一、课程简介2013诺贝尔物理学奖
药物基因组信息学利用生物信息学方法研究影响药物作用的遗传差异，对海量药物基因组学数据进行整理和分析，应用于药物的设计和开发，进而达到合理用药和个性化用药的目的。 通过本课程的学习，使学生了解药物基因组学的基本概念、基本方法、基本知识，掌握常用的药物基因组学相关数据资源和工具，使学生具备利用生物信息学方法解决药物基因组学相关实际工作和科学研究中具体问题的能力。 二、理论教学内容
1.药物基因组学概述
掌握内容：生物信息学与药物基因组学的关联，当前生物信息学相关药物基因组学的研究热点。
了解内容：药物基因组的研究内容，药物基因组学的发展历史。
单向阀2.识别影响药物反应的基因突变
掌握内容：识别影响药物反应基因突变的生物信息学方法，药物反应相关基因突变的数据资源。
小毛孩夺宝奇缘
了解内容：基因突变和药物反应的基本定义，药物动力学、药物效应学和用药安全。
盖革计数管3.非编码RNA多态与药物反应
掌握内容：识别药物反应相关miRNA多态和lncRNA多态的生物信息学方法，计算预测方法原理，药物反应相关非编码RNA多态的数据资源。
了解内容：miRNA多态和lncRNA多态的定义和种类，影响药物反应的基本原理。
4.复杂疾病相关的药物靶标筛选
掌握内容：药物靶标的定义、基于序列相似性的药物靶标筛选策略，计算预测方法原理，当前计算药物靶标的数据资源。
了解内容：基于表型和药物结构相似性的药物靶标筛选策略。
5.高通量测序技术在药物基因组学中的应用
掌握内容：药物基因组相关的高通量测序数据资源，高通量数据检测平台和数据类型，药物基因组学
相关高通量数据的分析策略，高通量数据处理方法。
了解内容：药物基因组学相关高通量测序与精准医学，计算方法的选用和计算原理。
6.肿瘤个性化给药
泵效率掌握内容：筛选肿瘤个性化药物的生物信息学方法，基因组多态性与分子靶向药物了解内容：肿瘤个性化用药的定义和意义。
掌握内容：PolySearch、T3DB、CMAP、Drugbank、FDA Drug Index Database、Infoknowmics™等数据库的应用。
了解内容：药物基因组学数据库的构建框架、存储数据类型及搜索方法。
三、实验教学内容
1.药物基因组信息学相关数据库的查与使用
基本内容：了解药物基因组信息学相关数据库的基本架构和开发流程，学会使用数据库提供的示例。
基本要求：了解生物信息学数据库的设计概念，能够自己看懂数据库的帮助文档。
2.利用公共数据库查药物反应相关基因突变
基本内容：了解药物反应相关基因突变的定义，完成乳腺癌耐药性相关基因突变的数据库挖
掘，利用功能注释数据库，对这些突变的基因进行功能分析。
基本要求：了解药物反应相关基因突变的种类，了解药物反应相关基因突变的不同作用机制。
3.利用已有数据库查药物反应相关miRNA多态和lncRNA多态
北京零点后
基本内容：了解miRNA多态和lncRNA多态引起不同药物反应的作用机制，完成乳腺癌耐药相关miRNA多态和lncRNA多态的数据库查，并出这些非编码RNA多态与基因之间的调控关系。
基本要求：了解PubMed数据库查文件的方法，学会miRNA靶基因预测数据库的查询。
4.药物基因组生物信息学常用软件和数据库的使用
基本内容：熟悉PolySearch工具和Drugbank数据库的使用。基本
要求：利用数据库查乳腺癌常见化疗药物的靶基因。
四、参考资料
《生物信息学》（第二版）.李霞主编.人民卫生出版社.2015年6月出版
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