gateway构建干涉载体步骤

                        图1 目的载体pH7GWIWG2(I)
张力计算
克隆获得目的基因后,通过序列比对等方法寻该基因的特异性序列片段,分别设计特异引物及含有一半attB接头序列的引物。
引物Primers
引物序列Primer Sequences
GENE -F
GENE -R
attB- GENE -F
attB- GENE -R
attB-adapter-F
attB-adapter-R
5′- NNNNNNNNNNNNNNNNN -3′
5′- NNNNNNNNNNNNNNNNN -3′
5′- AA AAA GCA GGC T NNNNNNNNNNNNNNNNN -3′
5′- A GAA AGC TGG GT NNNNNNNNNNNNNNNNN -3′
5′- GGG GAC AAG TTT GTA CAA AAA AGC AGG CT -3′
5′- GGG GAC CAC TTT GTA CAA GAA AGC TGG GT -3′
1、 根据特异性片段序列,设计引物GENE –F/GENE –RRT-PCR获得目的片段。
2、以步骤一得到的cDNA片段为模板,用引物attB- GENE –F/attB- GENE –R进行扩增获得attB-1-PCR产物。
3、以步骤二得到的目的片段为模板,用引物attB-adapter-F/attB-adapter-R进行扩增,得到attB-PCR产物。
4、纯化回收attB-PCR产物。
5BP反应
1)室温下,在缠绕膜复卷机1.5 ml eppendorf管中加入下列反应体系,并混匀,25温育过夜。
试剂名称
体积(反应体系:10 µL载体构建
attB-PCR 回收产物
2 µL
pDONRTM vector150 ng/ µL
1 µL
BP ClonaseTM enzyme mix
1 µL
5 × BP ClonaseTM Reaction Buffer
2 µL
TE Buffer pH8.0
无铬钝化液4 µL
2)加1 µL Proteinase K solution37℃温育10 min,以终止BP反应。
3BP反应混合物转化感受态细胞。
6PCR检测BP反应阳性克隆,挑取检测正确的克隆进行测序。将测序正确的克隆提取质粒,进行LR反应。
7LR反应
1)室温下,在1.5 mL 离心管中加入下列反应体系,并混匀,25温育过夜:
2 LR反应体系
光碟机
试剂名称
体积(反应体系:10 µL
Entry clone 100-300 ng
1 µL
Destination vector 300 ng
1 µL
LR ClonaseTM enzyme mix
2 µL耐热钢焊接
5 × LR ClonaseTM Reaction Buffer
2 µL
TE BufferpH 8.0
4 µL
2)加1 µL Proteinase K solution37℃温育10 min,以终止LR反应。
3LR 反应混合物转化感受态细胞
8PCR检测LR反应阳性克隆,挑取检测正确的克隆进行测序。将测序正确的克隆提取质粒,电转化农杆菌。
赫赫,我把步骤简单整理了一下,希望能对你有帮助。BP反应和LR反应用到的载体和试剂盒应该都在周老师那里,他要就行了。有什么问题可以再问我,周老师、徐志茹老师、张老师、王宇和孙梅对gateway都很熟练,可以请教他们。祝你实验顺利,亲爱的师妹。

本文发布于:2024-09-23 20:13:20,感谢您对本站的认可!

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