意大利蜜蜂6-丙酮酰四氢蝶吟合酶(PTS)的生物信息学分析

2019年8月蜂业硏究
头孢噻吩研究论文
69
意大利蜜蜂6-丙酮酰氢蝶吟合酶(PTS)
佳能s45的生物信息学分析
舒蕊刘健章玉萍张丽丽陈明代君君范涛
(安徽省农业科学院蚕桑研究所,合肥230031)
摘要:四氢生物蝶吟是芳香族氨基酸発化酶的必需辅酶,其合成不足或代谢缺陷会导致动物罹患多种神经性疾病,6-丙酮酰四氢蝶吟合酶是四氢生物蝶吟合成代谢途径中的关键酶。本研究采用生物信息学方法,对意大利蜜蜂6-丙酮酰四氢蝶吟合酶编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、疏水性、跨膜区、结构功能域以及空间二级结构和三级结构等方面进行分析和预测,并构建了系统进化树。分析结果显示,意蜂6-丙酮酰四氢蝶吟合酶基因全长是829bp,含有一个429bp的开放阅读框,编码142个氨基酸,属于亲水性蛋白,即非分泌蛋白,二级结构主要由a-螺旋构成,系统进化树分析结果与传统的生物学分类结果相符。实验结果可为进一步开展意蜂6-丙酮酰四氢蝶吟合酶基因家族的功能研究和应用提供信息参考。
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关键词:意大利蜜蜂;6-丙酮酰四氢蝶吟合酶基因;生物信息学
Bioinformatical analysis for6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin
synthase(PTS)of Apis mellifera
Shu Rui,Liu Jian,Zhang Yuping,Zhang Lili,Chen Ming,Dai Junjun,Fan Tao
(Institute of Sericulture,Anhui Academy of A gricultural Sciences,Hefei230031,China) Abstract:In this study,we analyzed and predicted the composition of amino acid sequence,physical and chemical properties,hydrophobicity,transmembrane domain,structural domain,secondary structure and tertiary structure of the Apis mellifera6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase(PTS)by bioinformatics methods,and also constructed the phylogenetic tree.The results showed that6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase(PTS)from Apis mellifera had the total length of 829bp,encoded142amino acid,belonged to hydrophilic protein,and its secondary structure was mainly composed of a-helix.The results of phylogenetic tree analysis were consistent with the results of traditional biological classification. These experiment results would provide information references for further function research and application of Apis mellifera6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase gene family.
Key words:Apis mellifera^6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase;bioinformatics
蜜蜂是昆虫膜翅目家族中的重要成员,不仅是重要的农业经济昆虫,也是科学研究中的模式生物。我国饲养的西方蜜蜂品种中,黄蜂种占有较大比重,特别是以意大利蜜蜂为主的黄蜂种。意蜂中的个体表现出不同程度黄体:雄蜂为黄到暗棕,绒毛淡黄尤为明显;工蜂的腹部具两个黄环带的个体居多,绒毛淡黄;蜂王的腹部多为黄到暗棕,尾部黑,只有少数蜂王通体都是黄。黄蜂种及其杂交种遍布全国各地,在养蜂生产中发挥着重要作用⑴。然而,意蜂黄体的形成机制一直未解。
基金项目:安徽省农科院院长青年创新基金项目“蜜蜂伽®基因的克隆与表达及功能鉴定”(17B0611);国家蚕桑产业技术体系合肥综合试验站(CARS-22-SYZ09);安徽省蚕桑中药材产业技术体系(ahnycytx-16);经济昆虫资源多功能利用科技创新团队(15C0606)作者简介:舒蕊(1989-),女,助理研究员,农学硕士,主要研究方向为蜜蜂分子与生物化学,E-mail:1057211556@qqkappa系数
通讯作者:范涛(1962-),男,研究员,农学学士,主要从事经济昆虫与蚕桑资源综合利用研究,E-mail:fantaolll6@sohu;
代君君(1975-),女,副研究员,农学硕士,主要从事经济昆虫资源综合利用研究,E-mail:daijunjunl218@126
中国蜂业

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