一种高效检测核酸酶及抑制效果的方法与流程


1.本发明涉及核酸酶检测领域,具体是一种高效检测核酸酶及抑制效果的方法。


背景技术:



2.cd8 t细胞是机体发挥抗肿瘤免疫功能的最关键细胞,在识别肿瘤抗原后,cd8 t细胞活化并分化为具有肿瘤杀伤功能的效应cd8 t细胞。然而,肿瘤微环境中存在大量免疫抑制性细胞如调节性t细胞(treg)和肿瘤相关巨噬细胞(tam)等,表达多种免疫抑制性分子(pd-l1等)形成免疫抑制性微环境,抑制cd8 t细胞抗肿瘤功能的发挥。阻断pd-1/pd-l1可一定程度上恢复cd8 t细胞的效应功能,但作用十分有限。因此,如何更加有效的增强cd8 t细胞的效应功能,是突破肿瘤免疫耐受瓶颈的关键。
3.rna结合蛋白可介导rna的转录后调控(如rna的加工成熟,翻译和降解),从而快速灵活调控细胞的rna和蛋白水平,该特点对于快速、精准的免疫应答调控十分重要。研究发现,cd8 t细胞的活化和效应功能受到精细的转录后调控:cd8 t细胞的早期活化过程中,细胞内mrna的含量增加不明显(约1.4倍),但翻译效率却提高了5倍以上;期间,杀伤功能相关基因(如cd8a,tbx21,itga1itgal和itgax等)的mrna的翻译效率更是与cd8 t细胞的效应功能呈正相关;靶向t细胞的rna降解过程可以显著提高cd4和cd8 t细胞的分化和效应功能。
4.传统的肿瘤手段存在以下不足:
5.传统肿瘤手段(手术、放疗和化疗)无肿瘤特异性,副作用大且容易诱发肿瘤耐药和转移,很难从根本上治愈肿瘤。肿瘤免疫是通过增强患者自身免疫系统(以t细胞为主)的抗肿瘤能力,进行肿瘤的方法,包括t细胞过继疗法、嵌合抗原受体t细胞疗法(car-t)和免疫检查点阻断疗法,具有特异性强、副作用小、抗肿瘤效果持久、有效防止癌细胞的扩散和复发、逆转肿瘤细胞的耐药性等优点,是发展最为迅速、最具前景的新一代肿瘤方法。然而,上述方式存在t细胞功能增强不足,导致肿瘤杀伤效果有限,因此,如何更加有效的增强t细胞功能是肿瘤免疫的关键。


技术实现要素:



