河南省规模化猪场ESBLs大肠杆菌耐药基因检测及分析

河南省规模化猪场ESBLs大肠杆菌耐药基因检测及分析
张成东; 曲久燕; 李德喜; 郭海岩; 刘梦龙; 崔松涛
【期刊名称】《《江西农业学报》》
【年(卷),期】2019(031)003
【总页数】6页(P10-15)
光触媒仿真花【关键词】大肠杆菌; PCR扩增; β-内酰胺类抗生素; ESBLs
【作 者】张成东; 曲久燕; 李德喜; 郭海岩; 刘梦龙; 崔松涛
【作者单位】河南牧翔动物药业有限公司 猪药市场部 河南 郑州 450000; 河南农业大学 牧医工程学院 河南 郑州 450000
【正文语种】中 文
【中图分类】S852.61; R378.2.1
β-内酰胺类抗生素是医学及兽医学上使用最早、用量最大的一类抗生素,随着第三代头孢菌素的广泛应用,临床上也出现了不同程度的耐药菌[1]。细菌通过产生β-内酰胺酶和超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrumβ-lactamases,ESBLs)破坏β-内酰胺类抗生素,从而产生耐药性。近年来,由于各种广谱及超广谱药物的广泛应用,尤其是不合理应用,使致病菌对抗生素的耐药性急剧上升,多重耐药菌株不断增多[2],从而影响了药物的使用。
ESBLs耐药基因包括CTX-M、TEM、SHV和OXA等[3],这些基因常定位于质粒上,易于扩散转移,加速耐药基因的传播。
烫金膜大肠杆菌是人畜肠道共栖菌和条件性致病菌[4-5],也是产广谱β-内酰胺酶的代表菌之一。目前对河南省动物源大肠杆菌ESBLs基因研究较多[6-12],但对猪源大肠杆菌ESBLs基因的系统研究相对较少,不能充分代表河南猪源大肠杆菌ESBLs耐药基因流行情况。因此,本研究从河南6个地区的10个规模化猪场入手,旨在更客观地了解猪源性大肠杆菌的ESBLs基因的流行情况及基因型分布情况,不仅可为大肠杆菌相关疾病防控提供科学依据,而且可为猪场兽医临床合理用药提供科学指导。
1 材料与方法橙子剥皮机
1.1 材料
1.1.1 采样对象 2018年8月从豫东(兰考县、曹县)、豫北(辉县、淇县)、豫西(博爱县、沁阳市、宜阳县)、豫南(遂平县、西平县)6个地市9个县的10个规模化猪场(母猪存栏300~2000头)取母猪直肠分泌物436份、哺乳仔猪直肠分泌物425份。
1.1.2 标准菌株 大肠杆菌标准质控菌株ATCC25922,购自中国药品生物制品鉴定所。
1.1.3 培养基 脑心浸液肉汤(BHI)、麦康凯琼脂购自北京陆桥生物技术有限公司,ECC购自博赛科玛嘉。
1.2 方法
1.2.1 大肠杆菌的分离培养 用灭菌棉棒采猪直肠拭子置入5 mL采样转运培养基中,分别取一环菌液划线于麦康凯培养基进行大肠杆菌的初筛分离,37 ℃过夜培养,选取粉红菌落,接种到ECC平板,对大肠杆菌进行纯化。
石棉密封垫
1.2.2 引物设计与合成 根据Genbank公布的ESBLs基因序列,参照文献[13]和[14]的合成引物,引物由苏州鸿讯生物技术有限公司合成。
1.2.3 DNA模板提取 采用煮沸法提取菌株DNA模板。挑取过夜培养后处于对数生长期的菌落调入含500 μL无菌生理盐水的1.5 mL离心管内,充分混匀,放入100 ℃沸水浴中煮沸15 min。10000 r/min离心30 s后,吸取上清液即为扩增模板。从平板挑取疑似大肠杆菌单克隆于2 mL LB肉汤中,37 ℃恒温摇床200 r/min震荡培养过夜(约12 h)。菌液离心富集后,加入灭菌的蒸馏水100 μL重悬沉淀。100 ℃煮沸30 min,取出后立即冰浴10 min。12000 r/min离心3 min,取80 μL上清作为PCR模板,-20 ℃冰箱中保存备用。
1.2.4 ESBLs菌基因的PCR检测 各目的基因片段扩增体系均为20 μL,反应所用的试剂和扩增程序见表1,PCR扩增产物经浓度为1.5%的琼脂糖凝胶电泳分析。
