表观遗传你了解多少?

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经典的遗传学(Genetics)⽆法解释同卵双胞胎为何长相并⾮⼀模⼀样,克隆三花猫为何⽑⾊不⼀致,因为这些变化不是由核酸序列改变引起的,⽽是与我们今天要介绍的表观遗传有关。
表观遗传(Epigenetics)是指,在核酸序列不发⽣改变的情况下,遗传物质出现了可遗传的变化,从⽽导致可遗传的表型改变。⽬前,表观遗传学已从⼀个少有⼈关注的领域变成如今的研究热点。
表观遗传现象
表观遗传的现象很多,已知的有DNA甲基化(DNA methylation)、基因组印记(genomic imprinting)、母体效应(maternal effects)、基因沉默(gene silencing)、核仁显性、休眠转座⼦激活和RNA编辑(RNA editing)等,表明表观遗传学确实在癌症、进化、发育等⽅向发挥着重要作⽤。
表观遗传学的常见机制
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表观遗传调控机制是⽣命现象中⼀种普遍存在的基因表达调控⽅式,主要有以下⼏种:山乡盼着你们来
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1.DNA 甲基化:在DNA甲基化转移酶的作⽤下将甲基选择性地添加到DNA分⼦上,DNA化学修饰的⼀种形式,能在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现;
2.DNA去甲基化:细胞中缺乏和减少细胞内的DNA甲基转移酶含量会引起DNA的去甲基化;
3.组蛋⽩修饰:组蛋⽩在相关酶作⽤下发⽣甲基化、⼄酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等修饰的过程;
4.染⾊质可接近性:⼤多数基因组中的染⾊质都紧密盘绕在细胞核内,但也有⼀些区域经染⾊质重塑后呈现出松散的状态,这部分DNA区域被称为开放染⾊质或可接近性染⾊质。染⾊质是否呈疏松结构是决定转录功能的关键因素;
5.⾮编码RNA调控:microRNA抑制转录后⽔平的基因表达⽽诱导功能缺失表型,及最近⼏年⽐较⽕的长链⾮编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)调控;
6.蛋⽩DNA互作:在许多的细胞⽣命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋⽩质之间的相互作⽤的问题。
表观遗传测序
表观遗传测序(Epigenetics Sequencing)是利⽤⾼通量测序,研究DNA修饰、基因表达及调控发⽣的可遗传变化。根据研究对象分为DNA和RNA两⼤类,进⼀步可划分为化学修饰、与蛋⽩质相互作⽤这两个主要细分领域。
⽬前基迪奥可提供的表观遗传测序服务主要有:染⾊质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)、全基因组甲基化测序(WGBS)、简化甲基化测序(RRBS)、染⾊体易开放区域测序(ATAC-seq)、甲基化DNA免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq)、RNA免疫共沉淀测序(RIP-seq)及甲基化RNA免疫共沉淀测序(MeRIP-seq)。
图1 基迪奥表观遗传测序技术整体介绍
下期我们将对DNA甲基化进⾏详细介绍,下表展⽰了三种DNA甲基化测序技术在检测范围、试验⽅法及检测范围等⽅⾯的异同点,感兴趣的⼩伙伴敬请期待下⼀期的内容吧。
WGBS RRBS MeDIP-seq
覆盖范围全基因组酶切位点的区域⾼甲基化、⾼CpG密度区域
实验⽅法Bisulfite处理Bisulfite处理+酶切富集抗体富集
精度单碱基(区分三种motif)单碱基(区分三种motif)约100bp
适⽤范围
全基因组⾼分辨率甲基化图谱研究;
样本量或基因组较⼩研究⼤样本量研究;
更适⽤于⼈和⼩⿏
⼤样本量研究
东北林业大学学报费⽤⾼较⾼较⾼

本文发布于:2024-09-23 12:31:47,感谢您对本站的认可!

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