、蛋白质的等电点(pI)
溶液处于某一PH时,氨基酸解离成正负离子的趋势相等,即成为两性离子,净电荷为零,在电场中不向阳极也不向阴极移动,此时溶液的pH称为氨基酸的等电点。
第三章核酸
1、DNA变性
在某些理化因素作用下,DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂,使DNA双螺旋结构松散,变为单链,即为DNA 变性。
2、核酶(ribozyme)
具有催化活性的RNA,即化学本质是核糖核酸RNA,却具有酶的催化功能。
3、增效应
变性的DNA,分子两条互补链可完全解开成为两条单链,使得碱基暴露,260nm 处外吸收增强,这种现象称为增效应。
4、Tm值
即解链温度,DNA的变性从开始解链到完全解链,是在一个相当窄的温度内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值50%时的温度称为DNA的解链温度,这一现象和结晶的融解过程类似,又称融解温度(Tm)。
5、DNA超螺旋(DNA supercoil)
DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。
6、hnDNA
即核不均一RNA,是mRNA的前体。
7、DNA复性
DNA的复性指变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。
第四、五章酶
1、同工酶(isoenzyme)
能够催化相同的化学反应,而酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学性质不同的一组酶。
2、酶活性中心(active center)
酶分子中必需基团在一级结构上可能相距很远,但在空间结构上彼此靠近,构成具有特定动态构象的局部空间结
构,直接参与酶促反应,与外部的底物特异地结合并使底物转变为产物的区域称为酶的活性中心或活性部位。
3、Km值
是当酶反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度的大小。
4、共价修饰(covalent modification)
酶分子上某些特殊基团在其他酶作用下,发生可逆的共价结合而被修饰,并快速改变的活性称共价修
饰调节或化学修饰。
5、酶原(zymogen)
在细胞内合成及初分泌时处于无活性状态的酶的前体。
6、全酶(holoenzyme)
酶蛋白和辅助因子结合形成的具有催化作用的复合物称为全酶。
7、米氏方程(Michaelis-Menten equation)
表示酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程,V=V max[S]/(K m+[S])。
8、别构酶(allosteric enzyme)
别构酶一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。
9、辅酶(coenzyme)雨鸟喷头
辅酶是一类可以将化学基团从一个酶转移到另一个酶上的有机小分子,与酶较为松散地结合,对于特定酶的活性发挥是必要的。
10、辅基(prosthetic group)
酶的辅助因子或结合蛋白质的非蛋白部分,其中较小的非蛋白质部分称辅基,与酶或蛋白质结合的非常紧密,用透析法不能除去。
第六章糖代谢
1、糖酵解(glycolysis)
糖无氧分解即糖酵解,是指葡萄糖在无氧条件下分解生成乳酸并释放出能量的过程。
2、糖异生(gluconeogenesis)
由非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生。
葛洲坝论坛3、糖原(glycogen)
是由许多葡萄糖分子聚合而成的带有分支的高分子多糖类化合物。
4、底物水平磷酸化(substrate level phosophoryltion)
底物在氧化过程中直接将高能磷酸键转移给ADP生成ATP的过程。
5、巴斯德效应(Pasteur effect)
有氧氧化抑制糖酵解的现象。
6、磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)
滴鼻液
指从G-6-P脱氢反应开始,经一系列代谢反应生成磷酸戊糖等中间代谢物,然后再重新进入糖氧化分解代谢途径的一条旁路代谢途径。
7、三羧酸循环(TriCarboxylic Acid cycle,TCA)
三羧酸循环(柠檬酸循环或Krebs循环)是指在线粒体中,乙酰CoA首先与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,然后经过一系列的代谢反应,乙酰基被氧化分解,而草酰乙酸再生的循环反应过程。
第七章脂类代谢
1、脂肪酸β-氧化
脂肪酸在体内氧化时在羧基端的β-碳原子上进行氧化,碳链逐次断裂,每次断下一个二碳单位,即乙酰CoA,
该过程称作β-氧化。
2、酮体(ketone body)
脂肪酸在肝脏中氧化分解所生成的乙酰乙酸、β-羟丁酸和丙酮三种中间代谢产物统称为酮体。
3、血浆脂蛋白(lipoprotein)
血脂与血浆中的蛋白质结合,以血浆脂蛋白的形式存在及运输。
4、脂肪动员(fat mobilization)
