T载使用中常见问题word资料9页

Q-1:TA克隆的原理?
大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时都会在PCR产物的3′末端添加一个“A”,T载体是3′带有一个“T”的载体,在连接酶作用下,完成连接,其连接液可以直接用于细菌转化,大大方便了实验操作。TA克隆的原理请见下图:
Q-2:蓝白斑筛选的原理?
蓝白斑筛选原理是:载体上携带一段细菌的lacZ基因,它编码β-半乳糖苷酶的一段146个氨基酸的α-肽,载体转化的受体菌为lacZ△M15基因型。这样,载体同宿主通过互补,具有完整的β-半乳糖苷酶的活性。如果在载体的lacZ基因中插入外源DNA,造成lacZ基因缺失,不能合成α-肽,失去同宿主的互补,不能形成有功能的β-半乳糖苷酶,失去分解X-gal的能力。在X-gal平板上,含阳性重组体的细菌为白菌落(质粒载体)或无噬菌斑(M13噬菌体载体);非重组体转化的细菌为蓝菌落或蓝噬菌斑。
Q-3:Takara有哪些常用的PCR产物克隆用T载体,各有什么特点?
常用的PCR产物克隆用T载体及各自的特点请见下表:
Code No.
产品
特点
昆廷 布赖斯应用
3275
pBackZero-T Vector Cloning Kit
由pUC19改建,阳性克隆率极高而背景极低。它消除了pUC19载体上的lacZ基因及多克隆位点,并对β-lactamase (bla) 基因进行了独特的改造,可以定向克隆。
使用时需在待插入的DNA片段的上、下游Primer的5′端加上TTTAA 5个碱基。如果需要进行定向克隆,只需在一条引物的5′端加上TTTAA 5个碱基。 PCR产物3′端有“A”,TA克隆。
6011
pMD18-T Vector Cloning Kit
由pUC18构建,含有多克隆位点,可以进行蓝白筛选,无方向性克隆。
PCR产物3′端有“A”,TA克隆。写给每一个自己
6013
pMD19-T Vector Cloning Kit
由pUC19构建,含有多克隆位点,可以进行蓝白筛选,无方向性克隆。
PCR产物3′端有“A”,TA克隆。
3271
网上书屋
T-Vector pMD19 (Simple)
由pUC19构建,不含有多克隆位点,可以进行蓝白筛选,无方向性克隆。
PCR产物3′端有“A”,TA克隆。根据实验需要,可以在引物的5'端导入酶切位点。
6012
pSIMPLE-19 EcoR V /BAP Vector
由pUC19构建,不含有多克隆位点,是种平末端去磷酸化载体,可以进行蓝白筛选,无方向性克隆。
与5′端磷酸化的平末端PCR产物进行连接。
社会科学战线
3270
T-Vector pMD服务质量20
由pUC19构建,含有多克隆位点;并对lacZ基因进行改造,降低假阳性,可以进行蓝白筛选,无方向性克隆。
PCR产物3′端有“A”,TA克隆;含有SP6 Promoter,可以对插入的DNA进行体外转录。
Q-4:pMD19-T Vector与pMD18-T Vector相比,有何不同?
pMD19-T Vector与pMD18-T Vector相比,β-半乳糖苷酶的表达活性更高,菌落显示蓝的时间缩短,菌落显示的蓝更深。pMD18-T Vector连接转化后,一般要经37℃过夜培养,然后再将其于冰箱内放置一段时间后,其蓝白菌落才能显。而pMD19-T Vector涂板培养后一般只需10个小时(37℃)便可以显。因此,pMD19-T Vector比pMD18-T Vector更适合于蓝白菌落的筛选。
Q-5:使用Takara的T载体,对感受态细胞有什么要求?
lsd法转化时请使用高效的感受态细胞(转化效率≥1×108 cfu/μg pUC19),这样才可能得到比较理想的阳性克隆。如果需要进行蓝白筛选时,宿主细胞必须具有正确的基因型(F′编码的[lacZ△M15])产生ω Fragment,才可能和载体DNA产生的lacZ α多肽相结合,表现出β-半乳糖苷酶活性(α-互补性),才可以进行蓝白筛选。通常使用的JM109,DH5α等细胞均可进行蓝白筛选。
Q-6:使用Takara的T载体,对Insert DNA有什么要求?
使用Takara克隆用T载体,对Insert DNA有以下的要求:
1.Insert DNA应该进行切胶回收的纯化处理后才进行载体连接,尽量避免引物等其它杂质的存在。切胶回收时可使用Takara凝胶回收试剂盒(Code No. 9762)。
2.Insert DNA的使用量及计算方法。
进行克隆时,Vector DNA和Insert DNA的摩尔数比一般为1:3~10,可以根据具体的实验情况选择合适的Vector DNA和Insert DNA的摩尔数比。
Insert DNA使用量的计算方法如下:
Insert DNA的使用量(ng)=nmol数×660×Insert DNA的bp数
Takara的T载体1 μl(50 ng)的摩尔数约为0.03 pmol。
Q-7:如何计算感受态细胞的转化效率?
取0.1 ng的pUC19 Plasmid DNA加入至100 μl的感受态细胞中进行转化,再加入900 μl的SOC培养基(0.1 ng DNA/ml),将上述培养液稀释10倍后(0.01 ng DNA/ml)取100 μl涂布平板(0.001 ng DNA/100 μl),记录菌落数。以得到200个克隆体为例计算转化效率,此时的转化效率=200 cfu/0.001 ng=2×105 cfu/ng=2×108 cfu/μg pUC19 DNA。
Q-8:使用Takara的T载体,转化后的菌落全为蓝(或淡蓝),但有目的DNA片段的插入,为什么?
插入的DNA片段较短(小于500 bp),且插入片段没有影响lacZ基因的读框,此时平板培养基上出现的菌落有可能呈现蓝(或淡蓝)。
Q-9:使用Takara的T载体,怎样提高连接转化效率?
应该从以下几点进行改善
1.确认Insert DNA片段的3′末端是否带有“A”尾。大部分的高保真DNA聚合酶(如:Pyrobest、PrimeSTAR HS、KOD、PfxPfu等)扩增的PCR产物是平滑末端,不能直接进行TA克隆。
2.纯化PCR产物。最好使用切胶回收的PCR片段,以除去PCR产物中的非特异性片段和引物等杂质。进行切胶回收时可以使用Takara凝胶回收试剂盒(Code No. 9762)。
3.请使用转化效率大于108 cfu/μg pUC19 DNA的感受态细胞。
4.DNA片段的立体结构、DNA片段的长短都会影响克隆效率。一般情况下,大片段DNA的克隆效率(连接效率与转化效率)偏低,此时可以延长连接反应时间,或采用电转化方
法。
5.进行切胶回收纯化DNA片段时,不要使DNA片段在紫外线下暴露时间过长。
6.Solution I应尽量避免反复冻融。
7.建议使用新配制的平板培养基。
Q-10:使用Takara的T载体,欲对克隆DNA片段进行测序时,使用何种引物?

本文发布于:2024-09-24 13:17:30,感谢您对本站的认可!

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