AAV病毒包装实验常见问题的解答

AAV病毒包装实验常见问题的解答
平遥地震腺相关病毒载体介导的感染效率⽐真核表达质粒的要⾼,且⽬的
大嘴泉
基因表达稳定,⽬前已经被⼴泛应⽤于体外细胞和体内动物实验
中⽬的基因的功能研究、模型建⽴和临床试验等。越来越多实验
室的课题都要⽤到AAV病毒包装,不过在实验的过程中会出现很
多问题,⽐如载体构建、质粒抽提纯化异常、病毒滴度过低甚⾄
出不了毒等等情况。今天来聊聊这⽅⾯的问题,看看病毒包装⾼
质量的交付受到哪些因素影响,怎样能做得更好。
Q1:腺相关病毒是什么?和实验室⽤的A A V载体的区别在哪⾥?
答:腺相关病毒,即Adeno-Associated Virus (AAV), 是⾃然界中存在的天然病毒,基因组上有rep基因和cap基因,因此也叫野⽣型腺相关病毒(图⼀),即wide type AAV(wtAAV);实验室⽤的AAV载体,是在腺相关病毒的基础上经过⼈⼯改造的质粒,基因组上没有rep基因,因此也叫重组腺相关病毒,即recom
binant AAV(rAAV)。没有特别指出的时基因,
和cap基因
候,简称AAV⼀般是指已经改造过的AAV载体。
图⼀(来源:参考⽂献1)
Q2:腺相关病毒有哪些特点,A A V适合做哪些下游实验?
答:腺相关病毒是⼀种⼩型⽆包膜病毒,属于细⼩病毒科,包含⼀个单链线性DNA基因组,长度约为4.7kb,其⾐壳蛋⽩由VP1、VP2和VP3三种蛋⽩构成,在1965年从腺病毒分离株的污染物中⾸次被发现。
Q3.腺相关病毒进⼊宿主细胞之后,其基因组会整合到宿主细胞基因组中
吗?
答:野⽣型腺相关病毒wtAAV感染⼈体细胞后,由于其rep基因、ITR序列结构和宿主基因组的相互作⽤,可能倾向整合到19号染⾊体短臂上的AAVS1位点,在⼩⿏中是倾向整合到ROSA26基因位点;⽽改造过的重组型腺相关病毒rAAV,由于基因组上已经去除了rep和cap基因,因此失去了整合到宿主基因组的特性。rAAV在体内组织,特别是在肌⾁组织中,在宿主基因组染⾊体以外以附加⼦(episome)的双链DNA形式存在,持续稳定表达⽬的基因。
稳定持续表
Q4.怎样实现A A V在动物体内稳
达?
答:从以下⼏个⽅⾯进⾏优化以顺利实现AAV在动物体内的持续稳定表达。
1)不同的⾎清型AAV对组织有偏向性,即在靶组织⾥⾯表达更稳定(图⼆)。根据⽂献已经报道的结果和⾃⾝课题实验设计,选择合适的⾎清型AAV,通过细胞表⾯特异性受体感染细胞,提⾼转染效率;研究深⼊之后,可以对⾐壳蛋⽩进⾏合理设计、定向进化和计算机辅助设计来筛选获得突变型的⾐壳蛋⽩,在靶向组织特异性和表达⽔平持续性上进⾏不断改善。
图⼆(来源:参考⽂献4)
2)根据研究的⽬的基因和感染的靶器官组织类型,选择合适的启动⼦。⼴谱型的启动⼦有:CMV、CAG、CBG和EF1a;如果靶向中枢神经系统星形胶质细胞,可以选择GFAP和shortGFAP启动⼦;如果想在肝脏中特异表达,选择TBG、ALB或者ApoEHCR-hAAT作为启动⼦,增强组织靶向性效果更好。
3)注意使⽤合适的AAV病毒量和滴度,感染动物时AAV病毒⽤量不是越多越好,当⽤量太多,由于病毒溢出效应的影响,⽬的基因的表达量反⽽降低。
4)对靶器官进⾏局部多点注射,使得AAV载体⽬的基因就近表达,表达效果和特异性更好。
Q5.A A V病毒载体对⽬的基因的⼤⼩是否有要
求?
