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酶切位点保护碱基

PCR设计引物时酶切位点的保护

切割率 %酶寡核苷酸序列

2 hr20 hr

Acc I G GTCGAC C00

CG GTCGAC CG00

CCG GTCGAC CGG00

Afl III C ACATGT G00

CC ACATGT GG>90>90

CCC ACATGT GGG>90>90

Asc I GGCGCGCC>90>90

A GGCGCGCC T>90>90

TT GGCGCGCC AA>90>90

Ava I C CCCGGG G50>90

CC CCCGGG GG>90>90

TCC CCCGGG GGA>90>90

BamH I C GGATCC G1025

CG GGATCC CG>90>90

一周立波秀2011CGC GGATCC GCG>90>90

Bgl II C AGATCT G00

GA AGATCT TC75>90

GGA AGATCT TCC25>90

BssH II G GCGCGC C00

寒冷也是一种温暖迟子建

AG GCGCGC CT00

TTG GCGCGC CAA50>90

BstE II G GGT(A/T)ACC C010

BstX I AACTGCAGAA CCAATGCATTGG00 AAAACTGCAG CCAATGCATTGG AA2550

CTGCAGAA CCAATGCATTGG ATGCAT25>90

Cla I C ATCGAT G00

G ATCGAT C00

CC ATCGAT GG>90>90

CCC ATCGAT GGG5050

EcoR I GGAATTC C>90>90

CG GAATTC CG>90>90

CCG GAATTC CGG>90>90

Hae III Hind III Kpn I Mlu I Nco I Nde I

Nhe I Not I

Nsi I Pac I Pme I

老电工老王和李小燕

GG GGCC CC>90>90

AGC GGCC GCT>90>90 TTGC GGCC GCAA>90>90

C AAGCTT G00

CC AAGCTT GG00

CCC AAGCTT GGG1075

G GGTACC C00

GG GGTACC CC>90>90

CGG GGTACC CCG>90>90

G ACGCGT C00

CG ACGCGT CG2550

C CCATGG G00

CATG CCATGG CATG5075

CCATATG G00

CC CATATG GG00

CGC CATATG GCG00 GGGTTT CATATG AAACCC00

GGAATTC CATATG GAATTCC75>90 GGGAATTC CATATG GAATTCCC75>90

G GCTAGC C00

CG GCTAGC CG1025

城市房屋拆迁管理条例

CTA GCTAGC TAG1050

TT GCGGCCGC AA00 ATTT GCGGCCGC TTTA1010 AAATAT GCGGCCGC TATAAA1010 ATAAGAAT GCGGCCGC TAAACTAT2590 AAGGAAAAAA GCGGCCGC AAAAGGAAAA25>90

TGC ATGCAT GCA10>90 CCA ATGCAT TGGTTCTGCAGTT>90>90

TTAATTAA00

G TTAATTAA C025

CC TTAATTAA GG0>90

GTTTAAAC00 GGTTTAAAC C025

GG GTTTAAAC CC050 AGCTTT GTTTAAAC GGCGCGCCGG75>90

Pst I Pvu I

Sac I Sac II

Sal I

Sca I Sma I

Spe I Sph I Stu I Xba I Xho I

G CTGCAG C00

TGCA CTGCAG TGCA1010 AA CTGCAG AACCAATGCATTGG>90>90 AAAA CTGCAG CCAATGCATTGGAA>90>90 CTGCAG AACCAATGCATTGGATGCAT00

C CGATCG G00

AT CGATCG AT1025

TCG CGATCG CGA010

C GAGCTC G1010

G CCGCGG C00

TCC CCGCGG GGA50>90

GTCGAC GTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC00 GC GTCGAC GTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG1050 ACGC GTCGAC GTCGGCCATAGCGGCCGCG1075

GAA

G AGTACT C1025

AAA AGTACT TTT7575

金地九珑璧CCCGGG010

C CCCGGG G010

CC CCCGGG GG1050

TCC CCCGGG GGA>90>90

G ACTAGT C10>90

GG ACTAGT CC10>90

CGG ACTAGT CCG050

CTAG ACTAGT CTAG050

G GCATGC C00

CAT GCATGC ATG025

ACAT GCATGC ATGT1050

AAGGCCT T>90>90

GA AGGCCT TC>90>90

AAA AGGCCT TTT>90>90dif

CTCTAGA G00

GC TCTAGA GC>90>90

TGC TCTAGA GCA75>90

CTAG TCTAGA CTAG75>90

C CTCGAG G00

CC CTCGAG GG1025

精选文档

Xma I

CCG CTCGAG CGG1075

C CCCGGG G00

CC CCCGGG GG2575 CCC CCCGGG GGG50>90 TCCC CCCGGG GGGA>90>90

注释：

1．如果要加在序列的5‘端，就在酶切位点识别碱基序列（红）的5’端加上相应的碱基（黑），相同如果要在3‘端加保护碱基，就在酶切位点识别碱基序列（红）的3’端加上相应的碱基（黑）。

2．切割率：正确识别并酶切的效率

3。加保护碱基时最好选用切割率高时加的相应碱基。

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