tcga数据下载_⼿把⼿帮你分析这些TCGA甲基化内容 TCGA数据库有⼤量开放的甲基化数据，对我们科研⾮常有利，但是怎么挖掘呢？是不是去参加培训班就可以了？答案肯定不是的。有很多⼈去参加了培训班，然后学会了分析。但是搞了两三个⽉，还是没有结果。导致结果出不来的罪魁祸⾸就是⽹速和⾃⼰的电脑。⾸先，⽹络就是⼀个⼤问题，很多时候在医院或者学校都是⼀⼤堆⼈共⽤的⽹络，平均下来每⼈只有⼏m，这样的⽹络来下载⼏⼗g的数据，往往需要很久很久，⽤⼀两个⽉是很正常，⽽且在⽹速⽐较慢的情况，下载过程很容易断掉，然后⼜要重新下载，这样反反复复，最后什么都没有下载到，下载到都想砸电脑了。
下载好了数据，还有就是数据提取整理的过程，这个过程也是⾮常痛苦的，如果你实验室或者课题组或者⾃⼰⽐较⼟豪有价值⼏万元的计算机（服务器），那么这个问题就不是问题，直接忽略掉。如果你是⾃⼰平时办公室配备的电脑或者⾃⼰笔记本，这个问题就是⼤问题了，利⽤perl或者python提取数据都会⾮常消耗计算机⼤量内存，很多培训都是使⽤perl，会使CPU超负荷，来不及散热，普通电脑⼀下⼦就卡死了，严重的甚⾄死机。之前有同学⽤⾃⼰的笔记本跑，结果跑了⼀个⽉，还是不能把数据提取出来，最后来请我们帮忙。
福州月中华情数据整理好了，就要分析，这个过程是使⽤r分析，同样对电脑要求⽐较⾼，因为⽣成的矩阵⽐较⼤，差的电脑还是⾮常卡顿的，难以正常⼯作。
中财办谈共同富裕甲基化常见的分析如下：
2、转录组数据与甲基化数据合并，做相关性分析
3、提取关⼼基因（例如hub基因）的位点数据，并做相关性分析
王薄
4、⽣存分析
此外，还可以利⽤甲基化基因矩阵构建cox模型，还可以对关⼼基因的位点矩阵构建cox模型。
SCI狂⼈团队vip会员，可以免费领取上⾯的分析可以我们帮忙分析，出了分析外，我们还可以帮忙下载甲基化数据，提取位点数据。SCI狂⼈团队vip会员，可以免费领取这些服务（每年只有⼀次）。
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