流行病学信息
多数呼吸道病毒感染具有季节性，呼吸道病毒感染多为散发，由于可通过飞沫与直接接触传播，有流行病学接触史或聚性发病，在气候突变时小规模流行。大多数细菌感染季节流行性不明显，流感流行季节需注意流感继发细菌感染，其中肺炎链球菌、金黄葡萄球菌、流感嗜血杆菌等细菌较为常见。
病史及体格检查
大多数呼吸道病毒感染以急性上呼吸道症状为主要表现，伴有发热、头痛、倦怠、肌肉酸痛等较突出症状，可见结膜充血，鼻腔有分泌物，鼻咽喉部充血水肿，扁桃体肿大充血伴有表面有脓性分泌物。
徒手切片
当病毒侵入细支气管上皮引起细支气管炎，感染波及肺间质与肺泡可以导致肺炎，查体常无显著胸部体征，临床上表现为气道反应性增高，引起显著干咳或者伴有咳少许黏痰。
伴有寒战高热、不同特点的咳痰，查体有肺部啰音以及肺部实变体征，但呼吸道细菌感染临床表现病原相关特征性比较低，临床表现很难做出准确病原诊断，适宜快速病原学检测，有助于为门诊诊疗活动提供最佳临床实践。
实验室检查
对于急性呼吸道感染的病人，基本的实验室辅助检查包括血常规、血沉 、抗链球菌溶血素O、C-反应蛋白、降钙素原、淀粉样蛋白A、白介素6、胸部X线或者胸部CT、胸部超声等。临床需要结合病史和体格检查，选择制定合理检查配搭，初步判断急性感染性质，大致区分细菌感染或病毒感染。
血常规
急性细菌感染引起血白细胞、中性粒细胞升高，肺炎链球菌、溶血性链球菌、金黄葡萄球菌等化脓性球菌为最常见病原，需要警惕某些重度感染时白细胞总数反而减少、降低。伤寒、副伤寒杆菌等革兰阴性杆菌感染，与流感病毒、巨细胞病毒、新型冠状病毒等呼吸道病毒感染，常常引起血白细胞、中性粒细胞减少。
引起血淋巴细胞病理性增多感染性疾病主要为病毒感染，包括腺病毒、巨细胞病毒、柯萨奇病毒、流行性腮腺炎、传染性单核细胞增多症、流行性出血热，且感染后常常可在外周血中检出异形淋巴细胞，临床上将淋巴细胞作为血清学参考指标。百日咳杆菌、结核分枝杆菌、布鲁氏杆菌等特殊细菌感染也会引起淋巴细胞病理性增多。
血沉（ESR）卫星加密
血沉，又称为红细胞沉降率，是红细胞在一定条件下沉降速率，可作为许多感染和非感染疾病诊断辅助参考指标。发生急性细菌性炎症 2-3 天后即会出现ESR加快，且常规受血浆中蛋白比例、红细胞数量及形状等多种因素影响。风湿热、结核病时，因纤维蛋白原及免疫球蛋白增加，ESR明显加快。作常用非特异性炎症指标，血沉常用于评估多种器官慢性感染指标。
抗链球菌溶血素 O（ASO）
溶血素O是A溶血性链球菌产生有溶血活性代谢产物，相应抗体称ASO。近期内A族溶血性链球菌感染后血中会出现，可见于急性上呼吸道感染、皮肤和软组织感染，丹毒、活动
性风湿热、风湿性关节炎、风湿性心肌炎、急性肾小球肾炎等。ASO 测定对于诊断A族链球菌感染具有临床价值，存在及含量可反映感染严重程度。
C-反应蛋白（CRP）
是由肝细胞产生的急性时相反应蛋白，能与肺炎链球菌细胞壁 C-多糖结合，广泛存在于血清和其他体液中，是临床上运用最广泛感染诊断指标之一。机体受到微生物入侵或组织损伤等炎症性刺激后 6-8小时CRP开始升高，24-48小时达到高峰，感染好转后其水平显著下降，1周内可恢复正常。CRP己被证实可用于鉴别细菌和病毒感染。细菌感染时CRP升高，升高幅度与感染程度相符合，革兰阴性菌感染时升高幅度一般比革兰阳性菌感染高；
病毒感染时，CRP正常或呈现低度升高，不超过50mg/L，极少超过100mg/L。
降钙素原（PCT）
