一 Sanger测序仪简介
Sanger测序仪可一次接受1个96孔板。
甲基丙烯酸正丁酯
包括标记DNA片段的每排8个样品(样品设置)自动变性,接着被毛细管电泳分离。每次分离之后,在8根毛细管中的可替换媒介(分离胶)都被自动替换。分离胶是由一个容易替换的胶管供给的,它能有效的供应1块96孔板。 检测是在四个光谱信号中由激光诱导的荧光决定的。四染料标记终止反应试剂盒用于对样品进行碱基序列分析。染料标记引物则用于对样品产生的片段长度进行分析。分离之后,8根毛细管中的每根产生的原始数据信号都自动处理产生高质量的碱基序列或片段序列。原始数据和分析数据储存在数据库里,都能够以与普通分析应用程序兼容的格式输出。 三 收费情况
1质粒和菌液
2 pcr测序
网络视频服务器软件
三 数据分析
1)引物之后的20bp甚至50bp之内的序列是不准确的,这主要是因为残存的染料单体造成的干扰峰所致,该干扰峰和正常序列峰重叠在一起;另外,测序电泳开始阶段电压有一个稳定期。
2)序列末端容易产生N值,峰图较杂。由于测序反应的信号是逐渐减弱的,所以序列末端的信号会很弱,峰图自然就会杂乱,加上测序胶的分辨率问题,如果碱基分不开,就会产生N值。
3)每个测序反应会提供两个结果,一个是序列,一个是峰图;序列可以用Word,写字板等软件打开,峰图可以用Chromas软件及其他综合性软件打开。
ssl协议4)常见异常峰图及其分析
峰图是以4种颜连续的峰型图代表A、T、G、C 4种碱基序列的图。
峰的高低说明了信号的强弱,宽窄表示的是分离效果,可以对比板胶电泳的亮度和条带的宽窄。重叠则说明了样品中有长度相同但是序列不同的片段。
概念:
fareast读长:序列读取的碱基长度,峰图上方横向显示的数字。
信号:测序序列是通过对不同碱基所携带的不同颜的荧光信号翻译所得,荧光信号的强弱是我们常说的信号
1)可能原因一:模板中有碱基缺失,往往是单一位点或两个位点碱基缺失导致测序结果移码。
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解决方法:将PCR产物克隆到质粒中挑单克隆测序,或将PCR产物进行PAGE纯化后再进行测序。