表1 PCR扩增体系及其扩增程序试剂扩增体系/μL扩增程序温度/℃时间2×Taq Master Mix(含染料)10955 min上游引物194下游引物150~63DNA TEM模板272ddH2O67210 min合计204持续
2 结果与分析
2.1 细菌分离情况
河南省6个地区10个猪场861份(母猪436份,哺乳仔猪425份)直肠分泌物中共分离出704株大肠杆菌(图1、图2),分离率为81.77%;其中母猪分离出419株大肠杆菌,检出率为96.10%;哺乳仔猪分离出285株,检出率为67.06%。
粘胶带
图1 大肠杆菌麦康凯培养基分离
2.2 ESBLs 菌耐药基因检测及分析
对704株大肠杆菌用8对ESBLs基因扩增引物进行PCR检测,检测结果显示,共从580株菌中检测出ESBLs基因(表2),检出率为82.39%,其中CTX-M、TEM、OXA和SHV基因分别检出552、231、173和18株,检出率分别为78.41%、32.81%、24.57%和2.56%;检测到1种耐药基因的ESBLs菌284株,占总检测菌株的40.34%;检测到2种及以上耐药基因的ESBLs菌296株,占总检测菌株的42.05%(其中2种耐药基因203株、3种耐药基因88株、4种耐药基因5株,分别占总检测菌株的28.84%、12.50%、0.71%);TEM+CTX-M基因型ESBLs菌224株,占总检测菌株的31.82%;TEM+OXA+CTX-M基因型ESBLs菌82株,占总检测菌株的11.65%;TEM+SHV+OXA+CTX-M基因型ESBLs菌5株,占总检测菌株的0.71%。由PCR检测结果可知,河南省规模化猪场ESBLs菌阳性率高达82.39%,CTX-M、
TEM和OXA是引起ESBLs耐药的主要基因,表明河南规模化猪场广泛存在耐β-内酰胺类抗生素的大肠杆菌。部分阳性菌株PCR扩增片段电泳阳性图见图3。
图2 大肠杆菌科玛嘉ECC培养基鉴定
2.3 母猪ESBLs菌耐药基因检测及分析
对母猪样本分离出的419株大肠杆菌进行ESBLs基因PCR检测,检测结果(表3)显示:共从336株菌中检测出ESBLs基因,检出率为80.19%,其中CTX-M、TEM、OXA和SHV基因分别检出322、144、61和7株,检出率分别为76.85%、34.37%、14.56%和1.67%;检测到1种耐药基因的ESBLs菌180株,占总检测菌株的42.96%;检测到2种及以上耐药基因的ESBLs菌156株,占总检测菌株的37.23%(其中2种耐药基因117株、3种耐药基因36株、4种耐药基因3株,分别占总检测菌株的27.92%、8.59%、0.72%);CTX-M+TEM基因型ESBLs菌138株,占总检测菌株的32.94%;CTX-M+TEM+OXA基因型ESBLs菌37株,占总检测菌株的8.83%;CTX-M+TEM+OXA+SHV基因型ESBLs菌3株,占总检测菌株的0.72%。由PCR检测结果可知,河南省规模化猪场母猪ESBLs菌阳性率高达80.19%,CTX-M和TEM是引起ESBLs耐药的主要基因。
表2 河南省规模化猪场ESBLs基因PCR检测情况ESBLs基因型检出株数检出率/%CTX-M-100CTX-M-227038.35CTX-M-800CTX-M-949269.89CTX-M-2500CTX-M55278.41TEM23132.81OXA17324.57SHV182.56CTX-M+TEM22431.82CTX-M+OXA15021.31TEM+OXA8411.93CTX-M+SHV182.56TEM+SHV101.42OXA+SHV111.56CTX-M+TEM+OXA8211.65CTX-M+TEM+SHV101.42CTX-M+OXA+SHV111.56TEM+OXA+SHV50.71CTX-M+TEM+OXA+SHV50.711种耐药基因28440.342种耐药基因20328.843种耐药基因8812.504种耐药基因50.71至少1种耐药基因58082.39
1.CTX-M-2,2.CTX-M-9,3.TEM,4.OXA,5.SHV图3 部分ESBLs基因琼脂糖凝胶电泳图