PCT 是糖蛋白，由 116个氨基酸组成，分子量为13kDa。正常生理状态下 PCT 由甲状腺C细胞产生，在血液中水平较低。在炎症刺激、细菌感染、脓毒血症状态下，机体多个组织均可产生PCT，PCT水平明显升高，但在病毒感染病人中 PCT仅轻度升高。
测量人体血清中 PCT水平，初步鉴别细菌感染与非细菌感染。
PCT在机体感染开始后最初2-3小时可测得，12-48小时到达峰值。与传统生物标志物相比，PCT半衰期接近24 h且几乎不受肾功能水平、激素及免疫抑制剂的影响。PCT对机体感染反映具有快速准确特征。
淀粉样蛋白 A（SAA）
是急性时相反应蛋白，正常人体内SAA含量较低，在炎症刺激急性期，SAA感染3-6小时开始升高，半衰期约50分钟，清除病原体后又可迅速降低至正常水平。
南京东方卫报在流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等多种病毒感染急性期，SAA 能较显著地升高至10-100 mg/L，血白细胞、CRP、PCT 等指标一般无明显升高。动态监测 SAA水平变化，12-24小时复检，SAA水平持续升高在10-100 mg/L，临床上提示病毒感染。
SAA在细菌感染急性期水平显著高于病毒感染急性期，水平持续高于100mg/L，临床上为细菌感染急性期极大。不同类型细菌感染引起机体SAA水平上升。根据SAA升高程度或与其他指标联合运用是判断病毒感染，监测病程及用药疗效优选血清学指标。
无锡白介素 6(IL-6)
IL-6属于糖蛋白家族，当受到特定诱导物刺激时可由多种机体细胞分泌，在感染、炎症反应中处于细胞因子网络中心地位，刺激肝脏合成分泌 CRP、SAA和纤维蛋白原等急性时相反应蛋白。
细菌感染时 IL-6 迅速升高，PCT在2小时后增加，CRP在6小时后迅速增加，用来辅助急性感染早期诊断。IL-6水平与感染严重程度和预后密切相关，外周血 IL-6上升是重型/危重型新冠病毒感染患者早期预警指标。
人中性粒细胞载脂蛋白
HNL主要存在于外周血中性粒细胞二级颗粒中，在细菌感染时，HNL由活化中性粒细胞或损伤上皮细胞释放至细胞外，使血液中HNL 含量迅速升高。烫贴
聚合酶链反应
对急性呼吸道感染患者，获取痰液、肺泡灌洗液等标本病原体核酸恒温扩增检测，快速确
定肺部感染病原体，指导选择合理抗生素个体化抗感染以取得良好临床学效果和效率。
高通量基因测序技术
福州月中华情基因组学技术发展，高通量基因测序技术为下一代测序技术，包括全基因组测、宏基因组测序、靶向基因组测序，WGS和mNGS属于无靶向高通量测序，对数十万到数百万条DNA分子序列无偏倚读取。
WGS检测是标本培养分离后的纯菌落，获取全部基因信息，mNGS 是直接检测送检标本，进而获取所需基因信息。肺泡灌洗液全套病原微生物宏基因组检测肺泡灌洗液吸道病原体多重联合检测。
快速现场评估技术
快速现场评估是在利用穿刺、活检、刷片等方法收集标本时，在基本不损失标本的前提下，现场对所取得的标本进行快速制片、染和判读的快速评估技术。ROSE 技术可以分为指导感染性疾病诊疗的快速现场微生物学评价和指导肺部良恶性病变诊疗的快速现场细
胞学评价，对于感染性疾病患者，特别是肺部复杂感染、重症感染等特殊病患，M-ROSE能快速获得病原学依据，鉴别致病菌与定植菌，最终实时指导临床用药。
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