Mechanism and regulation
Enzyme
固定扣Chemistry 3
To teach is not to fill a vase but to light a fire
Ser195
H
H
N C
C
N
[HOOC ]
H
O
C C N
nfs5C C
[NH 2]
复合纸C
O
一、酶的活性部位
(一)酶的活性部位
酶的活性部位是指结合底物和将底物转化为产物的区域,通常是相隔很远的氨基酸残基形成的三维实体。 酶的结构
必需基团
其它部分活性部位
活性部位以外的必需基团
结合部位
催化部位
有七种a.a在酶活性中心出现的频率最高,它们是Ser、His、Cys、Tyr、Asp、Glu、Lys。
活性中心的a.a残基往往分散在相互较远的a.a顺序中,有的甚至分散在不同的肽链上,如α-胰凝乳蛋白酶活性中心的几个a.a残基,分别位于B、C两个肽链上,靠分子空间结构的形成,集中在酶分子特定区域,成为具有催化功能的活性中心。 一些酶活性中心的基团
燕尾槽铣刀
(二)判断和研究活性中心的主要方法(1)通过酶的专一性
金属声屏障生产线(2)酶的化学修饰法
(3)亲合标记法
(4)X射线晶体衍射法
二、酶催化反应的独特性质(略)
三、影响酶催化效率的有关因素
通讯仪(一)底物与酶的邻近效应(Proximity Effect )与定向效应酶把底物分子(一种或两种)从溶液中富集出来,使它们固定在活性中心附近,反应基团相互邻近,同时使反应基团的分子轨道以正确方位相互交叠,反应易于发生。在酶促反应中,由于酶和底物分子之间的亲和性,底物分子有向酶的活性中心靠近的趋势,最终结合到酶的活性中心,使底物在酶活性中心的有效浓度大大增加的效应。
1. 邻近效应
HN
N
C -O || O
--NO 2
HN N
C -O -|| O
HO -
-NO 2
++H +
1
1min 839-=k -
-NO 2
HN
N
O ||
H 3C -C -O +
O ||
H 3C -C -O -
HO -
-NO 2
++H +
1
12min 35--=M k 咪唑催化乙酸对硝基苯酯的(分子间)反应慢;变为分子内反应后要快24倍。