RNA与DNA提取

RNA与DNA提取
一.DNA的提取方法简介
为了研究DNA分子在生命代谢中的作用,常常需要从不同的生物材料中提
取DNA.由于DNA分子在生物体内的分布及含量不同,要选择适当的材料提取DNA。
动植物中,小牛胸腺?动物肝脏?鱼类精子,植物种子的胚中都含有丰富的DNA。
微生物中,谷氨酸菌体含7%~10%,面包酵母含4%,啤酒酵母含6%,大肠
肝菌含9%~10%。
从各种材料中提取DNA方法不同,分离提取的难易程度也不同。
对于低等生物。如从病毒中提取DNA 比较容易,多数病毒DNA 分子量较小,提取时易保持其结构完整性。
从细菌及高等动植物中提取DNA难度大一些。细菌DNA 分子量较大,一般
心有林希达2×10 道尔顿。因此易被机械张力剪断。细菌DNA,除核DNA 外,还有质粒DNA 等。
1、核酸的理化性质
RNA和核苷酸的纯品都呈白粉末或结晶,DNA则为白类似石棉样的纤维状物。除肌苷酸、鸟苷酸具有鲜味外,核酸和核苷酸大都呈酸味。
DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水,不溶于乙醇、氯仿
有机溶剂,它们的钠盐比游离酸易溶于水,RNA钠盐在水中溶解度可达40g/L。DNA在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。在酸性溶液中,DNA、RNA易水解,在
中性或弱碱性溶液中较稳定。
天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细
胞中提取DNA 时,先把DNP抽提出来,再把P除去,再除去细胞中的糖,RNA
及无机离子等,从中分离DNA 。
DNP和RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响而不同。DNP在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在0.14 mol/L的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度的1%,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至1mol/L氯化钠中的溶解度很大,
比纯水高2倍。
RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响较小,在0.14mol/L氯化钠中溶
解度较大。因此,在提取时,常用此法分离这两种核蛋白。
2.细胞的破碎
细菌有坚硬的细胞壁,首先要破碎经胞。方
法有三种:①机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法;②化学试剂法:用SDS处理细胞;③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可使细胞壁破碎。
由于高等动物DNA 主要存在于细胞核与线粒体中,所以提取时有两个困难(高等植物与此类似):
①破碎细胞难;从处死动物?分离组织器宫到破碎细胞费时长。在此时期间DNA 可能会被DN ase降解,而动物组织:特别是肌肉组织很难破碎,即使是较
易破碎的肝?肾等组织也往往使用组织匀浆器,易造成DNA 断裂。
②分子量大,一般比细菌的大2—3个数量级,比病毒的大4—5个数量。
对不同生物材料,要根据具体情况选择适当的分离提取方法。
3.DNA提取的几种方法
(1).浓盐法
利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常用的方法是用
1M 氯纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少量辛醇的氯仿一起摇荡,使乳
中国实验方剂学杂志
化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.
也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.
两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.  无水醋酸钠新闻
以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS可有助于蛋白质与DNA 的分离。在提取过程中为抑制组织中的DNase对DNA 的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取DNA.
(2).阴离子去污剂法:
用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA.
(3).苯酚抽提法:水葫芦喊冤
苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用.用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。此时DNA是十分粘稠的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。此法的特点是使提取的DNA保持天然状态 .
( 4).水抽提法:
利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌法搅出.然后分别用66% ?80%和95%乙醇以及丙铜洗涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取
的DNA中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加以改良,在提取过程中加入SDS.
二,植物病毒的RNA提取:
大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。
一、材料
提纯TMV病毒液(10mg/ml)。考风考纪
二、设备
冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。
三、试剂
TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿,3M NaAc(pH5.2),乙醇(100%和70%),TE 缓冲液,无RNA酶的双菌水。
四、操作步骤
1、取一eppendorf管加入提纯TMV(10mg/ml)400ml,再加入等体积酚/氯仿,盖紧管盖后用手充分振荡1分钟,4℃下12000g离心10分钟。
2、吸取水相于一新eppendorf管,再用酚/氯仿抽提,直至水相和有机相交界面无蛋白为止。
3、吸取水相于新eppendorf心管,加入等体积氯仿,用手倒置离心管数十秒,4℃下12000g离心10分钟。
4、取水相,加入1/10倍体积的3mol/L NaAc(pH5.2),2.5倍体积的冰冷乙醇,混匀,-20℃30分钟。
5、4℃下12000g离心15分钟,小心弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀,4℃下12000g离心5分钟。
6、小心弃去上清液,沉淀真空干燥5分钟或空气干燥10分钟,并溶于无RNA酶的双菌水或TE缓冲液中。
7、取10ml进行电泳分析,另10ml用于cDNA合成。
[注意] 1、整个操作应尽可能在低温下进行。
2、由于病毒RNA镶嵌于外壳蛋白里面,因此要充分剥去病毒外壳蛋白,一般需要多次进行酚/氯仿的抽提。
动植物组织mRNA提取:
一、材料
水稻叶片或小鼠肝组织。
二、设备
研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰箱,冷冻真空干燥器,紫外检测仪,
电泳仪,电泳槽。
三、试剂
1、无RNA酶灭菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,
然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。
2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然
后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。李商隐咏史
3、1×层析柱加样缓冲液;20mmol/L Tris?Cl(pH7.6),0.5mol/L NaCl,
西门子cx651mmol/L EDTA(pH8.0),0.1% SDS。
4、洗脱缓冲液:10mmol/L Tris?Cl (pH7.6),1mmol/L EDTA (pH8.0),
0.05% SDS。无水醋酸钠新闻

本文发布于:2024-09-22 13:32:21,感谢您对本站的认可!

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