质粒大量提取的主要试剂
溶菌酶(10 mg/ml):100 μl 1 M Tris-HCl(新侨报
pH 8.0),0.1 g 溶菌酶,加超纯水至10 ml,混匀,可根据用量分装至小管,置于-20 ℃保存。 1×TE(pH 8.0):5 ml 1 M Tris-HCl(pH 8.0),1 ml 0.5 M EDTA,加超纯水定容至500 ml,湿热灭菌,室温保存。 RNaseA(10 mg/ml):0.1 g RNaseA,33 μl 3 M NaAc(pH 5.2),加超纯水至9 ml,100 ℃,15 min,冷却至室温,置于-20 ℃保存。
25% 蔗糖:25 g 蔗糖,5 ml 1 M Tris-HCl(pH 8.0),加超纯水定容至100 ml,置于4 ℃保存。
0.5 M EDTA:186.1 g EDTANa2H2O,NaOH约20 g,加800 ml超纯水溶解完全后,调pH至7.6,定容至1 L,湿热灭菌,室温保存。
Triton-lysis:1 ml 10% Triton-100,12 ml 0.5 M EDTA(pH 8.0),5 ml 1 M Tris-HCl(pH 8.0),加超纯水定容至100 ml,室温保存。
PEG8000:150 g PEG8000,软件天地150 ml 5 M NaCl,加超纯水定容至500 ml,常温保存。
EB(10 mg/ml):10 mg EB,加超纯水1 ml,溶解,室温保存。
质粒大量提取的步骤(CsCl超速离心纯化DNA)
A. 取1 ml含目的质粒的菌液,接种到400 ml含80 μg/mL氨苄青霉素的LB培养基中,37 ℃摇床上剧烈振荡(200 rpm)培养12 h左右。
B. 将菌液倒入离心瓶,4200 rpm离心13 min;弃上清,菌体沉淀用6 ml含25% 蔗糖的50 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)溶液重悬。 C. 加入1.5 ml新鲜配制的10 mg/ml溶菌酶,室温静置10 min;加入1 ml 0.5 M EDTA(pH 7.6),混匀,再加入100 μl 10 mg/ml RNase A,混匀,最后加入7 ml Triton裂解缓冲液充分混匀。
D. 将溶液倒入50 ml离心管中,4 ℃ ,40000 g,离心45 min;将上清倒入新管中,加入1/2农业生产结构上清体积的30% PEG8000,颠倒混匀数次,4 ℃中放置4-6 h(或过夜)。
E. 4000 rpm 离心5 min,弃上清,用3 ml 1×TE(pH8.0)溶解约1 h;加入3.5-4 g CsCl,溶解完全。
F. 在超离管中加入驱逐出境20 μl EB(10 mg/ml),将溶液移入超离管中,称重,用配平(以1% CsCl 配平),以矿物油补平高度,封口,颠倒数次将溶液混匀。
G. 60000 rpm超速离心16 h,可见EB集中于两条带,一条位置较高较细浅的带为开环或线状质粒DNA,另一条位置较低较粗的带为超螺旋质粒DNA。
H. 用5 mL注射器抽取超螺旋质粒DNA的EB带,放入15 ml管中,加入等体积1×TE(pH 8.0)。
I. 以等体积的水饱和正丁醇溶液将EB萃取除去,直到溶液澄清无,再用等体积的水饱和正丁醇溶液继续萃取三次,确保EB去除干净。
J. 将2.5倍体积的无水乙醇与萃取好的质粒DNA混匀,4 ℃,13000 rpm离心3 min,去上清;加入450 μl水,溶解,室温过夜,直到溶解完全。
K. 将质粒溶液转移到1.5 ml离心管中,加20 μl 5 M NaCl和1 ml无水乙醇,4 ℃,13000 rpm 离心10 min传染病信息报告管理规范,去上清,以适当体积1×TE(pH 8.0)溶解完全后即可用于转染细胞,测定浓度后存于-20 ℃备用。