肠道菌是一个非常复杂的微生物落，对人类健康有着重要的影响。肠道中100多万亿个微生物表现出高代谢活性，并与宿主免疫系统持续对话。此外，肠道菌是一些代谢物、激素和神经调节因子的重要来源，它们直接调节肠道功能以及间接调节肝脏、大脑、肾脏等肠道外器官的功能。
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肠道菌对人体健康和胃肠道生理的影响是一个迅速发展的研究领域。多项研究表明，平衡的肠道菌对健康至关重要，这意味着人体健康在很大程度上取决于肠道菌的组成和功能。我们每个人都有着自己独特的肠道菌组成，就如同我们的指纹一样，是独一无二的。多种因素可能影响肠道菌的组成，并可能增加肠道菌失调的风险，包括饮食、压力、抗生素的广泛使用、衰老等等。
宿主和肠道菌之间的交流是双向的。这种肠道菌与宿主之间的相互作用在免疫系统中尤为明显。肠道微生物影响免疫系统的发育和功能。另一方面，宿主的免疫系统（先天性和适应性免疫系统）决定了肠道菌的组成和多样性。
强有力的证据表明，肠道微生物对胃肠道本身的生理机能有重要影响，同时也影响着肠道外器官的功能，包括肝脏、肾脏、大脑、心血管系统和肌肉骨骼系统等等。肠道细菌与肠道外器官的沟通直接通过Toll样受体或者间接通过不同的细菌代谢物和信号分子来完成。肠道菌在人体生理中起着至关重要的作用并参与了肠道内与肠道外许多慢性疾病的病理生理过程。
肠肝轴
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冲绳海槽从生理学角度看，肠肝轴是肠道菌与肠道外器官之间最重要的联系之一，它代表了肠道
和肝脏之间功能密切的双向交流。
众所周知，肝脏不仅不断暴露于消化和吸收的产物，而且还暴露于各种肠源性因子，包括细菌和细菌组分，比如脂多糖。肝门静脉是由消化道的毛细血管汇集、从肝门处入肝的一条粗大静脉。肝门静脉系统定义了肠肝轴并强调了肠道与肝脏之间密切的解剖和功能相互作用。生理上，肠肝轴保护宿主免受来自肠道的潜在有害和有毒物质的伤害，从而维持免疫系统的稳态。当肠道屏障被破坏并表现出通透性增加时，肝脏就会自动暴露于来自肠道的许多有毒因素以及肠道细菌。肠道菌失调将进一步放大这些过程。
肠道中的有害物质和细菌进入肝脏会损害肝脏健康。肝免疫系统的激活可诱导促炎症通路，也可能影响肝细胞的抗病毒和抗凋亡通路。这些作用可能是有害的（激活免疫反应，释放促炎细胞因子），也可能是有益的（肝脏细胞保护和再生）。值得一提的是，肝脏不仅接受微生物的进入，还可以通过胆汁酸和免疫球蛋白A抗体反过来影响肠道微生物，从而在控制肠道菌组成方面发挥重要的调节作用。
我们对肝脏疾病，尤其是肝硬化的理解，在过去的十多年中随着肠道菌的研究发生了巨大的变化。动物和人类实验研究表明，许多肝脏疾病与肠道菌失调有关。近年来，肝脏
疾病的患病率和死亡率不断攀升。最常见的慢性肝病包括酒精性肝病和非酒精性脂肪肝，最终可能发展为肝硬化和/或肝癌。更好地理解肠道菌失调、肠道屏障完整性和肝脏对肠源性因子的免疫反应之间的病理生理联系对于开发慢性肝病的新疗法或至少防止病情的进展和并发症的发生至关重要。iphd
肠道菌与酒精性肝病
公安部孙正良简介过度饮酒是全球慢性肝病的主要原因之一。酒精性肝病的初期通常表现为脂肪肝，进而可发展成脂肪性肝炎，最后是肝硬化和/或肝癌。不仅仅是酒精摄入量，宿主遗传和环境因素的相互作用也可能导致酒精性肝病肝损伤的发生。
此外，实验和临床数据表明，肠道菌也可能在酒精性肝病的发病中发挥重要作用。肠道细菌和饮酒引起的肝损伤之间的潜在联系早在20多年前就被提出了。1995年，北卡罗莱纳大学教堂山分校的研究人员首次发现，使用抗生素清除肠道细菌可以防止大鼠长期暴露于酒精后的肝脏损伤。1996年，西班牙的研究团队发现酒精性肝硬化患者存在小肠细菌过度生长并推测其可能在酒精性肝病的发病中发挥作用。2017年，澳大利亚昆士兰大学的一项荟萃分析进一步支持了这一观察结果，即与健康对照相比，慢性肝病患者小肠细菌过度生长的发生率更高。此外，还发现了厚壁菌门和拟杆菌门细菌之间的失衡，慢性肝病患者肠道中厚壁菌门细菌明显减少，拟杆菌们细菌增加。
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