绪论
模式微生物 ：微生物由于其五大共性加上提升条件简便，因此是生命科学工作者在研究基础理论问题时最乐于选用的研究对象
比面值：把某一物体单位体积所占有的面积成为比面值。
微生物五大共性 ：体积小面积大、吸收多转化快、生长旺繁殖快、适应强易变异、分布广种类多
微生物多样性（microbiodiversity）：物种的多样性、生理代谢类型的多样性、代谢产物的多样性、遗传基因的多样性、生态类型的多样性。
微生物学：是一门在分子、细胞或体水平上研究微生物的形态构造、生理代谢、遗传变异、生态分布和分类进化等生命活动基本规律，并将其应用于工业发酵、医药卫生、生物工程和环境保护等实践领域的科学，其根本任务是发掘、利用、改善和保护有益微生物，控制、消灭或改造有害微生物，为人类社会的进步服务。
平常微生物学：按研究微生物的基本生命活动规律为目的来分，总学科为平常微生物学，分学科如微生物分类学、微生物生理学、微生物遗传学、微生物生态学和分子微生物学等。 应用微生物学：按微生物应用领域来分，总学科是应用微生物学，分科如工业微生物学、农业微生物学、医学微生物学、药用微生物学、诊断微生物学、抗生素学和食品微生物学。
第一章
原核生物（prokaryote）：广义的细菌，指一大类细胞核无核膜包裹，只存在称作核区的裸露DNA的原始单细胞生物，包括真细菌和古生菌两大类。 细菌：狭义的细菌是指一类细胞较短（直径约0.5微米，长度0.5到5微米），结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性较强的原核生物，广义的细菌则是指所有原核生物。
蛋白质晶体
费氏刺尾鱼菌：巨型的共生细菌，其细胞长度达200到500μm，体积是典型ecoli细胞的十
的六次方倍。
纳米比亚嗜硫珠菌：细胞呈球状，直径为0.32到1.00mm，肉眼清楚可见，以海底散发的硫化氢为生，属于硫细菌类。
革兰氏染法：革兰氏阳性细菌会被染成紫，G-染成红。
(细菌)细胞壁：是位于细胞最外的一层厚实坚韧的外被，主要成分为肽聚糖，它具有固定细胞外形和保护细胞不受损伤等多种生理功能，通过染，质壁分离（plasmolysis）或制成原生质体后，再在光学显微镜下观察均可证实细胞壁的存在。 肽聚糖（petidoglycan）：又称黏肽，胞壁质，或黏质复合物。是真细菌细胞壁中的特有成分，以革兰氏阳性菌金黄葡萄球菌的肽聚糖作一介绍，由肽和聚糖两部分组成，其中的肽包括四胎尾和肽桥两种，而聚糖是由N-乙酰葡糖胺和N-乙酰胞壁酸两种单糖相互间隔连接成的长链。这种肽聚糖网格中分子交织成一个多层次致密的网套覆盖在整个细胞上。
磷壁酸：（teichoic acid）：结合在革兰氏阳性细菌细胞壁上的一种酸性多糖，主要成分为甘油磷酸或核糖醇磷酸等，可分为两类，一类是肽聚糖分子进行共价结合，称壁磷壁酸，
其含量会随提升基成分而改变，另一类是跨越肽聚糖层并与细胞膜的脂质层共价结合称为膜磷壁酸或脂磷璧酸。
外膜：（outer membrane又称外壁）：是革兰氏阴性细菌细胞壁所特有的结构，它位于壁的最外层化学成分为脂多糖，磷脂和若干种外膜蛋白。
脂多糖：（lipopolysaccharide）：LPS是位于革兰氏阴性细菌细胞壁最外层的一层较厚，八到十纳米的类脂多糖类物质，由类脂A，核心多糖和O-特异侧链(或称O-抗原）三部分组成。
孔蛋白(porin)：一类中间有孔道,可控制相对分子质量大于600物质，如抗生素等,进入外膜的三聚体跨膜蛋白，它是多种小分子成分进入细胞的通道，有特异性与非特异性两种。
周质空间：（periplasm）：在革兰氏阴性细菌中，其外膜与细胞膜间的狭窄胶质空间，其中存在着多种周质蛋白，包括水解酶类，合成酶类和运输蛋白等。
古生菌：（Acchae）古生菌又称古细菌，或古菌，是一类在进化途径上很早就与真细菌和真核生物相互独立的生物类，主要包括一些独特生态类型的原核生物，如产甲烷菌及大
多数嗜极菌，包括极端嗜盐菌，极端嗜热菌和热原体属等
假肽聚糖 （pseydopeptidoglycan）：结构虽与聚糖相似，但其多糖骨架则是由N-乙酰葡糖胺和N-乙酰塔罗糖胺糖醛酸以及β-1，3-糖苷键（不被溶菌酶水解）交替连接而成，连在后一氨基糖上的肽尾由L-Glu L-Ala L-Lys三个l型氨基酸组成，肽桥则由谷氨酸L-Glu一个氨基酸组成。
抗酸细菌：是一类细胞壁中含有大量分枝菌酸等蜡质的特殊革兰氏阳性细菌，因他们被酸性复红染上后就不能像其他G+那样被盐酸乙醇脱，故称抗酸细菌。（Mycobacterium）分枝杆菌属的细菌属于抗酸细菌，常见的有结核分枝杆菌（M.tuberculosis）和麻风分枝杆菌（M.leprae）两种。
索状因子： （cord factor）是分枝杆菌细胞表层的一种糖脂，即6，6-2分枝菌酸海藻糖。索状因子与结核分枝杆菌的致病性密切相关。
缺壁细菌：在自然界长期进化中和实验室菌种的自发突变中都会产生少数缺细胞壁的种类，此外在实验室中还可用人为方法，通过抑制新生细胞壁的合成或对现成细胞壁进行酶
解而获得人工缺壁细菌。有四类缺壁细菌。一在自然界长期进化中形成的是支原体（含有甾醇），二在实验室中形成有a自发缺壁突变：L型细菌 b人工方法去壁：彻底除尽为原生质体（溶菌酶，青霉素），部分去除为球状体。
L型细菌：应专指稳定的L型及那些实验室或宿主体内通过自发突变而形成的遗传性稳定的细胞壁缺损菌株。
(细菌)原生质体（protoplast）：指在人为条件下用溶菌酶除尽原有细胞壁或用青霉素抑制新生细胞壁合成后，所得到的仅有一层细胞膜包裹的圆球状肾透敏感细胞，他们只能用等渗或者高渗提升液保存或维持生长，革兰氏阳性细菌最易形成原生质体，除对相应的噬菌体缺乏敏感性不能进行正常的鞭毛运动和细胞不能分裂外，仍保留着正常细胞所具有的其他正常功能。 不同菌种或菌株的原生质体易发生细胞融合，因此可用于杂交育种，另外原生质体比正常细菌更易导入外源遗传物质，故有利于遗传学基本原理的研究。
球状体（sphaeroplast）：又称原生质球，指还残留了部分细胞壁，尤其是革兰氏阴性细菌外膜层的圆球形原生质体。
(细菌)细胞膜：又称细胞质膜或内膜是一层紧贴在细胞壁内侧包围着细胞质的柔软脆弱富有弹性的半透性薄膜，厚7-8nm 由磷脂（20%到30%）和蛋白质（占50%和70%）组成通过质壁分离 鉴别性染或原生质体破裂的方法可在光镜下观察到。
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