人类蛋白质图谱:完整人类蛋白质组的表达图谱

⼈类蛋⽩质图谱:完整⼈类蛋⽩质组的表达图谱
2003年,瑞典研究⼈员启动了⼈类蛋⽩质图谱项⽬。该项⽬由马蒂亚斯·乌赫尔·n教授领导,得到克努特和爱丽丝·沃伦伯格基⾦会的⽀持。这是⼀项独⼀⽆⼆的世界领先努⼒,在这项努⼒中,⼈类蛋⽩质组的系统研究是在抗体的帮助下进⾏的。⼈类蛋⽩质图谱展⽰了⼈体所有主要组织和器官中蛋⽩质表达的完整图谱。
⼈类蛋⽩质图谱项⽬已经产⽣了整个⼈类蛋⽩质组的表达图谱。为了实现这⼀点,为所有编码蛋⽩质的⼈类基因产⽣了⾼度特异性的⾼级抗体,组织阵列被⽤于在许多细胞和组织中建⽴蛋⽩质谱。应⽤是⼈细胞系的免疫荧光染⾊( ICC - IF )、蛋⽩质印迹分析( WB )和免疫组织化学( IHC )。还对稳定表达GFP标记的靶蛋⽩的HeLa细胞系中的抗体⼦集进⾏了分析,并在siRNA的帮助下,进⼀步验证了⼀些抗体。特定于应⽤程序的验证提供表达式数据。
为了获得最⾼⽔平的特异性、多功能性和再现性,在⼈类蛋⽩质图谱项⽬中开发的抗体被精⼼设计和制造。在项⽬早期,全世界的研究⼈员对获得开发的抗体表现出极⼤的兴趣。因此,Atlas抗体旨在将抗体商业化,并使研究界能够获得这些抗体。
⼈类蛋⽩质图谱代表⼈类蛋⽩质组的基于组织的图谱;经过11年的研究,这项⼯作于2014年完成。公众可以访问交互式数据库中的所有蛋⽩质表达谱数据,从⽽可以对⼈类蛋⽩质组进⾏基于组织的分析。
⼈类蛋⽩质图谱展⽰了基于组织的图谱,这是⽬前对⼈类蛋⽩质组理解的概要。此外,⼈类蛋⽩质编码基因是根据它们在⼈体所有关键组织和器官类型中的蛋⽩质表达来划分的。从组织特异性、药性、致癌性和调控等7个不同⾓度,深⼊介绍了所有特征性⼈类蛋⽩的定位和表达信息。
这项研究揭⽰了⼀个意想不到的发现,即⼈类组织特异性蛋⽩质相对较少。近50 %的蛋⽩质被归类为在所有细胞中表达的管家蛋⽩质。已经确定⼈体仅含有2300种富含组织的蛋⽩质,即它们在特定组织中的表达⽔平增加。
为了构建表达谱,针对⼈类基因产物的抗体⽤于染⾊组织微阵列,也称为TMAs,其包含来⾃20种不同癌症类型、44种不同正常⼈类组织和44种不同⼈类细胞系的样品。问题图谱上所有蛋⽩的表达谱都是基于免疫组织化学。所有蛋⽩质表达数据都与单个基因的RNA测序数据相关。
这44个正常组织⼀式三份,被标注为76种不同的细胞类型。此外,所有正常组织图像都经过了基于病理学的表达⽔平注释,并显⽰在组织图谱上。相应组织的mRNA表达数据显⽰在蛋⽩质表达数据旁边。这种mRNA表达数据是从来⾃37种主要不同正常组织类型的RNA (也称为RNA - Seq )的深度测序中获得的,⽽蛋⽩质数据涵盖了17000多个可获得抗体的基因( 85 % )。
为了补充免疫组织化学染⾊的组织,该地图集⽤来⾃⼩⿏脑不同细胞区域、类型和⼦域的免疫荧光染⾊组织来标记⼩⿏脑地图集。⽼⿏⼤脑图谱上的基因是根据功能、差异-整体-和细胞表达来选择的,
这些在⼈脑中可能不容易被覆盖。
