snapgene设计引物_带你玩转生物学软件之SnapGene

snapgene设计引物_带你玩转⽣物学软件之SnapGene

各位⼩伙伴⼤家好，今天正式开⼀个新坑：带你玩转分⼦⽣物学系列，本系列帮助⼤家迅速上⼿各种⽣物学软件，每周更新⼀款常⽤软件，⼤家有其他想要了解的分⼦⽣物学软件也可在下⽅留⾔或后台发送名称，尽可能的满⾜⼤家的要求。

SnapGene是⼀款分⼦⽣物学常⽤的应⽤设计软件，该软件提供了直观的⽤户操作界⾯，拥有丰富的模块供⽤户选择，能够帮助⽤户⽅便的分析酶切位点、标签、启动⼦、终⽌⼦和复制⼦等质粒原件，更够⽣成详细质粒图谱、进⾏引物设计和PCR克隆设计等操作，以下是软件的基本使⽤教程。

1.开始⼀个序列

新建DNA⽂件，输⼊相应核酸序列。输⼊序列若为质粒，在Topology option选择Circular；输⼊序列若为⽚段，在Topology option选择Linear，以下以最常⽤的质粒为例。在File Name处为相应序列命名。

显⽰质粒，质粒存在的相应feature⾃动添加。

海尔w36

左侧⼀系列⼩图标为常⽤⼯具快捷键。

其中是对酶切位点进⾏选择性显⽰的快捷键，亦可通过上⽅Enzymes进⾏操作；其中是对feature进⾏显⽰的快捷键，亦可通过上⽅Features进⾏操作，可以对feature进⾏添加、删除、编辑以及输出feature应⽤于其他snapgene等；其中可显⽰质粒图谱的开放阅读框及转录⽅向，同时可对⽣成的ORF进⾏翻译选择；其中可进⾏翻译三到⼀以及⼀到三转化；其中可选择其他序列与当前序列进⾏序列⽐对，该操作亦可通过上⽅tool⼯具操作进⾏。

在可可西里回头

下⽅图标，可快速进⾏质粒相关内容切换，满⾜不同需求的操作。远期现货

显⽰质粒序列：可看到具体核苷酸序列及质粒元件，可通过点击元件对其进⾏重命名、修改图标等⼀系列操作。

显⽰酶切位点：可看到所有限制性酶切位点及其所处于质粒序列的位置。

显⽰质粒元件：显⽰所有元件，亦可对其进⾏相应编辑

我是海的女儿2. 引物设计与PCR

增添引物序列：选中所需引物序列15-30bp，⾃动出现引物长度及对应Tm值微分算子

苍南县第一实验小学

在上⽅Primers-Add Primer，确认正向/反向引物及引物名称即可成功添加。

反向引物可通过点击Reverse complement完成。

PCR：Action中选择PCR，出现下图，可在初始设置引物Tm值。

引物设计如上所述，可添加构建所需预设限制性内切酶位点及保护碱基。为产物命名，保存⽂件。

3. 模拟克隆构建

snapGene打开构建所需质粒，点击Action-Insert Fragment

Vector：可在左侧选择酶切位点，以及对应质粒分区

Insert：选择保存的PCR产物⽂件，PCR产物⽣成见上述

如能正确⽣成最终产物，将在下⽅⽰意图中出现闭合环装质粒，此时可为产物命名，点击clone。

模拟电泳

点击

可对Marker进⾏修改，有多个品牌供货商提供的MW Marker可选

可对每个泳道进⾏编辑，添加所需样品，最多添加9个电泳样品，要求为保存在本地的SnapGene可打开的⽂件即可。⽣成下图⽰例

受限于篇幅长度，SnapGene常⽤功能各位⼩伙伴有什么对该软件其他⽅⾯的使⽤疑问，可在评论区留⾔，我们会尽可能解决你的每⼀个疑虑，预祝愿⼤家科研顺利！

本文发布于:2024-09-20 21:27:18，感谢您对本站的认可！

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