6.基于此,有必要针对现有技术问题,提供一种高效检测核酸酶及抑制效果的方法。
7.为解决现有技术问题,本发明采用的技术方案为:
8.包括以下步骤:
9.s1:搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列;
10.s2:表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;
11.s3:定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;
12.s4:表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白;
13.s5:利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞;
14.s6:采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力;
15.s7:测定细胞增殖能力;
16.s8:在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用。
17.进一步,所述搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列包括以下步骤:
18.s11:通过ncbi数据库搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列,利用生物信息学软件绘制do1核酸内切酶基因在不同物种的进化树和do1核酸内切酶的蛋白质功能结构域;
19.s12:采用crispr/cas9技术编辑do1核酸内切酶基因,获得do1核酸内切酶基因敲除或突变细胞株;
20.s13:采用sirna技术沉默do1核酸内切酶基因,以敲低do1核酸内切酶基因表达;
21.s14:提取rpe-1细胞的蛋白质,通过sds-page电泳分离蛋白质,转移至聚偏二氟乙烯膜;
22.s15:采用特异性的兔抗do1核酸内切酶和羊抗兔hrp二抗检测do1核酸内切酶蛋白质水平。
23.进一步,所述表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布包括以下步骤:
24.s21:采用免疫荧光、染质免疫共沉淀和核质分离的方法表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;
25.s22:在diva细胞中开展chip实验,由4-oht诱导asisi-er核酸内切酶的表达,在染体chr1:89,458,595-89,458,603处产生dna断裂;
26.s23:4-oht诱导5小时后,利用特异性抗体沉淀相应蛋白质;
27.s24:通过pcr扩增确定蛋白质在dna断裂位点处的富集水平。
28.进一步,所述定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率包括以下步骤:
29.s31:采用i-sce1核酸内切酶定点诱导dna断裂,荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;
30.s32:采用可被多西环素诱导表达的野生型对do1核酸内切酶缺陷细胞进行功能互补实验;
31.s33:通过免疫荧光实验测定do1核酸内切酶缺陷的细胞在dna损伤后,各种相关的dna修复因子在dna损伤位点的聚集能力。
32.进一步,所述表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白包括以下步骤:
33.s41:do1核酸内切酶基因全长及其突变体通过pcr扩增后亚克隆到pgex4t1-2strep载体上,并转化至bl21大肠杆菌菌株中;
34.s42:将带有do1核酸内切酶质粒的细菌在38℃的环境下培养至对数生长期,加入1mm iptg诱导蛋白表达,在17℃的环境下继续培养16小时后离心收集细菌;
35.s43:将菌体重悬于netn裂解液中,利用超声破碎细胞后21000x g离心,收集上清液;
36.s44:在上清液中加入netn裂解液预先洗涤过的strep-tactin xt磁珠,5℃中孵育1.5小时后弃去上清液;
37.s45:利用netn裂解液洗涤磁珠6次,加入sds上样缓冲液提取纯化蛋白;
38.s46:通过蛋白质免疫印迹检测纯化蛋白。
39.进一步,所述netn裂解液由以下成分组成:
40.200mm nacl;
41.40mm tris-cl[ph 8.0];
[0042]
1mm edta0.6%nonidet p-40。
[0043]
进一步,所述利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞包括以下步骤:
[0044]
s51:在正常细胞中敲除do1核酸内切酶基因,并将细胞连续传代,测定其增殖曲线,实验周期为21天;
[0045]
s52:在肿瘤细胞中沉默do1核酸内切酶基因,并将细胞连续沉默,测定其增殖曲线,实验周期为21天;
[0046]
s53:计算存活细胞数并存图记录;
[0047]
s54:根据细胞计数结果计算增值率,增值率=(nt-n0)/nt*100%,其中nt是实验终点细胞计数绝对值,n0是初始细胞接种数;
[0048]
s55:将所有测定细胞系对照组与实验组实验终点增值率进行双尾t-test检验。
[0049]
进一步,所述采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力包括以下步骤:
[0050]
s61:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与其他功能基因共同沉默,采用细胞计数方法测定细胞增殖能力
[0051]
s62:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与酶抑制剂连用,采用结晶紫染方法测定细胞增殖能力。
[0052]
进一步,所述测定细胞增殖能力包括以下步骤:
[0053]
s71:在rpe-1或肿瘤细胞中将do1核酸内切酶与tp53功能基因共同沉默,测定细胞增殖能力;
[0054]
s72:将tp53表达质粒转入肿瘤细胞,同时沉默do1核酸内切酶基因表达,通过细胞计数的方法测定恢复功能的tp53基因对do1核酸内切酶细胞毒性的拯救效应。
[0055]
进一步,所述在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用包括以下步骤:
[0056]
s81:在24孔板中接种1万细胞,24小时进行do1核酸内切酶基因沉默实验,实验周期设定为21天;
[0057]
s82:根据细胞生长速率调整每次传代接种细胞数;
[0058]
s83:每次传代24小时进行do1核酸内切酶sirna转染实验,并得出实验结果。
[0059]
所述高效检测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2,或所述高效检测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2所示的氨基酸序列具有至少70%的序列同一性;所述氨基酸序列为seq id no:1的高效检测核酸酶来源于盐杆菌dl1菌株,或所述氨基酸序列为seq id no:2的高效检测核酸酶来源于闪烁古生球菌。
[0060]
本发明与现有技术相比具有的有益效果是:
[0061]
其一,本发明通过给对象服用足够剂量的do1核酸内切酶抑制物或ssa增强剂,用于或预防带有tp53、pten等抑癌基因突变、基因表达或功能缺陷的肿瘤。
[0062]
其二,本发明通过给对象服用足够剂量的do1核酸内切酶抑制物可以对低剂量的放化疗起到增敏作用,用于对放射或化疗药物单独无有效临床反应的肿瘤。
具体实施方式
[0063]
为能进一步了解本发明的特征、技术手段以及所达到的具体目的、功能,下面结合具体实施方式对本发明作进一步详细描述。
[0064]
一种高效检测核酸酶及抑制效果的方法,包括以下步骤:
[0065]
s1:搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列;
[0066]
s2:表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;
[0067]
s3:定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;
[0068]
s4:表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白;
[0069]
s5:利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞;
[0070]
s6:采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力;
[0071]
s7:测定细胞增殖能力;
[0072]
s8:在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用。
[0073]
具体地,所述搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列包括以下步骤:
[0074]
s11:通过ncbi数据库搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列,利用生物信息学软件绘制do1核酸内切酶基因在不同物种的进化树和do1核酸内切酶的蛋白质功能结构域;
