mirna靶基因分析lncRNA与miRNA相互调控作用 长链非编码RNA( longnon-codingRNA,lncRNA) 是一类转录本长度大于200bp的非编码RNA,可作为人类基因组中一类重要的调控分子通过多种方式发挥其生物学功能。近年来的研究表明,lncRNA也可以作为一种竞争性内源性RNA(competingendogenousRNA,ceRNA) 与miRNA相互作用,参与靶基因的表达调控,并在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用。 lncRNA的主要作用方式:
相对于小分子ncRNA而言,lncRNA具有相对较长的核苷酸链,其分子内部具有特定而又复杂的二级空间结构,能提供与蛋白质结合的多个位点,或与DNARNA之间通过碱基互补配对原则发生特异性动态性相互作用,形成由lncRNA参与的复杂精确而微妙的基因表达调控网络。
研究表明,lncRNA可作为人类基因组中一类非常重要的表观遗传调控因子,通过表观遗传转录调控以及转录后调控等多种机制调控DNA甲基化组蛋白修饰或染质重构,使基因沉默或激活。
其主要通过以下4种作用方式发挥其生物学功能:
1、lncRNA可担任信号分子角.
当细胞受到特定刺激后,能够表现出相应的组织特异性,并具有作为生物标记物的潜力。通过显微镜发现,X染体特异性失活转录物Xist(Xin-activation-specifictranscript),lncRNA的荧光原位杂交信号几乎覆盖了整个X染体(更多内容想要了解,可以直接关注上海丰核微博及)。
2、引导型lncRNA通过与DNA或者蛋白质结合,可将特定的复合体引导到正确的染体位置上。
例如位于HOXA基因簇的5'端启动子区域的lncRNAHOTTIP,能够增强HOXA的转录。HOTTIP通过染质缠绕接近其目标基因,并与MLL( mixedlineageleukemia)接头蛋白WDR5复合体结合,使WDR5/MLL复合体到达HOXA基因,进一步改变甲基化情况来达到增强组蛋白H3赖氨酸-4的三甲基化( H3K4me3) , 即: lncRNAHOTTIP相当于起到类增强子的作用,促进了下游HOXA基因的转录;
3、lncRNA还可作为分子诱饵来诱导特定蛋白( 如转录因子) 并与之结合,该作用能使其序列下游的反应受到阻碍。
例如DNA损伤活化P21相关非编码RNA( P21associated ncRNA DNA damage activated,PANDA) 与 核 转 录 因 子Y-( nuclear transcriptionfactor Y-有关的基因的表达变化。lncRNA可作为ceRNA与miRNA之间互相调控lncRNA除了直接参与基因的表达调控外,还可以作为ceRNA与 其它RNA转录本竞争相同的miRNA,从而实现相互间的交流与调节(更多内容想要了解,可以直接关注上海丰核微博及)。近期关于RNA转录本之间互相对话的研究中,提出了一种作为全新基因表达调控模式的ceRNA假说: 即lncRNA假基因转录物或mRNA等转录物可作为ceRNA通 过miRNA应 答元 件( miRNAresponse element,MRE) 竞争结合具有相同MRE的miRNA来调控基因的表达水平,从而 影 响 细 胞 的 功能。目前,对 于ceRNA的功能研究提示,lncRNA与miRNA之间可通过竞争性结合相应的MRE而互相调控,从而对miRNA的后续转录后调控作用发生有效的控制。