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答:AAV载体的总容量是4.7kb左右(图三),由于载体中固有的启动⼦序列、PolyA序列以及两个ITR序列,这三个元件的序列总和在1200bp左右,同时可能还带有荧光标记或者抗性标记序列。所以AAV载体携带⽬的基因的时候,⽬的基因的长度建议不超过3kb。
Q6.A A V在动物体内的表达量⽐体外细胞⾼的原因
是?
答:由于AAV的基因组是单链DNA,进⼊细胞后需经过由单链变成双链的过程,才能开始转录翻译。体外培养的细胞体系中如果没有辅助病毒或者辅助因⼦的情况下,这种DNA单链转变成DNA双链的过程⾮常缓慢,所以⽬的基因表达滞后;⽽AAV注射进动物体内之后,靶器官组织⾥的各种辅助因⼦相对丰富,有助于AAV在体内快速表达,表达⽔平和持续时间更加稳定。
适合做动物实
Q7.为什么说A A V病毒载体适
验?
答:1)AAV的感染效率⾼于慢病毒LV,⽽其免疫原性低于腺病毒ADV;
2)利⽤不同⾎清型的AAV,能特异靶向神经系统、眼睛、肌⾁和肝脏等多种不同类型的器官组织;
3)转导途径简便,浓缩好的病毒可以直接多点注射靶器官;
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4)可以在体内稳定持续表达6个⽉以上,满⾜多种实验验证要求。
Q8.在动物实验中,需要注射多少总量的A A V病毒载
体?
答:研究AAV介导的外源基因功能,进⾏动物体内实验,根据动物实验低剂量、中剂量和⾼剂答:
量的分组,AAV的病毒总量⽤量约为1x1011VG/Kg、1x1012VG/Kg和1x1013VG/Kg.
Q9.⽤于动物体内实验的A A V病毒,是否需要纯化与浓
缩?
答:很有必要,AAV病毒的纯化和浓缩是病毒包装中的必需步骤。细胞裂解液中含有⼤量的病毒⾐壳蛋⽩、宿主细胞碎⽚、⾎清和细胞毒素等多种成分,这些杂质如果直接被注⼊动物体内,会导致宿主强烈的免疫反应。如果病毒滴度太低,达不到感染特定靶器官组织的⽬的。因此AAV载体经过纯化和浓缩之后,有利于后续动物体内实验顺利进⾏。具体详情可点击查看:关于AAV载体空壳率,你想了解的这⾥总结好了
Q10.A A V实验的安全注意事
项?
答:虽然AAV载体⽬前已经被全世界学术界和⼯业界⼴泛使⽤,没有报道过意外,但不排除有可能存在未知的潜在风险。AAV载体的实验操作要在符合⽣物安全防护等级⼆级实验室资质(Biosafety laboratory-2, BSL-2)的实验室中进⾏,在实验室专门区域进⾏,避免产⽣⽓溶需要对所有接触过AAV病毒载体的实验器具进⾏消毒处理。装有AAV载胶。每次实验后,
每次实验后,需要对所有接触过
体的培养瓶,需标明危险品。对实验室的成员进⾏安全培训和风险提⽰。
Q11.实验的时候怎么稀释病毒,有哪些注意事
项?
答:根据实验要求,可以⽤PBS溶液、⽣理盐⽔或者完全培养基将病毒稀释到所需要的滴度。使⽤时,将病毒样本放置在冰浴上效果更好,稀释好的病毒样本尽量⼀次性⽤完。
Q12.表⽰病毒滴度的单位有哪
些?