[0075]
s12:采用crispr/cas9技术编辑do1核酸内切酶基因,获得do1核酸内切酶基因敲除或突变细胞株;
[0076]
s13:采用sirna技术沉默do1核酸内切酶基因,以敲低do1核酸内切酶基因表达;
[0077]
s14:提取rpe-1细胞的蛋白质,通过sds-page电泳分离蛋白质,转移至聚偏二氟乙烯膜;
[0078]
s15:采用特异性的兔抗do1核酸内切酶和羊抗兔hrp二抗检测do1核酸内切酶蛋白质水平。
[0079]
并通过ensembl数据库显示do1核酸内切酶基因组位点含有两个外显子和一个内含子。genetree软件分析do1核酸内切酶基因在不同物种的进化关系,发现其同源基因存在于珊瑚、鱼类、脊椎动物和人等高等真核生物中,而不存在于酵母、果蝇和线虫等低等真核生物。
[0080]
具体地,所述表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布包括以下步骤:
[0081]
s21:采用免疫荧光、染质免疫共沉淀和核质分离的方法表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;
[0082]
s22:在diva细胞中开展chip实验,由4-oht诱导asisi-er核酸内切酶的表达,在染体chr1:89,458,595-89,458,603处产生dna断裂;
[0083]
s23:4-oht诱导5小时后,利用特异性抗体沉淀相应蛋白质;
[0084]
s24:通过pcr扩增确定蛋白质在dna断裂位点处的富集水平。
[0085]
通过一系列生物学实验证实do1核酸内切酶在dna损伤位点聚集并活化,参与dna修复,保证遗传物质的稳定性。
[0086]
具体地,所述定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率包括以下步骤:
[0087]
s31:采用i-sce1核酸内切酶定点诱导dna断裂,荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;
[0088]
s32:采用可被多西环素诱导表达的野生型对do1核酸内切酶缺陷细胞进行功能互补实验;
[0089]
s33:通过免疫荧光实验测定do1核酸内切酶缺陷的细胞在dna损伤后,各种相关的dna修复因子在dna损伤位点的聚集能力。
[0090]
dna断裂损伤主要通过非同源末端链接(nhej)、同源重组(hr)和单链dna融合(ssa)三种途径进行修复,并受到多种修复因子的调控,其中,dna末端回切形成单链dna的程度是选择这些修复途径的重要调控事件。在实施例2中发现的基础上,更多的实验证明do1核酸内切酶直接募集到dna断点并调控dna末端回切,是调控修复途径选择的重要分子。
[0091]
具体地,所述表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白包括以下步骤:
[0092]
s41:do1核酸内切酶基因全长及其突变体通过pcr扩增后亚克隆到pgex4t1-2strep载体上,并转化至bl21大肠杆菌菌株中;
[0093]
s42:将带有do1核酸内切酶质粒的细菌在38℃的环境下培养至对数生长期,加入1mm iptg诱导蛋白表达,在17℃的环境下继续培养16小时后离心收集细菌;
[0094]
s43:将菌体重悬于netn裂解液中,利用超声破碎细胞后21000x g离心,收集上清液;
[0095]
s44:在上清液中加入netn裂解液预先洗涤过的strep-tactin xt磁珠,5℃中孵育1.5小时后弃去上清液;
[0096]
s45:利用netn裂解液洗涤磁珠6次,加入sds上样缓冲液提取纯化蛋白;
[0097]
s46:通过蛋白质免疫印迹检测纯化蛋白。
[0098]
do1核酸内切酶具有经典的核酸内切酶结构域,为验证其核酸内切酶的活性,我们利用细菌表达并纯化了do1核酸内切酶-strep蛋白质,包括do1核酸内切酶全长和多肽片段(1-344、22-344),并检测其对不同类型dna的酶切反应,结果如下:
[0099]
0.5微克纯化do1核酸内切酶加入1微克各种pegfp-c3质粒dna,在buffer3.1和cut smart缓冲液中进行体外消化反应(37oc,16小时)结果表明do1核酸内切酶可以切割带有结构损伤的dna分子,如紫外线损伤、dna双链断裂(5’和3’overhang)、氧化损伤(过氧化氢处理),而对完整质粒没有切割效应。
[0100]
具体地,所述netn裂解液由以下成分组成:
[0101]
200mm nacl;
[0102]
40mm tris-cl[ph 8.0];
[0103]
1mm edta0.6%nonidet p-40。
