光密度测量

我这里说的免疫组化图片,是这样的一类图片:染上的颜是黄,如果染得浓,就呈现棕黄。(制作样品的过程可别问我。我不知道)
要比较不同切片的光密度值来确定它们之间的蛋白表达的差异,首先要注意的就是这些切片样品要用尽可能完全一致的方法来处理。最近看到一个新技术挺不错,就是把各个样品定位后,各切出一个小细条,整整齐齐排成一个阵列,包埋在蜡块中,切成一片切片,然后进行免疫组化反应及染处理。这样在一个载玻片上就有了数百个小切片,不仅它的的切片染条件一致,还节省了抗体试剂。
切片当然首先得拍成照片才能进行分析。拍照也是一个重要环节,在显微镜下拍摄免疫组化照片需要注意以下几个要点:
1.所有照片必须在完全同样的显微镜条件下拍摄,在更换样品时,除了调整焦距和视野外,显微镜上的其他部件都不能动!所有的样品必须一次拍摄完全。特别是在拍摄过程中,不要一会用高倍镜,一会用低倍镜,来回切换物镜。当然,在使用高倍镜时对焦及寻视野会稍麻烦一点,但也没办法。保持各张切片的拍摄条件一致更重要。
2.数码相机必须设置为手动曝光,并且保持每张照片用同样的曝光条件,同样的曝光时间,同样的光圈。特别要注意的是,一定要将数码相机的自动白平衡功能给关掉!!!
3.免疫组化切片一般染不太深,因此拍摄出的照片颜较浅,就让它浅。拍摄出的照片中空白部位应尽可能呈现纯白。测量其灰度应在230-240之间。如果呈现淡蓝,一般是相机自动白平衡在起作用。另外一个因素是显微镜灯光电压不正确。要使灯光本身的温正确。既不偏黄,也不偏蓝。下面两张照片中左边一张是合适的曝光,右边那张不好。 
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hbchendl edited on 2007-06-12 09:36 
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2006-04-07 18:22      
打开要分析的图片后首先要进行光密度校正。
点开intensity calibration窗口后,选std option density,并点option按纽,在弹出的窗口里点insident旁边的image按纽。弹出第三个窗口后,将鼠标移到图片的空白处点一下,就可以看到current value的值会显示出点击部位的灰度值。白的背景能达到250左右,而拍得较暗的照片或者背景偏蓝的照片则只有200甚至更低。
一张照片的背景强度不会是完全一样的。所以要在照片各个不同的空白处都点一下,看看它们的值差别大不大。许多相机拍的显微镜照片是中间稍亮,四周暗。所以最后确定的背景值只能是取它们的折中。
较正背景的值会在曲线的X轴端中表现出来。 
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2006-04-07 18:39      
光密度校正窗口可以放在屏幕上随时检查,有时候在切换了图片后其光密度校正值会有变化。
现在可以调出count/size窗口,先选择测量项目,前面说过density mean是不合适的测量参数,IOD也有点误差,不过这是系统误差,对半定量分析的影响不大。所以可以选用IOD与area两个测量项目。当然把选中区域转换成灰度图片再测量更好。
另外对option也要适当设置一下。 
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2006-04-07 18:50   江苏交广网   
然后要保存count/size窗口的设置,点count/size窗口的 file -- save settings,将当前的测量设置文件保存,最好与图片文件存在同一个文件夹里,免得以后不到。文件扩展名是 .env 。保存这个文件的目的是为了制作宏操作用的。
下面就可以选择颜了,点select colors ,取HSI颜系统,S与I都选0到255,H选0到30左右。这基本上包括了黄区域。
然后也要保存颜设置文件。 
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2006-04-07 18:59      
下面就可以测量光密度值了,点count,然后到statistics窗口中查看测量值。
IOD SUM 与area SUM是有意义的测量值。IOD SUM是图片中黄区域的累积光密度,area SUM则是选中的黄区域的面积。 
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标签:照片   图片   测量   切片
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