2016年7月23日
关于病毒起源，目前有三种理论学说作者：Biowood
(1) 病毒起源的退化学说：最早由格林提出。 病毒可能曾经是一些寄生在较大细胞内的小细胞。随着时间的推移，那些在寄生生活中非必需的基因逐渐丢失。这一理论的证据是，细菌中的立克次氏体和衣原体就像病毒一样，需要在宿主细胞内才能复制；而它们缺少了能够独立生活的基因，这很可能是由于寄生生活所导致的。 (2) 病毒起源于胞内核酸成分的学说：一些病毒可能是从较大生物体的基因中“逃离”出来的DNA或RNA进化而来的。逃离的DNA可能来自质粒或转座子。 谷胱甘肽过氧化物酶(3) 裸基因说：病毒可能进化自蛋白质和核酸复合物，与细胞同时出现在远古地球，并且一直依赖细胞生命生存至今。类病毒是一类RNA分子，但不归入病毒中，因为它们缺少由蛋白质形成的衣壳。然而，它们具有多种病毒的普遍特征，常常称为亚病毒物质。类病毒是重要的植物病原体。它们没有编码蛋白质的基因，但可以与宿主细胞作用，利用宿主来进行它们自身的复制。
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就我而言，我认为退化说更为合理，原因是：上古音
（1）就目前的证据而言，退化说所具有的的证据更多更完备；比如：细菌中的立克次氏体和衣原体很可能就是病毒与细胞在进化上的中间产物；[1]另外，一些巨型病毒的发现（如天花病毒）其不仅比绝大多数病毒都要大，基因组的规模和复杂度也远超其他病毒，对宿主的依赖程度也相对较低。因此猜测巨型病毒拥有更为复杂的远古祖先，它们起初和其他生物建立了共生关系，逐渐变得寄生，对宿主越来越依赖，丢失了一些必需的基因，最终无法独立复制自身而变成病毒。
微冻技术（2）对于病毒起源于胞内核酸成分的学说，质粒和转座子看起来更像是病毒攻击细胞留下的产物。一个重要的原因是转座子会造成基因组的不稳定，高等动物通过增加基因组的长度以及假基因的数量来解决这个问题，说明细胞在进化过程中也存在与转座子博弈的过程。如果转座子本身产生于细胞而不是病毒，那么这种突变应该在细胞进化中逐渐淹没掉，而不是留存至今。因此，转座子和质粒来源于病毒攻击的假设似乎更为可信。
（3）对于裸基因说，首先目前缺乏证据，也没有发现任何病毒可以脱离宿主细胞而表现出生命活动；其次膜结构对生命活动非常关键，膜结构是生命体在原始海洋环境中熵减作用
人体三维模型
的开始，也是普遍认为的生命活动产生的关键。没有膜结构，能量代谢和核酸保留都很难进行。因此我认为该理论不可信。
Reference：
[1] 病毒概论. wikipedia. 2019
[2] Wessner, D. R. (2010) The Origins of Viruses. Nature Education 3(9):37
[3] 周鑫, 杨漫宇, 匡林林, 等. 医学分子生物学进展诠释着病毒的起源和进化[J]. 实验室研究与探索, 2015, 34(5): 5-10.
[4] 祖旭宇. 病毒的进化[J]. 生物学教学, 2003, 28(12):
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