1 航空
由日本航空(JAL)、全日空(ANA)、日本空中系统(JAS)、Skymark Airlines及Air Do等航空公司担任。这五家航空公司运营从东京飞往札幌、大阪、福冈、冲绳间的所有主要航线，全日空航空公司的航班兼飞新航线及地方支线。日本全国共有60个机场，空中之旅方便之极。 详细请看我的博客 日本交通攻略-飞机篇
2 铁路
ＪＲ铁道(新干线)
从铁路事业的效能、火车旅行的舒适来说，日本可以说是世界第一。JR是旧日本国有铁路Japan Railways Group的简称。JR全国铁路网的火车安全、快速、准时而又经济。如果您持有日本铁路周游券(Japan Rail Pass)，可以乘坐全新的成田特快(Narita Express)电车。成田特快的车站位于机场候机大楼地下，电车运行于成田机场和东京、新宿、池袋、大宫、横滨 、大船车站之间。列车内所有的标识和车内广播均使用日语和英语。车内还提供英语电话问询服务。 日本的铁路铁路总长4.7万公里，铁路中的新干线是长距离客运的主要交通手段，也是向外国旅客推荐的主要交通工具。新干线每隔十几分钟就有一班从东京开往国内各主要城市的列车。 新干线被人们称为“理想的超级特快”，线路有东京至大阪间的东海道新干线、大阪至博多间的山阳新干线、大宫至盛冈间的东北新干线、大宫至新泻间的上越新干线和福岛至山形间的山形新干线等等。此外，在日本的主要大城市中，地铁交织如网，遍布各处，较汽车更为迅捷、准时、方便。 日本的列车车票价格除了根据乘坐距离远近而不同之外，乘坐特快列车、快车等种类的列车和乘坐绿列车(头等列车)、对号入座车、卧车等座席种类有所不同的列车时还要另外增加支付费用。短途旅客的列车车票可以在各车站的自动售票机处购买。短途旅客的列车车票可以在各车站的自动售票机购买，而长途列车车票则要到车站内的“绿窗口”处购买。
您可以使用设置在售票处的专用自动售票机购买车票。电子显示屏显示英文，说明购票的方法。
此外还可以利用比较便宜的快速电车到达东京车站，不过行驶时间稍长。
日本的铁路以正点和安全性高而著称。日本最大的铁路公司是JR(日本铁道)集团。它的铁路线如同蛛网般地网罩了日本国土全境。
在日本的铁路线上有乘坐快捷舒适的超特快列车－新干线列车。新干线列车通常被列为向外国旅客推荐的交通工具。新干线每隔十几分钟就有一班从东京开往国内各主要城市的列车。
日本的列车车票价格除了根据乘坐距离远近而不同之外，乘坐特快列车、快车等种类的列车和乘坐绿列车(头等列车)、对号入座、卧车等座席种类有所不同的列车时还要另外增加支付费用。
短途旅客的列车车票可以在各车站的自动售票机处购买。长途旅客的列车车票在车站内的"绿窗口"处向服务人员购买。如果要预约什么的，也要到"绿窗口"处办理。
新干线有多条路线。除多数游客经常利用，可连接东京与博多间之“东海道·山阳新干线”外，还有连接东京与八户（青森县）间之“东北新干线”、连接东京与新泻间之“上越新干线”、连接东京与长野间之“神圣长野新干线”、于九州运行之“九州新干线”（目前新八代（熊本县）至鹿儿岛中央（鹿儿岛县）间已开通）等各路线。
新干线的种类
东海道·山阳新干线分为“Nozomi号”、“Hikari号”和“Kodama号”三种，其所停靠的车站各不相同。例如东京至新大阪区间，“Nozomi号”只在品川、新横滨、名古屋、京都、新大阪停车，“Hikari号”除“Nozomi号”所停靠车站外的车站也停车（停靠车站依据列车种类而异），而“Kodama号”在新干线上所有车站停车（东京-新大阪区间共计16处）。
座位的种类
座位分为“自由席”、“指定席”和“绿(头等)”的三种。
主要区间所需时间和费用（成人票）
∙ 东京-仙台 大约1小时40分钟
车费10590日元
∙ 东京-新泻 大约2小时3分钟
车费10270日元
∙ 东京-名古屋 大约1小时45分钟
车费6090日元＋特快车票4690日元(指定席)/3980日元（自由席）
∙ 东京-新大阪 大约2小时30分钟
车费8510日元＋特快车票5540日元(指定席)/4730日元(自由席)
∙ 东京-博多 大约5小时15分钟
车费13440日元＋特快车票8880日元(指定席)/7770日元(自由席)
∙ 新大阪什么是美貌效应-名古屋 大约50分钟
车费3260日元＋特快车票3120日元(指定席)/2410日元(自由席)
∙ 新大阪-博多 大约2小时30分钟
车费9350日元＋特快车票5540日元(指定席)/4730日元(自由席)
日本铁路周游券(Japan Rail Pass)
旅客可以在一定的期间内任意使用日本铁路周游券搭乘JR铁路的全国线路，包括新干线列车(希望号(Nozomi)除外)。
日本铁路周游券要在出发之前购买，可在日本航空或全日空的当地办事处领取周游券的兑换票。到达日本后在车站的“绿窗口”或者旅行资讯中心以及成田和关西国际机场将兑换票兑换成日本铁路周游券时，同时还可以订好座位。
有了日本铁路周游券以后，就可以几乎是毫无限制地(新干线的新型特快列车"希望号(Nozomi)"除外)接连乘坐与JR有关的巴士和轮渡了。
日本铁路周游券的票价