显⽰正常组织中RNA表达的部分组织图谱视图,以及基于特定蛋⽩质的IHC染⾊的基于知识的注释。主数据视图显⽰44个正常组织中IHC染⾊的原始数据。点击图像可以⾼分辨率查看这些内容。⼈类蛋⽩质图谱hn1a基因组织图谱条⽬截图。
细胞图谱是⼈类细胞的图谱,是由⼈类蛋⽩质图谱创建的。这张图谱揭⽰了定位于细胞中结构、亚结构和细胞器的⼈类细胞蛋⽩质组。澳门美好世界
这项令⼈难以置信的⼯作是通过使⽤抗12000多种蛋⽩质的抗体对细胞系进⾏⾼分辨率共聚焦显微镜检查来完成的。⼈类蛋⽩质图谱成功地将12000多种⼈类蛋⽩质的亚细胞位置映射到32个完全不同的亚细胞结构。将所有定位于某⼀结构的蛋⽩质分组,使得确定13个关键细胞器的蛋⽩质组成为可能。布谷鸟2012
这项研究为细胞内究竟发⽣了什么提供了新的有趣见解。在这种情况下,⼀个令⼈惊讶的发现是,⼀半的蛋⽩质在多个细胞室中被检测到。
细胞图谱显⽰了免疫荧光共聚焦显微镜下的亚细胞定位。研究在三个不同来源的细胞系中进⾏,结果显⽰为免疫荧光染⾊细胞的多⾊、⾼分辨率图像。对于免疫荧光分析,每种抗体选择三种⼈细胞系。基于RNA测序数据选择来⾃⼈类细胞系组的我在真理教的⽇⼦2细胞系对。u - 2os总是第三个细胞系。
⼈类蛋⽩质图谱项⽬所采⽤的独特⽅法⾸次有助于解决某些基本⽣物学问题,例如:⼈类基因组中编码细胞类型特异性蛋⽩质的部分在家政蛋⽩质⽅⾯有多⼤,或者不同细胞类型间差异表达的蛋⽩质有多⼤?这与确定的细胞功能、形态和分⼦途径有何关系?多亏了⼈类蛋⽩质图谱,现在有了更多研究和解释⼈类⽣物学的⼯具。
⼦途径有何关系?多亏了⼈类蛋⽩质图谱,现在有了更多研究和解释⼈类⽣物学的⼯具。
一个死刑犯的遗嘱字典是⼈类蛋⽩质图谱中的便利⼯具。他们的⽬的是使⼈们能够理解和应⽤⼈类蛋⽩质图谱中的信息,也是学习和解释⼈类组织病理学、组织学和细胞⽣物学的重要⼯具。字典中有四部分——癌症组织学、正常组织学、蛋⽩质表达和细胞结构。
字典的正常组织学部分基于⼈体组织的代表性部分;这些部分以三个放⼤级别显⽰。癌症字典是基于临床肿瘤组织的代表性苏⽊精-伊红( HE )染⾊切⽚。细胞器结构在细胞结构词典中有描述,带有免疫荧光和⾼分辨率共聚焦显微镜图像。蛋⽩质表达字典显⽰著名蛋⽩质和细胞类型标记的IHC染⾊组织。
阿特拉斯抗体提供来⾃⼈类蛋⽩质阿特拉斯的抗体。我们提供多种⾼度验证的研究抗体——三重我在真理教的⽇⼦2多克隆体和precia单克隆体——靶向超过75 %的⼈类蛋⽩质组。
三重我在真理教的⽇⼦2多克隆抗体是在⼈类蛋⽩质Altas项⽬中开发和表征的初级抗体。这21000种兔多克隆抗体覆盖了⼈类蛋⽩质组的75 %,并在IHC、WB和ICC - IF中得到验证。对于每种IHC抗体,您可以浏览每种抗体的500张IHC图像。crpd-366
中药制剂precia单克隆是⼩⿏的主要单克隆,具有独特的抗原设计以获得最佳特异性。它们是以确定的特异性绘制的表位,并且是⽤于多路复⽤的同种型。
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