[0104]
具体地,所述利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞包括以下步骤:
[0105]
s51:在正常细胞中敲除do1核酸内切酶基因,并将细胞连续传代,测定其增殖曲线,实验周期为21天;
[0106]
s52:在肿瘤细胞中沉默do1核酸内切酶基因,并将细胞连续沉默,测定其增殖曲线,实验周期为21天;
[0107]
s53:计算存活细胞数并存图记录;
[0108]
s54:根据细胞计数结果计算增值率,增值率=(nt-n0)/nt*100%,其中nt是实验终点细胞计数绝对值,n0是初始细胞接种数;
[0109]
s55:将所有测定细胞系对照组与实验组实验终点增值率进行双尾t-test检验。
[0110]
dna损伤应答是真核细胞维持基因组稳定性的重要机制,当损伤不能正常修复时将导致细胞死亡。实施例3已经证实,do1核酸内切酶基因的沉默导致rad52调控ssa通路异常,影响dna修复,可能影响细胞的存活。因此,我们利用细胞增殖实验测定do1核酸内切酶对不同种类细胞增殖能力的影响,发现了do1核酸内切酶基因沉默对肿瘤细胞的特异性抑制作用,但不影响正常细胞的生存,表明do1核酸内切酶功能抑制具有潜在的肿瘤效果。
[0111]
具体地,所述采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力包括以下步骤:
[0112]
s61:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与其他功能基因共同沉默,采用细胞计数方法测定细胞增殖能力
[0113]
s62:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与酶抑制剂连用,采用结晶紫染方法测定细胞增殖能力。
[0114]
大多数肿瘤细胞存在dna损伤修复的缺陷,为研究do1核酸内切酶基因缺失特异性抑制肿瘤细胞增殖的机制,本发明利用基因沉默或酶抑制剂干扰dna损伤应答或修复因子的功能,模拟肿瘤细胞内的dna应答缺陷,发现do1核酸内切酶基因沉默与包括atm、chk1和同源重组修复因子在内的大多数dna损伤应答因子的缺陷联合致死。
[0115]
具体地,所述测定细胞增殖能力包括以下步骤:
[0116]
s71:在rpe-1或肿瘤细胞中将do1核酸内切酶与tp53功能基因共同沉默,测定细胞增殖能力;
[0117]
s72:将tp53表达质粒转入肿瘤细胞,同时沉默do1核酸内切酶基因表达,通过细胞计数的方法测定恢复功能的tp53基因对do1核酸内切酶细胞毒性的拯救效应。
[0118]
在rpe-1和2f4细胞中沉默pten抑癌基因,发现2f4对pten沉默具有相对较高的敏感性。说明抑制除tp53之外的抑癌基因也可以与抑制do1核酸内切酶功能联合致死。因此,可以通过给对象服用足够剂量的do1核酸内切酶抑制物或ssa增强剂,用于或预防带有tp53、pten等抑癌基因突变、基因表达或功能缺陷的肿瘤。
[0119]
具体地,所述在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用包括以下步骤:
[0120]
s81:在24孔板中接种1万细胞,24小时进行do1核酸内切酶基因沉默实验,实验周期设定为21天;
[0121]
s82:根据细胞生长速率调整每次传代接种细胞数;
[0122]
s83:每次传代24小时进行do1核酸内切酶sirna转染实验,并得出实验结果。
[0123]
实验结果显示,沉默的正常细胞对dna毒性放化疗药物不敏感,但是肿瘤细胞中沉默do1核酸内切酶可以极大地提高对放化疗处理的敏感性。因此,给对象服用足够剂量的do1核酸内切酶抑制物可以对低剂量的放化疗起到增敏作用,用于对放射或化疗药物单独无有效临床反应的肿瘤。潜在的联合药物包括从铂类、丝裂霉素c、喜树碱、parp抑制剂、放射性同位素、长春花生物碱、抗肿瘤烷基化药物、单克隆抗体、抗代谢药物。这些方法可以同时或先后使用,体现协同效应,使效果优于单独使用抑制do1功能的药物或单独使用抗肿瘤药物的方法。
[0124]
所述高效检测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2,或所述高效检
测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2所示的氨基酸序列具有至少70%的序列同一性;所述氨基酸序列为seq id no:1的高效检测核酸酶来源于盐杆菌dl1菌株,或所述氨基酸序列为seq id no:2的高效检测核酸酶来源于闪烁古生球菌。
[0125]
以上实施例仅表达了本发明的一种或几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。

