人胚海马酵母三杂cdna文库的构建和fmrp相互作用mrnas研究

中文摘要
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脆性x综合征是一种最常见的遗传性智力障碍性疾病,已经证实由脆性x智力低下蛋白(fragilementairetardationprotein,FMRP)的表达缺失引起。目前已知FMRP是RNA结合蛋白,其主要功能是结合某些特定类型的mRNAs,并参与调节某些特定的靶mRNAs的翻译,和/或参与这些mRNAs从细胞核至细胞质,或从神经元细胞质至树突和突触后的蛋白质合成位点的转运。具体致病机制尚不清楚,但各种研究结果提示可能是FMRP的缺失引起了某些靶mRNAs,特别是中枢神经系统的某些mRNAs生理功能异常,从而导致疾病。因此研究体内与FMRP发生相互作用的靶mRNAs有助于揭示FMRP缺失和各种临床表现之间的关系,。
酵母双杂交系统一直被广泛应用于研究蛋白质与蛋白质之间的相互作用。而酵母三杂交系统在此基础之上引入了一个可以在酵母体内表达RNA终产物的质粒载体,
如果表达的RNA产物可以和“诱饵”蛋白发生相互作用,就可激活报告基因的表达,从而筛选阳性克隆。因此被用于在真核细胞内研究蛋白质一RNA之间的相互作用。我们通过构建酵母三杂交eDNA文库,运用酵母三杂交体系分析RNA.蛋白质相互作用,研究与FMRP相互作用的mRNAs。
ad637本课题的主旨是用酵母三杂交系统筛选人胚海马内的FMRP靶mRNAs。脆性x综合征相关基因FMRl在大脑海马区活跃表达,因此我们选用19周胎龄人胚海马mRNA为材料,以RNA表达质粒
pRI-15’为载体构建酵母三杂交cDNA文库。最终得到的独立克隆数约为1×106,文库的插入片段平均长度约为400bp,有效重组克隆百分比约为95%。然后将脆性x智力低下基因FMRl的全长cDNA克隆到pYES质粒中,转入L40.ura3酵母菌株。用此质粒表达的YESTrp3/FMRP融合蛋白作为“诱饵”,对我们构建的文库进行筛查,筛选出在酵母体内与FMRP发生相互作用的靶mRNAs。
到论文结稿时止,共发现三个与之相结合的mRNAs,其中两个表达产物功能未知,另一个的表达产物是延伸因子19amma(EF-1T)。EF.1蛋白水平的增高与无义抑制的增加相关,另一方面,EF-1表达增加可能通过改变细胞骨架肌动蛋白来导致生长缺陷和细胞形态的变化,肌动蛋白相关的树突棘的形状和稳定性的改变是脆性x
综合征的特征之一。目前已有研究证实FMRP对EF。1基因的翻译起抑制作用。我们的研究结果发现FMRP与EF.1基因mRNAs之间存在相互作用,为阐明FMRP影响EF.1基因的表达提供了新的证据。
中国协和医科大学硕士论文
Abstract
LossoftheFMRP(fragileXmentalretardationpmtein)leadstofragileXsyndrome,themostcommonformofinheritedmentalretardation.FMRPisaRNA-bindingprotein,whosefunctionistointeractwithsomespecialmRNAs,andparticipateinregulationoftheirtranslation,and,ortransportthemfromnucleustocytoplasm,orfromeytoplasmtopmteinsynthesislocationofsynapsesanddendritesinneuron.Theconceptualmechanismisullknown,butithasbeensuggestedthatlossofFMRPleadstomisregulationofexpressionorfunctionofsomemRNAs,especiallythoseincentralnervesystem,which
disease.WehavetodefmethetargetmRNAsinteractingwithFMRPinvivoincausesthis
国贼查抄内幕ordertorevealtherelationshipbetweentheabsenceofFMRPandvariousclinicalmanifestations.
Theyeasttwo-hybridsystemiswidelyusedtostudyprotein-proteininteraction,whereasonthebaseofit,theyeasttri—hybridsystemintroducesaplasmidvectorwhichCanexpress‘'hybridRNA'’inyeastcells.Theinteractionbetweenthe‘'hybridRNA'’and‘'bait”proteinCanactivatetheexpressionofreportergene.Thus,the‘'positive’’cloneCanbeselected.Basedonthisreaction,theyeasttri—hybridsystemalenowusedtoanalyzetheprotein—RNAinteractioninvivo.Throughconstructingtheyeasttri-hybrideDNAlibrary,wecandosomeresearchtofindtheRNAsinteractingwithFMRP.