2.4 仔猪ESBLs菌耐药基因检测及分析
对哺乳仔猪样本分离出的285株大肠杆菌进行ESBLs基因PCR检测,检测结果显示,共从244株菌中检测出ESBLs基因(表4),检出率为85.61%,其中CTX-M、TEM、OXA和SHV基因分别检出230、87、112和11株,检出率分别为80.70%、30.53%、39.30%和3.86%;检测到1种耐药基因的ESBLs菌104株,占总检测菌株的36.49%;检测到2种及以上耐药基
因的ESBLs菌140株,占总检测菌株的49.12%(其中2种耐药基因86株、3种耐药基因52株、4种耐药基因2株,分别占总检测菌株的30.18%、18.25%、0.70%);CTX-M+TEM基因型ESBLs菌86株,占总检测菌株的30.18%;CTX-M+OXA基因型ESBLs菌98株,占总检测菌株的34.39%;CTX-M+TEM+OXA基因型ESBLs菌45株,占总检测菌株的15.79%;CTX-M+TEM+OXA+SHV基因型ESBLs菌2株,占总检测菌株的0.70%。由PCR检测结果可知,河南省规模化猪场哺乳仔猪ESBLs菌阳性率高达85.61%,CTX-M、OXA和TEM是引起ESBLs耐药的主要基因,哺乳仔猪ESBLs菌耐药基因携带情况比母猪更复杂。
表3 河南省规模化猪场母猪ESBLs基因PCR检测情况ESBLs基因型检出株数检出率/%CTX-M32276.85TEM14434.37OXA6114.56SHV71.67CTX-M+TEM13832.94CTX-M+OXA5212.41TEM+OXA389.07CTX-M+SHV71.67TEM+SHV51.19OXA+SHV30.72CTX-M+TEM+OXA378.83CTX-M+TEM+SHV51.19CTX-M+OXA+SHV30.72TEM+OXA+SHV30.72CTX-M+TEM+OXA+SHV30.721种耐药基因18042.962种耐药基因11727.923种耐药基因368.594种耐药基因30.72至少1种耐药基因33680.19
2.5 不同猪场ESBLs菌耐药基因检测及分析
在河南省10个规模化猪场分离的大肠杆菌中(图4),1场(样本量:母猪30+哺乳仔猪29)和2场(样本量:母猪21+哺乳仔猪24)ESBLs菌的检出率最高,均为100%;其次是5场和6场的检出率为94%以上,7场、10场和4场的检出率为80%以上,8场的检出率最低,为54.55%。豫东地区的1场和2场耐药基因型最复杂,CTX-M、TEM、OXA基因检出率分别为96.61%、100%、74.58%和100%、95.65%、57.78%,其中1场ESBLs菌耐药基因型最多,同时携带CTX-M、TEM、OXA和SHV基因型的菌株检出率为8.47%,其余各场不存在同时携带4种基因型的菌株;豫北地区的3场耐药基因最单一,仅CTX-M基因的检出率最高,为71.03%;豫南地区的8场、9场和10场,OXA基因的检出率高于TEM基因,其他猪场TEM基因的检出率大于OXA基因检出率。
表4 河南省规模化猪场哺乳仔猪ESBLs基因PCR检测情况ESBLs基因型检出株数检出率/%CTX-M23080.70TEM8730.53OXA11239.30SHV113.86CTX-M+TEM8630.18CTX-M+OXA9834.39TEM+OXA4616.14CTX-M+SHV113.86TEM+SHV51.75OXA+SHV82.81CTX-M+TEM+OXA4515.79CTX-M+TEM+SHV51.75CTX-M+OXA+SHV82.81TEM+OXA+SHV20.70CTX-M+TEM+OXA+SHV20.701种耐药基因10436.492种耐药基因8630.183种耐药基因5218.25
蚀刻液再生4种耐药基因20.70至少1种耐药基因24485.61

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