技术特征:


1.一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,包括以下步骤:s1:搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列;s2:表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;s3:定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;s4:表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白;s5:利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞;s6:采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力;s7:测定细胞增殖能力;s8:在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用。2.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列包括以下步骤:s11:通过ncbi数据库搜索do1核酸内切酶基因和蛋白质序列,利用生物信息学软件绘制do1核酸内切酶基因在不同物种的进化树和do1核酸内切酶的蛋白质功能结构域;s12:采用crispr/cas9技术编辑do1核酸内切酶基因,获得do1核酸内切酶基因敲除或突变细胞株;s13:采用sirna技术沉默do1核酸内切酶基因,以敲低do1核酸内切酶基因表达;s14:提取rpe-1细胞的蛋白质,通过sds-page电泳分离蛋白质,转移至聚偏二氟乙烯膜;s15:采用特异性的兔抗do1核酸内切酶和羊抗兔hrp二抗检测do1核酸内切酶蛋白质水平。3.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布包括以下步骤:s21:采用免疫荧光、染质免疫共沉淀和核质分离的方法表征do1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;s22:在diva细胞中开展chip实验,由4-oht诱导asisi-er核酸内切酶的表达,在染体chr1:89,458,595-89,458,603处产生dna断裂;s23:4-oht诱导5小时后,利用特异性抗体沉淀相应蛋白质;s24:通过pcr扩增确定蛋白质在dna断裂位点处的富集水平。4.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述定点诱导dna断裂、荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率包括以下步骤:s31:采用i-sce1核酸内切酶定点诱导dna断裂,荧光定量pcr测定hr,nhej和ssa修复的相对效率;s32:采用可被多西环素诱导表达的野生型对do1核酸内切酶缺陷细胞进行功能互补实验;s33:通过免疫荧光实验测定do1核酸内切酶缺陷的细胞在dna损伤后,各种相关的dna修复因子在dna损伤位点的聚集能力。5.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述表达与纯化do1核酸内切酶-strep蛋白包括以下步骤:s41:do1核酸内切酶基因全长及其突变体通过pcr扩增后亚克隆到pgex4t1-2strep载
体上,并转化至bl21大肠杆菌菌株中;s42:将带有do1核酸内切酶质粒的细菌在38℃的环境下培养至对数生长期,加入1mm iptg诱导蛋白表达,在17℃的环境下继续培养16小时后离心收集细菌;s43:将菌体重悬于netn裂解液中,利用超声破碎细胞后21000x g离心,收集上清液;s44:在上清液中加入netn裂解液预先洗涤过的strep-tactin xt磁珠,5℃中孵育1.5小时后弃去上清液;s45:利用netn裂解液洗涤磁珠6次,加入sds上样缓冲液提取纯化蛋白;s46:通过蛋白质免疫印迹检测纯化蛋白;其中netn裂解液由以下成分组成:200mm nacl;40mm tris-cl[ph 8.0];1mm edta0.6%nonidet p-40。6.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述利用do1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞包括以下步骤:s51:在正常细胞中敲除do1核酸内切酶基因,并将细胞连续传代,测定其增殖曲线,实验周期为21天;s52:在肿瘤细胞中沉默do1核酸内切酶基因,并将细胞连续沉默,测定其增殖曲线,实验周期为21天;s53:计算存活细胞数并存图记录;s54:根据细胞计数结果计算增值率,增值率=(nt-n0)/nt*100%,其中nt是实验终点细胞计数绝对值,n0是初始细胞接种数;s55:将所有测定细胞系对照组与实验组实验终点增值率进行双尾t-test检验。7.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力包括以下步骤:s61:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与其他功能基因共同沉默,采用细胞计数方法测定细胞增殖能力s62:在rpe-1和2f4细胞中将do1核酸内切酶与酶抑制剂连用,采用结晶紫染方法测定细胞增殖能力。8.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述测定细胞增殖能力包括以下步骤:s71:在rpe-1或肿瘤细胞中将do1核酸内切酶与tp53功能基因共同沉默,测定细胞增殖能力;s72:将tp53表达质粒转入肿瘤细胞,同时沉默do1核酸内切酶基因表达,通过细胞计数的方法测定恢复功能的tp53基因对do1核酸内切酶细胞毒性的拯救效应。9.根据权利要求1所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述在利用do1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用包括以下步骤:s81:在24孔板中接种1万细胞,24小时进行do1核酸内切酶基因沉默实验,实验周期设定为21天;s82:根据细胞生长速率调整每次传代接种细胞数;
s83:每次传代24小时进行do1核酸内切酶sirna转染实验,并得出实验结果。10.一种高效检测核酸酶,包括如权利要求1-9任意一项所述的一种高效检测核酸酶抑制效果的方法,其特征在于,所述高效检测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2,或所述高效检测核酸酶的氨基酸序列为seq id no:1或seq id no:2所示的氨基酸序列具有至少70%的序列同一性;所述氨基酸序列为seq id no:1的高效检测核酸酶来源于盐杆菌dl1菌株,或所述氨基酸序列为seq id no:2的高效检测核酸酶来源于闪烁古生球菌。

技术总结


本发明涉及核酸酶检测领域,具体涉及一种高效检测核酸酶及抑制效果的方法,包括以下步骤:S1:搜索DO1核酸内切酶基因和蛋白质序列;S2:表征DO1核酸内切酶蛋白质的亚细胞定位和分布;S3:定点诱导DNA断裂、荧光定量PCR测定HR,NHEJ和SSA修复的相对效率;S4:表达与纯化DO1核酸内切酶-STREP蛋白;S5:利用DO1核酸内切酶基因功能抑制特异性攻击肿瘤细胞;S6:采用细胞计数或结晶紫染方法测定细胞增殖能力;S7:测定细胞增殖能力;S8:在利用DO1核酸内切酶抑制对肿瘤放射和化学的致敏作用。本发明通过给对象服用足够剂量的DO1核酸内切酶抑制物或SSA增强剂,用于或预防带有TP53、PTEN等抑癌基因突变、基因表达或功能缺陷的肿瘤。能缺陷的肿瘤。


技术研发人员:

童吉宇 何容莹

受保护的技术使用者:

成都普乐密欣生物技术有限公司

技术研发日:

2022.10.19

技术公布日:

2022/12/12

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