DNA测序样品的要求

DNA测序样品的要求
未纯化PCR产物的要求1. 片段大于200bp;
2.请提供50ml PCR扩增产物(总量1ug-2ug);
3.取3ml样品,应该能够清晰的分辨出目的条带;自带引物,引物浓度
为5-10uM,并请注明。
1995年语文高考第一题
备注
纯化后PCR产物的要求1.PCR产物溶于蒸馏水中(请勿溶解在TE溶液中);顺铂的不良反应
2.浓度大于20ng/ml,体积大于10ml,长片段需适当增加量;
3.电泳检测条带专一;自带引物。
所有
模板均应提
供相应的引
物信息
自带质粒的要求1.质粒溶于30~50ml ddH2O中(请勿溶解在TE溶液中),电泳检测浓度大50~100ng/ml;
2. 建议用相关试剂盒提取质粒;
3. 如有可能,同时提供1ml含有相应质粒的菌液备用;
乙醇偶合制备C4烯烃4. 需注明载体和插入目的片段长度、以及测序要求。
菌液模板的要求1.说明载体抗性类型,我们提供A mp, Kan, Tet及Chl四种抗生素;
2. 其余类型抗生素需自备;应为高拷贝质粒,对于低拷贝质粒,请直接提供约1mg纯化质粒;
3. 提供1ml左右过夜培养(12h)的菌液,加15%灭菌甘油,于E ppendorf 管中封口保存,防止交叉污染或渗漏;
4. 大量样品测序,建议在一次性塑料培养皿固体培养基上穿刺培养;
5. 建议尽量提供穿刺培养或斜面培养的菌种(装在EP管中)。
自带引物的要求1.浓度不低于5pmol/ml(或5umol/L),溶液体积15-50ml;
王连笑2. 随机引物(RA PD引物)和简并引物以及引物长度不足15bp不能用于
本公司提供如下通用测序引物:M13+,M13-,T7, SP6, T7 ter,BGH rev, pGL3+, pGL3-,pGEX5’,pGEX3’,5’AOX1,3’A OX1 ,a-factor。其他引物请自带或提供序列由我们合成。
数字信号处理系统常用载体特征
PCR类型测序模板注意事项
∙总反应体积建议为50uL或100uL,扩增结束后取3ul用1%左右的琼脂糖电泳检测,应为单一的条带。
3ul样品总量不低于50ng(非常小的PCR产物可以酌情减小),PCR产物产量过低说明PCR扩增结果不是很理想,应改进条件重新扩增。
∙对于有杂带和扩增弥散的PCR产物,需经琼脂糖电泳将目的片段切下来并回收,建议将PCR产物作克隆后进行测序。有杂带的和扩增弥散的PCR产物即使通过琼脂糖电泳纯化,测序仍有可能出现双峰等异常结果。
∙经上述检测合格的PCR产物,需经过琼脂糖电泳纯化去除未反应的引物,dNTP,引物二聚体等影响测序反应的组分。有多种纯化方法可供选择,P romega,Qiagen和生工等公司都有相应的产品可供选择。纯化后的PCR产物经电泳检测估计总量应不低于200ng/Kb(非常小的PCR产物可以酌情减小)。∙与质粒模板相比,PCR产物彼此间差异很大,因此,每个PCR模板应尽可能提供相应的PCR退火温
度和PCR产物的长度,以供测序时参考。
∙PCR模板一般不应短于200bp,过短的PCR产物应经克隆后进行测序。
∙纯化好的PCR产物应溶于双蒸水中,TE缓冲液会严重影响测序反应。
∙若让公司对PCR产物进行纯化,PCR产物需满足∶总量不低于1ug/kb,片段长度不低于200bp
∙各种PCR测序模板均应提供相应的测序引物,并尽可能提供引物的全序列,并将引物浓度准确稀释到5pmole/ul 。
引物浓度的换算关系∶
总ng数= pmole x 分子量/1000
由于PCR产物测序相对较难,为使您能拿到一个好的结果,请尽量满足上述要求。会计 审计
DNA测序常见问题分析及解决办法总结

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