总RNA提取
1. 取50-100四川行政财贸管理干部学院
西北风呼啸的中午 mg(新鲜或-70℃及液氮中保存的组织均可)置1.5ml匀浆器中,加入1ml TRIzol充分匀浆,室温静置10 尉氏县水立方
min。 语义网络分析
2. 加入0.2 ml氯仿,振荡15s,静置10 min。
3. 4℃离心,12000 g×15 min,取上清置另一1.5ml离心管中。(宁少勿多)
4. 加入0.5ml异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置10min。
5. 4℃离心,12000g×10 min,弃上清。
6. 加入1ml 75%乙醇,轻轻洗涤沉淀。4℃离心,7500g×5 min,弃上清。(DEPC处理的水配制)
7. 晾干,加入适量的DEPC H 2 O溶解(65℃促溶10~15 min)。
8. 快速电泳检测RNA完整性。
图1:稀土作为战略资源的特殊价值完整的RNA与降解的RNA之间的比较。 分别取2微克的降解总RNA及完整总RNA与Ambion的RNA Millennium Markers™一同进行1.5%的变性琼脂糖凝胶电泳。在完整RNA样品中可以清楚地观察到18S和28S核糖体RNA。而降解的RNA则表现为较低分子量的弥散。 纯RNA:1.7 <OD260/280<2.0(<1.7时表明有蛋白质或酚污染;>2.0时表明可能有异硫氰酸残存)。纯 RNA的内丹修炼的四个
过程OD260/230比值为2.5,若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类),盐类或有机溶剂污染。(OD260/OD230与OD260/OD280均用于判断RNA纯度) 注意事项:
1.样品量和TRIzol的加入量一定要按照步骤1的比例,不能随意增加样品量或减少TRIzol量,否则会使内源性RNase的抑制不完全,导致RNA降解。1 ml 的 Trizol 最多只能裂解 100 mg 的组织。Trizol 里面是含有 RNA 酶抑制剂的,如果组织过量,Trizol 无法完全浸润组织无法完全裂解组织,多余组织内的 RNA 酶等物质会导致 RNA 的降解。这是 RNA 降解的很重要的原因。
2.实验过程中必须严格防止RNase的污染。
3.所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6h或更长时间。
4.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿冲洗。
5.配制的溶液应尽可能的用0.1%DEPC在37℃处理12h以上,然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的 试剂 ,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22um滤膜过滤除菌。
6.完整的总RNA在进行变性凝胶电泳时会产生清晰的28S和18S rRNA条带(真核样品)。28S rRNA条带的强度应当大致为18S rRNA条带的两倍。这种2:1的比率(28S:18S)是判断RNA完整性的一个很好的指标。目前有一种快速简单的方法可以替代传统的凝胶分析方法,这种方法可以同时对RNA样品进行定量及质量评估。Agilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies)是第一款商业化的提供RNA样品状态细节信息的微流体仪器。