杨白冰模式Themain
topicofourresearchistousetheyeasttri-hybridsystemtoscreenthetargetmRNAsofFMRPinfetalhippocampus.FragileXsyndromerelatedgene-FMRlisac
tivelyexpressedinhippocampusareaofhumanbrain,SOwechosefetalhippocampusattheageof19weeksasOurexperimentalsampletoconstructtheyeasttri-hybrideDNAlibrary,whoseexpressingvectorWasRNAexpressionplasmid-pRH5’.We90tl×106clonesofthelibrary.Theaveragelengthoftheinsertsisabout400bp.Thepercentageofeffectiverecombinantclonesisupto95%.ThenwerecombinedthewholelengtheDNAofFMRlintopYESplasmids,thentransferredthemintoL40-urayeaststrain.weusedthefusionproteinexpressedbythepYESplasmidsasthe‘"bait’’toscreenthelibraryweconstructedtofindthetargetmRNAsinteractingwithFMRPinyeastcells.Uptonow,wehavefoundthreetargetmRNAsthatinteractwimFMRP.Thefimctionoftwoisunknown.andtheexpressionproteinofthemirdiselongationfactorlgamma(EF一11).Inyeast,increasedEF一1Aproteinlevelscorrelatewithincreasednonsense
suppression.Alternatively,increasedEF一1Aexpressionmightitselfingrowthdefectsandchangesincellularmorphologybyalteringashasbeenobservedinyeast.Actin—associatedalternationsindendriticspineshapeandstabilityareawellknownfeatureoffragileXsyndrome.SomeresearchhasprovedthatFMRPinhibitthetranslationofthisgene.OurresearchhasfoundtheinteractionbetweenFMRPandEF一1mRNAs,whichprovidesfurtherprovementtotheitsinfluenceontheexpressionofEF一1gene.
第一章前言
1.研究背景
脆性x综合征是人中最常见的遗传性智力低下疾病,细胞遗传学分析显示与X染体长臂末端Xq27.3脆性位点相关。通过定位克隆的方法,研究人员在此位点克隆了脆性X综合征基因FMRl
(FragileXmentalretardationgene1,FMP.1)0]oFMRl由17个外显子组成,在其5’非翻译区有一个CpG岛,其后有CGG三核苷酸重复序列I“。绝大部分脆性x综合征患者是由于CpG岛的异常甲基化和CGG三核苷酸重复序列的异常扩增,引起FMRl基因失活或者表达降低所到1小,也有因FMRl基因点突变引起的病例‘5’61。
分子蒸馏FMRl是一个广泛表达的基因,在脑和睾丸中表达最高,在心脏、肺、肾和胎盘中也有较高表达,在肝脏、前列腺、骨骼肌有较低表达‘7一】。其表达产物称为FMRP。FMRP是一个RNA结合蛋白19。o】。序列分析表明FMRP含有两种RNA结合结构域:KH结构域(核酸蛋白K同源结构域)和RGG框(精氨酸甘氨酸簇)【11】。说明它是一种多位点与RNA相互作用的蛋白,该观点已被多种功能性实验所证实[12-14l。
FMRP主要定位于细胞质,也见于核膜、核仁【15—61。FMRP有一个核定位信号(NuclearLocalizationSequence,NLS)和一个核输出信号(NuclearExportSequence,NES),可以穿梭于核与胞质之间‘切。FMRP还作为信使核糖核蛋白复合体(messengerribonueleoproteinpartieles,mRNPs)的组份‘18—91,影响突触后及树突的具有翻译活性的多聚核糖体的功能。
上述特征提示FMRP的功能可能是调节某些特定的靶mRNAs的翻译,和/或参与这些mRNA
通讯世界s从细胞核至细胞质,或从神经元细胞质至树突和突触后的蛋白质合成位点的转运【20‘231。研究人员认为FMRP通过其核定位信号被转运至核内,入核后它与数种蛋白质和一个特定亚的mRNAs相互作用,形成mRNP复合体。然后此复合体通过FMRP的核输出信号输出至胞浆并定位于突触后位点。在此过程中,mRNP复合体中的mRNAs一直处于无活性状态,直到突触的信号输入改变FMRP的活性,从而起始mRNAs的翻译㈣。因此,脆性x综合征患者的FMRP缺失,可能引起与之相互作用的mRNAs的翻译异常,在一定程度上导致了患者的智力和生理改变。

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