手提质粒实验步骤及试剂配法

手提质粒步骤
100ml菌液50ml离心管离心两次,弃上清(确保上清吸干净
(1)solutionⅠ(冰预冷3.6ml重悬菌体沉淀
(2)solutionⅡ(冰预冷从底部往上逐渐加入8ml裂解重悬菌液,轻、快颠倒6,冰浴6-10分钟,注:时间不能过长,混匀不可剧烈
(3)solutionШ(冰预冷黑帮之地2)6ml,颠倒几次混匀,冰浴10min,10000rpm4℃20min
上清过滤(除去杂蛋白)转移至新的干净的50ml离心管,加入0.6体积的异丙醇(10.56ml),混匀,室温放置10min,10000RPM离心20min弃上清1-2ml 70%乙醇吹悬洗涤2次(10000rpm10min),弃上清,用3ml TE(可用elution buffer栾茂田代替)重悬(若菌液为几百毫升则总共用3ml elution buffer依次重悬合并重悬液),转移重悬液至新的50ml离心管冰浴
(4)加入冰预冷的3ml 5M Licl,混匀,10000rpm离心4℃10min上清转移至新的干净的
离心管中,加入等体积的异丙醇(6ml)混匀,10000rpm离心保师附小在线校园4℃10min弃上清(沥干)1-2ml 70%乙醇洗涤2次。每次均10000rpm离心滁州学院学报10min弃上清,沥干
(5)加入含有无DNA酶的RNA酶(50ug/ml)注:如果为几百毫升的菌液RNA酶按比例增大的TE(可用elution buffer代替)2ml溶解沉淀,混匀,分装到1.5EP管中(每管建议250ul),室温放置30-60min
(6)加入等体积的酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)混匀,12000rpm离心10min取上清液,尽量别吸太完全,减少杂质带入下一步,剩余的上清液收集后混合至一个新的1.5EP管,重复12000rpm离心10min,吸上清液,尽量减少杂质吸入,乳糖操纵子主要是为了在保证除去杂质的基础上减少损失
(7)在上步获得的上清液中加入等体积的酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)混匀,12000rpm离心10min。取上清液,尽量别吸太完全,减少杂质带入下一步,剩余的上清液收集后混合至一个新的1.5EP管,重复12000rpm离心10min,吸上清液,尽量减少杂质吸入,为了纯度宁可舍弃一部分上清,主要是为了在保证除去杂质的基础上减少损失
(8)在上步获得的上清液中加入等体积的氯仿混匀,12000rpm离心10min,取上清液,尽量别吸太完全,减少杂质带入下一步,剩余的上清液收集后混合至一个新的1.5EP管,重复12000rpm离心10min,吸上清液,尽量减少杂质吸入,为了纯度宁可舍弃一部分上清,主要是为了在保证除去杂质的基础上减少损失。
(9)在上步获得的上清中加入1/10体积的3M的NaAc,2.5倍体积无水乙醇,-70℃15min,12000rpm 10min
(10)超净台内清弃上清,用冰预冷的70%乙醇洗涤2次,每次12000rpm 10min第二次清弃上清后用头吸净残余液,晾干,无菌水溶,100ml菌液获得的质粒用100ul无菌水溶
各种溶液的配法
SolutionⅠ(25mmol/L Tris-Hcl,50mmol/L葡萄糖,10mmol/L EDTA)
SolutionⅡ(0.2mol/L NaOH,1%SDS)  80mLSolutionⅡ需要0.64g氢氧化钠,SDS 0.8g去离子水80ml,一定要现用现配!!
Solution Ш(3mol/L 醋酸钾,2 mol/L 醋酸)
各种试剂的作用原理
小型计算机25mmol/L Tris-Hcl作用:调节溶液PH值
50mmol/L葡萄糖:悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部
10mmol/L EDTA:Ca2+ 和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,抑制DNase的活性,和抑制微生物生长,避免DNA被迅速降解。
0.2mol/L NaOH:溶解细胞,破碎细菌。
1%SDS:十二烷基硫酸钠(SDS)遇到钾离子后变为十二烷基硫酸钾(PDS),沉淀蛋白质,冰浴沉淀更彻底。基因组DNA也被PDS共沉淀。
2 mol/L 醋酸:中和氢氧化钠,避免其损伤DNA。
5MLiCl:沉淀RNA
酞与氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被酚或氯仿挤去,使蛋白失去水合状态而变性过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。
酚:使蛋白质变性。
氯仿:除去脂类物质
异戊醇:减少抽提过程中的泡沫产生,在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
酚:氯仿:异戊醇=25:24:1的主要作用是抽提蛋白质。
醋酸钠:促进DNA的沉淀

本文发布于:2024-09-22 22:34:29,感谢您对本站的认可!

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标签:沉淀   杂质   蛋白质
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