有效期间 普通车 绿列车
7天 28,300日元 37,800日元
14天 45,100日元 温柔木马 61,200日元
21天 57,700日元 79,600日元
小贴士：准备到日本来旅行的外国旅客必须事先在海外的日本旅行社代理店买好"周游券的兑换票"。外国旅客到了日本以后，要去指定的日本国内换票处(JTB International、日本旅行、近畿日本Tourist、东急观光等的海外办事处以及跟上述这些旅行服务公司有合作关系的当地地方旅行社)，凭事先买好的"周游券的兑换票"，并出示盖有"临时逗留者"印章的护照，换取日本铁路周游券。
私营铁路浙江同志
在日本的各个城市里除了JR(日本铁道)集团营运的铁路线以外还运行着很多私营的铁路线。这些铁路线主要是供日本人上下班和学生上学来回乘坐的交通工具。这些铁路线连接的大多数是城市郊外的住宅区和城市的市中心区。另外，如果您是想到著名的游览地箱根、日光和奈良这些地方去观光游览的话，建议您乘坐这些私营铁路列车去。
东京周围的主要铁路公司
箱根方向 小田急电铁(Odakyu Electric Railway)
日光方向 东武铁道(Tobu Railway)
成田国际机场 京成电铁(Keisei Electric Railway)
东京国际(羽田)机场 京滨急行电铁(Keihin Electric Express Railway)
在东京的市中心区移动时方便的地铁 东京地铁(Tokyo Metro)
大阪周围的主要铁路公司
奈良方向 近铁／近畿日本铁道(Kintetsu Railways/Kinki Nippon Railway)
京都方向 京阪电铁(Keihan Railways)
神户方向 阪急电铁(Hankyu Electric Railways)
关西国际机场 南海电铁(Nankai Electric Railways)
地铁
东京地下铁公司经营的地铁乘车基本费用规定为6公里以内160日元，随后依乘车距离依次递增为190日元，230日元。都营地铁的票价比东京地下铁公司的地铁稍贵，即4公里以内为170日元，随之递增为210日元，260日元。如途中需在两公司的地铁之间转乘，则可享受低于双方地铁合计车费40日元的优惠。
地铁车票一律用自动售票机购买。这种售票机基本上与JR按键式售票机相同。但在与JR及私有铁路联接的地铁线路的各站点上，也有一种必须先按“目的地站铁路公司种类”键，
再按金额键的自动售票机。另外，东京地下铁公司地铁为了覆盖东京都中心部的所有车站，在票价为160日元及190日元日元2类的行驶区间内，使用一种无需按键确认，只将钱币投入，就能取得相应车票的自动售票机。
此外，地铁乘车基本费用虽然没有折扣优惠，但在东京的地铁，可以使用一种不用买票，只需在上、下车时通过自动检票机就能将票价自动扣除的“地铁IC卡”。东京地下铁公司发行的“SF地铁卡”借壳上市案例与都营地铁发行的“T ”都是通用的，按金额分为1000日元，3000日元，5000日元3类，可无限期使用。使用“地铁IC卡”，因为无需查询票价及购票，所以对于经常使用地铁的乘客来说是十分便捷的。
京都地铁乘车券
京都地铁乘车券种类很多，分普通券、特定打折券、回数券（普通回数券、白天打折券、夜晚打折券）、市
巴士和地铁通用券以及各线连乘通用券等等。各种票价按区间计算，京都共有5个区间（1
个区间大致相当3公
里）。
地铁基本票价：一区、成人200日元，儿童100日元。
市巴士和地铁通用基本票价：成人360日元，儿童180日元
京都观光一日游券：成人1,200日元，儿童600日元（含巴士、地铁）
京都观光二日游券：成人2,000日元，儿童1,000日元（含巴士、地铁）
京都站前地铁信息电话：075-371-4474（7：30～20：00）
在东京、大阪、京都、名古屋、横滨、福冈及札幌都有地铁，尤其在东京，地铁与JR线火车纵横交错，称为极重要的城市交通工具。这种交通工具稳快而又价廉，票价根据距离的远近而定，东京的电车最低票价是130日元，地铁的最低票价是160日元。在车站的入口处都设有大型自动售票机，进站及出站都是自动检票，因此车票必须保留，以便出站时使用。
另外，还有一种“一日乘车券”，在一天之内随便上下车，特别适合市内一日观光，票价才600~1000日元左右。
3. 公路
高速公路非常发达，以东京至小牧、小牧至西宫、吹田至下关的公路为首，东北纵贯、九州纵贯、北陆中央等都已全线贯通。此外，还有东京内的首都高速、连接各高速公路的外环高速等，每年都有新的高速公路建成。
从东京到各主要城市之间所需的时间
出发地 目的地 所需时间
东京：JR新宿车站 JR仙台车站斯蒂文斯皮尔伯格 5.5
东京：JR东京车站 鹿岛神宫车站 2
东京：JR东京车站 JR静冈车站 3
东京：JR东京车站 JR名古屋车站 6
东京：JR新宿车站 京都车站 7
东京：JR池袋车站 大阪：JR梅田车站 8
东京：JR东京车站 JR神户车站 9
东京：JR新宿车站 福冈：西铁福冈车站 14.5
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