答:重组病毒的滴度有多种单位表⽰,这些表⽰形式的不同主要是由于病毒载体本⾝的⽣物学特点不同、不同的测定⽅法以及过去使⽤约定俗成的习惯造成的。
1)TU/mL是Transduction Unit/mL的缩写,转导单位,多⽤于慢病毒载体;
2)PFU/mL是Plaque Forming Unit/mL的缩写,指噬菌斑形成单位,常⽤于腺病毒载体和单纯疱疹病毒载体;
3)VG/mL是Vector Genomes/mL的缩写,是指每mL病毒液中含有的基因组拷贝总数,⼀般⽤于表⽰AAV腺相关病毒载体的滴度。
Q13.转染效率很低,怎么
办?
答:AAV转染的时候,需要保证细胞⽣长状态良好、合适的细胞密度和优化过的感染条件。此外转染试剂很关键,建议⽤Lipo3000转染试剂。
扭力Q14.做病毒包装实验时,有时候做出来的病毒滴度很低,甚⾄不出毒,稳定性很差,为什么?
答:病毒包装涉及多个操作步骤,有⼏个⽅⾯需要注意:
1)不使⽤来源不清的质粒,尽量使⽤成熟稳定的商业化载体系统;
2)细胞培养和细胞转染时,需注意细胞密度是否适中和出毒期间细胞的活⼒;
3)按操作说明进⾏转染,注意排查质粒抽提纯化的异常情况以及⽬的基因的⼤⼩、序列和蛋⽩功能等情况是否对病毒包装产⽣影响。
Q15.A A V包装好之后,需要什么样的运输和保存条
件?
答:AAV病毒包装好之后,⽤⼲冰运输寄送。使⽤时应避免反复冻融,根据实验需要适当分装于-80℃保存,可以保存⼀年左右;-20℃保存2周左右;4℃保存⼀周。
Q16.如果不想做病毒包装实验这么⿇烦,有什么解决⽅案
吗?
答:病毒包装需要有昂贵的实验设备,操作步骤繁多,需要做质粒转染、细胞裂解、上清收集、病毒颗粒纯化和滴度纯度检测等多项质控,这些环节任何⼀个出问题都需要来回很长时间摸索验证。现在
Scilia提供AAV病毒包装的⼀站式服务,您只需提供穿梭质粒或者所感兴趣的基因名字,选择做过表达还是做⼲扰表达,剩下的交给Scilia来帮您实现。Scilia将给您提
供⾼质量⾼滴度的AAV病毒,您拿到病毒后,就可以尽快开始做下游的实验了。
⼩结:
接下来将继续分享总结AAV在科学研究领域的新进展,让⼤家了解更多实验知识避开不必要的坑,更⾼效顺利完成实验。最后,对AAV病毒包装实验有兴趣的⼩伙伴们欢迎⼤家⼀块沟通探讨。Scilia有项⽬经验丰富的专门团队和业内⼤咖给⼤家答疑解惑,助⼒您的科研项⽬。
参考⽂献
1. R. Jude Samulski, Nicholas Muzyczka. AAV-Mediated Gene Therapy for Research and Therapeutic Purposes. Annual Review of Virology. 2014, 1(1): 427-51.
cctv3同一首歌2. Toyokazu Kimura, Beatriz Ferran, Yuko Tsukahara, et al. Production of adeno-associated virus vectors for in vitro and in vivo applications. Scientific Reports. 2019, 9(1):13601.
3. Claire Domenger, Dirk Grimm. Next-generation AAV vectors-do not judge a virus (only) by its cover. Human Molecular Genetics. 2019, 28(R1):R3-R1
4.
4. Chengwen Li, R Jude Samulski . Engineering adeno-associated virus vectors for gene therapy. Nature Reviews Genetics. 2020, 21(4): 255-272.

本文发布于:2024-09-21 19:27:10,感谢您对本站的认可!

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