betaor,se,p,zscore换算总结帖（20211014更新）

水泥砂浆

betaor,se,p,zscore换算总结帖（20211014更新）对GWAS的summary⽂件进⾏整合时，经常需要在beta，or, se, p, zscore之间进⾏换算，故在此总结⼀下。希望对⼤家有帮助。

1. se 计算

润叶1.1 有 beta、p ，计算se；

se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F))

1.2 有 or、p ，计算se；

se=abs(log(or)/qnorm(p/2))

2. zscore计算

2.1 有 beta、p ，计算zscore；

c=-qnorm(p/2)

情况1：beta > 0，zscore = c

情况2：beta < 0，zscore = -c

2.2 有 or、p ，计算zscore；

c=qnorm(1-p/2)

情况1：or > 1，zscore = c

情况2：or < 1，zscore = -c

2.3 有 beta、se ，计算zscore；

zscore=beta/se

2.4 有 or、se ，计算zscore；

zscore=log(or)/se

注意：这⾥的se指的是log(or)的se，plink给出的se就是默认log(or)的se

3 beta 和 OR 的转换

beta to OR:阀体铸造

Beta = log(OR)

OR to beta:

OR = exp(beta)

Assuming the confidence interval being used is 95%,the upper and lower bounds for the OR:

upper bound of OR = OR + se(OR) x 1.96

lower bound of OR = OR - se(OR) x 1.96

Log(upper bound of OR) = upper bound of beta

Log(lower bound of OR) = lower bound of beta

upper bound of beta = beta + se(beta) x 1.96

酿酒酵母lower bound of beta = beta - se(beta) x 1.96

If you have the 95% C.I of beta, then calculating the SE(beta) is quite simple!

for example if beta = 0.5 and the upper C.I is 0.6 then

upper C.I of beta = beta + se(beta) x 1.96

0.6 = 0.5 + se x 1.96儒林外史的讽刺艺术

>宜黄高速

本文发布于:2024-09-22 09:29:30，感谢您对本站的认可！

标签：总结需要默认阀体酿酒讽刺

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