贮存于脂肪组织中的脂肪被一系列脂肪酶水解为甘油和游离脂肪酸并释放入血供全身各组织利用的过程。
5、初级胆汁酸(primary bile acid)
有肝细胞直接合成的胆汁酸成为初级胆汁酸。
6、载脂蛋白(apolipoprotein,Apo)
血浆脂蛋白中的蛋白质部分。
7、必需脂肪酸(essential fatty acid,EFA)
多数脂肪酸在人体内能合成,只有不饱和脂肪酸的亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸在体内不能合成,必须从植物油摄取,称为人体必需脂肪酸。
8、脂类(lipid)
脂类是脂肪、类脂及其衍生物的总称,是一类不溶于水而易溶于有机溶剂,并能为机体利用的有机化合物。
第八章生物氧化
1、氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)
在线粒体中,底物分子脱下的氢原子经呼吸链传递给氧,在此过程中释放能量使ADP磷酸化生成ATP,这种能量的生成方式就称为氧化磷酸化。
2、呼吸链(respiratory chain)
存在于线粒体内膜上,按一定顺序排列的一系列酶或辅酶。其作用是以传递电子和H+的形式传递代谢
物氧化脱下的氢原子,最后使活化的氢与活化的氧结合生成水。该传递链与细胞呼吸过程有关,故称为呼吸链,又称电子传递链。
3、P/O比值
物质氧化时,每消耗一摩尔氧原子所消耗的无机磷的摩尔数称为P/O比值,即A TP生成的摩尔数。
4、高能化合物
指体内氧化分解中,一些化合物通过能量转移得到了部分能量,把这类储存了较高能量的化合物,如三磷酸腺苷(A TP),磷酸肌酸,称为高能化合物。它们是生物释放,储存和利用能量的媒介,是生物界直接的供能物质。
5、解偶联剂(uncoupler)
使氧化与磷酸化偶联过程脱离的物质称为解偶联剂。
第九章氨基酸代谢
1、必需氨基酸(essential amino acid)
指体内需要而又不能自身合成,必须由食物供给的氨基酸,共有8种。
2、一碳单位(one carbon unit)
某些氨基酸代谢过程中产生的只含有一个碳原子的基团,称为一碳单位。
3、生酮氨基酸(ketogenic amino acid)
分解代谢过程中能转变成乙酰乙酰辅酶A的氨基酸,共有亮氨酸、赖氨酸、氨酸、苯丙氨酸和酪氨酸5种。
4、生糖氨基酸(glucogenic amino acid)
能通过糖异生转变成葡萄糖的氨基酸。
5、鸟氨酸循环(orinithine cycle)
尿素生成的过程由Hans Krebs 和Kurt Henseleit 提出,称为鸟氨酸循环,又称尿素循环(urea cycle)或Krebs- Henseleit循环。
6、苯酮尿症(phenylketonurics,PKU)
是一种常见的氨基酸代谢病,是由于苯丙氨酸代谢途径中的酶缺陷,使得苯丙氨酸不能转变成为酪氨酸,导致苯丙氨酸及其酮酸蓄积并从尿中大量排出。
7、联合脱氨基作用(transdeamination)
转氨与脱氨相偶联而脱出氨基的作用称联合脱氨基作用,亦称转氨脱氨基作用。
8、丙氨酸-葡萄糖循环(alanine-glucose cycle)
丙氨酸和葡萄糖反复的在肌和肝之间进行氨的转运,故将这一途径称为丙氨酸-葡萄糖循环。
9、氧化脱氨基(oxidative deamination)
氨基酸先经过脱氢生成不稳定的亚氨基酸,然后水解产生α-酮酸和氨,此反应成为氧化脱氨基作用。
10、转氨基作用(transamination)
在转氨酶作用下,某一氨基酸的α-氨基转移到另一种α-酮酸的酮基上,生成相应的氨基酸,原来的氨基酸则转变成α-酮酸的过程。
11、尿素的肠肝循环
血液中的尿素渗入肠道,受肠菌尿素酶水解而生成氨的过程。
12、γ-谷氨酰基循环(γ-glutamyl cycle)
指通过谷胱甘肽的代谢作用将氨基酸吸收和转运的过程。
13、蛋氨酸循环
SAM通过转甲基作用,将甲基转移给甲基接受体后,其本身转变为S-腺苷同型半胱氨酸,进而又转变成同型半胱氨酸,同型半胱氨酸可接受N5-CH3-FH4分子中的甲基再生成蛋氨酸。从蛋氨酸活化为SAM到转出甲基以及再生成蛋氨酸的全过程称为蛋氨酸循环。
第十章核苷酸代谢
1、从头合成(de novo synthesis)
利用一些简单的前体物,如5-磷酸核糖,氨基酸,一碳单位及CO2等,逐步合成嘌呤核苷酸的过程称为从头合成途径。
2、补救途径(salvage pathway)
指利用分解代谢产生的游离碱基或核苷合成相应核苷酸的过程,又称再利用合成途径。
3、痛风(metabolic arthritis)
嘌呤核苷酸分解代谢异常使血尿酸升高,尿酸钠晶体沉积于软骨、关节、软组织及肾脏引起皮下结节,关节疼痛的症状。
4、自杀抑制作用(suicide substrate)
底物类似物经酶催化生成的产物变成了该酶的抑制剂,例如别嘌呤醇对黄嘌呤氧化酶的抑制。
5、Lesch-Nyhan综合征(Lesch-Nyhan syndrome)
也称为自毁容貌症,是先天性嘌呤代谢缺陷病,源于次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)的缺失。

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