分子生物学-10-4-第五章 RNA提取

防止RNA酶的污染
1.如果可能,实验室应专门辟出RNA操作区,离心机,移液器,试剂等均应专用。RNA操作区应保持清洁,并定期行除菌。
生态系统理论2.如果可能,在超净台中按照细胞培养的要求进行操作,可以有效避免操作中引起的RNA酶污染。
3.操作过程中应始终戴一次性橡胶手套,并经常更换,以防止手、臂上的细菌和真菌以及人体自身分泌的RNA酶带到试管或污染用具,尽避免使用一次性塑料手套。塑料手套不但常常造成操作不便,且塑料手套的多出部分常常在器具的RNase污染处和RNase-free处传递RNase,扩大污染。
4.避免在操作中说话聊天。也可以戴口罩以防止引起RNA酶污染。
5.尽量使用一次性的塑料制品,尽量避免共用器具如滤纸,tips,tubes等,以防交叉污染。例如,从事RNA探针工作的研究者经常使用RNase H,T1等,在操作过程中极有可能造成移液器、离心机等的污染。而这些污染了的器具是RNA操作的大敌。pgl2008
金地九珑璧6. 关于一次性塑料制品,建议使用厂家供应的出厂前已经灭菌的tips和tubes等。多数厂家供应的无菌塑料制品很少有RNA酶污染,买来后可直接用于RNA操作。许多研究者用DEPC等处理的塑料制品,往往由于二次污染而带有RNA酶,从而导致实验失败。
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7.配制溶液用的酒精、异丙醇、Tris等应采用未开封的新瓶。
8.所有旧塑料制品都必须用0.5M的NaOH处理10分钟,用双蒸水彻底冲洗,DEPC-H20浸泡过夜后灭菌。
9.无法用DEPC处理的用具可用氯仿擦拭若干次,这样通常可以消除RNA 酶的活性。但氯仿会溶解某些塑料制品,应当注意。
如用180℃干烤8小时以上处理玻璃器皿,或用0.1的焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡玻璃器皿和其它用品。所用水以及相关的缓冲液也需要用0.1 DEPC水处理,但Tris-Cl缓冲液等不可以用DEPC处理。
注意:DEPC有致癌之嫌,必须小心操作,防止接触与吸入!
RNA酶抑制剂
1、焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
DEPC即diethypyrocarbonate,中文名为焦碳酸二乙酯。分子式为C6H10O5,分子量为162.14
2、异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对华硕u36
RNA酶有强烈的变性作用。
3、氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA 酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。
4. RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin) :从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。
5. 其他SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用
10.RNase AwayTM试剂可以替代DEPC,操作简单,价格低,且无毒性。只需将RNase AwayTM直接倒在玻璃器皿和塑料器皿的表面,浸泡后用水冲洗去除,即可以快速去除器皿表面的RNase,并且不会残留而干扰后继实验。
RNA制备方法
苯酚法:用SDS变性蛋白并抑制RNase活性,经多次酚/氯仿抽提除去蛋白、多糖、素等后,用NaAC和乙醇沉淀RNA;
胍盐法:用异硫氰酸胍或盐酸胍和-巯基乙醇变性蛋白,并抑制RNase 的活性,经酚氯仿抽提后再沉淀;寿镜吾
氯化锂沉淀法:因为锂在在一定pH下能使RNA相对特异地沉淀,但容易使小分子RNA损失,而且残留的锂离子对mRNA有抑制作用。
特定的试剂盒法
经典方法:苯酚+胍盐法
Trizol法—傻瓜法
一步法总RNA提取试剂Trizol主要是由酚与异硫氰酸胍组成的均相溶液。不仅可直接用于从人类、动物、植物、细菌等细胞或组织中提取总RNA,而且还可以从样品中提取DNA或蛋白质。纯化的总RNA完整性好,不受蛋白、DNA 的污染。可用于Northern杂交、RNA点杂交、poly(A)+ mRNA的分离、体外转录、RT-PCR、RNase封阻分析以及分子克隆
Q:RNA降解怎么回事?
A:1. 新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。
2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织研碎,并且匀浆时使用更多裂解液。

本文发布于:2024-09-21 01:46:05,感谢您对本站的认可!

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