亚硝酸反应
范围：可用于Aa定量和蛋白质水解程度的测定（Van slyke法） 注意：生成的氮气只有一半来自于Aa，ε氨基酸也可反应，速度较慢． 与酰化试剂的反应
Aa＋酰氯，酸酐－→ Aa被酰基化
北京网通公司 丹磺酰氯用于多肽链末端Ａa的标记和微量Ａa的定量测量．
烃基化反应
Aa的氨基的一个氢原子可被羟基（包括环烃及其衍生物）取代．
与2，4－二硝基氟苯（DNFB，FDNB玉女性经）反应
最早Sanger用来鉴定多肽或蛋白质的氨基末端的Aa
与苯异硫氰酸酯（PITC）的反应
Edman用于鉴定多肽或蛋白质的N末端Aa． 在多肽和蛋白质的Aa顺序分析方面占有重要地位（ Edman降解法 ）
形成西佛碱反应
Aa的α-NH2能与醛类化合物反应生成弱碱，即西佛碱（schiff ‘s base）
前述甲醛滴定：甲醛与H2N-CH2-COO-结合,有效地减低了后者的浓度,所以对于加入任何量的碱, [H2N-CH2-COO- ]/ [+H3N-CH2-COO- ]的比值总要比不存在甲醛的情况下小得多。加入甲醛的甘氨酸溶液用标准盐酸滴定时，滴定曲线B并不发生改变。 脱氨基反应
Aa在生物体内经Aa氧化酶催化即脱去α-NH2而转变成酮酸
α-COOH参加的反应
成盐和成酯反应
Aa + 碱 －→ 盐
Aa + NaOH －→ 氨基酸钠盐(重金属盐不溶于水)
ggg Aa-COOH + 醇－→ 酯
Aa+ EtOH －－－→ 氨基酸乙酯的盐酸盐
当Aa的陈映真COOH变成甲酯，乙酯或钠盐后，COOH的化学反应性能被掩蔽或者说COOH被保护，NH2的化学性能得到了加强或活化，易与酰基结合。Aa酯是制备Aa的酰氨or酰肼的中间物
成酰氯反应
当氨基酸的氨基用适当的保护基保护以后，其羧基可与二氯亚砜作用生成酰氯
用于多肽人工合成中的羧基激活
叠氮反应
氨基酸的氨基通过酰化保护后，羧基经酯化转变为甲酯，然后与肼和亚硝酸变成叠氮化合物
用于多肽人工合成中的羧基激活
脱羧基反应
-氨基和α-羧基共同参与的反应
与茚三酮反应
茚三酮在弱酸性溶液中与 -氨基酸共热，引起氨基酸氧化脱氨、脱羧反应，最后茚三酮与反应产物中的氨和还原茚三酮发生作用生成紫物质
三峡船闸
Pro与hyPro（羟脯氨酸）不释放氨，而直接生成黄化合物
定性，定量测定各种Aa，蛋白质
测定CO2 的量，从而可计算参加反应的Aa的量
成肽反应
一个Aa的NH2+另一个Aa的COOH可以缩合成肽，形成的键称肽键
侧链R基参加的反应
R功能基：
羟基，酚基，巯基（二硫键），吲哚基，咪唑基，胍基，甲硫基，非 -NH2,非 -COOH
酪氨酸的酚基在3和5位上容易发生亲电取代反应
二碘酪氨酸或一硝基酪氨酸和二硝基酪氨酸
酪氨酸的酚基可以与重氮化合物（对氨基苯磺酸的重氮盐）生成桔黄的化合物。——Pauly反应
组氨酸的咪唑基可以发生类似反应但产物颜为棕红 。
精氨酸的侧链胍基在硼酸钠缓冲液（pH 8-9, 25-35 C）中，与环已二酮反应，生成缩合物。 该缩合物在羟胺缓冲液中，重新生成Arg
氨酸的侧链吲哚基在温和条件下可被N－溴代琥珀酰亚胺（N-bromosuccinimide）氧化。此反应可用于分光光度法测定蛋白质中氨酸的含量，并能在氨酸和酪氨酸残基处选择性化学断裂肽键。
蛋氨酸侧链上的甲硫基是一个很强的亲核基团，与烃化试剂如容易形成锍盐（sulfonium salt）
此反应可被硫基试剂逆转。在逆转反应中，原有的甲基和新加入的甲基除去的机会是相等的，因此当用14C标记的处理时，获得的蛋氨酸将有50%是同位素标记的。
半胱氨酸侧链上的巯基（－SH）有很强的反应活性，可参与很多反应
二硫键的形成和打开
2R-SH + 1/2 O2 －→ R-S-S-R + H2O ；Cu2+，Fe2+ ， Co2+和Mn2+存在下，巯基的空气氧化将显著提高。
胱氨酸中的二硫键在稳定蛋白质的构象上起很大的作用。氧化剂和还原剂都可打开二硫键。过甲酸可以定量地打开二硫键，生成磺基丙氨酸（cysteic acid）残基。还原剂如巯基化合物（R-SH）也能打开二硫键，生成半胱氨酸残 基及相应的二硫化物巨无霸人体艺术
二硫苏糖醇（dithiothreitol，缩写为DTT），与胱氨酸中的二硫键反应形成一个含分子内二硫键的稳定六元环
巯基能和各种金属离子形成稳定程度不等的络合物. 对氯汞苯甲酸（p-chloromercuribenzoic acid）
由于许多蛋白质，如SH酶，其活性中心涉及-SH基，当遇到重金属离子而生成硫醇盐时，将导致酶的失活，因此制备这类蛋白质时应避免进入重金属离子
半胱氨酸可与二硫硝基苯甲酸（dithionitrobenzoic acid，缩写为DTNB）或称Ellman氏试剂发生硫醇-二硫化物交换反应
反应中1分子的半胱氨酸引起1分子的硝基苯甲酸的释放。它在时，在412nm波长处有强烈的光吸收，因此可利用比法定量测定-SH基
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