PCR-sso标准操作

PCR-ASO分型技术标准
1、引物设计由美国Perkin-elmer公司合成,引物末端标记有生物素
1扩增体系
10×PCR buffer                5μl
PCR引物                      10μl
4×dNTP                        10μl
Taq polymerase                0.25μl
DNA模板                      10μl
DW                          14.75μl
Total                        50μl
2 扩增程序(选用PE9600扩增仪)
变性              95              30Sec
退火              63              30Sec              32个循环
延伸              72              30Sec
最后              72延伸10min
注意:扩增过程各设置阳性、阴性质控扩增。
2、扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测
1 配制2%琼脂糖凝胶:4g琼脂糖溶于200ml×TBE缓冲液,微波炉中煮沸溶化使透明,冷却至60时加入10μl EB混匀;
2 将现配制好的琼脂糖溶化凝胶液灌入制胶模具,室温放置30分钟,使其冷却固化;
3 小心取出加样梳将已制好的凝胶放入水平式潜水电泳槽中,加1×TBE缓冲液使电极液高出胶面约1cm
4 将标准DNA分子量MarkerDNA参照物,置于干热器孵育5分钟;
5 DNA分子量Marker可见性DNA参照物及待测扩增样品5μl与上样缓冲液(loading buffer溴酚兰-二甲苯青兰)2μl混合后,按照从左向右顺序依次加入凝胶上样孔中;
6 150V电压电泳45分钟;
7勒夫波 将电泳完毕的凝胶放置于紫外分析仪上,观察结果并照像,并与标准品对照,观察扩增效果。
刺辊3LDLRGYPAHBGGD7S8GC五位点DNA杂交
1 流程示意恒温室:扩增DNA与固定在探针第六上的DNA探针杂交洗涤除去非特异杂交的扩增DNA→HRP→SA与特异杂交的PCR产物结合严格洗涤除去非特异结合的HRP-SA
2 主要配制试剂
20×SSPE buffer(3.6M NaCl,200mM NaH2PO4·2H2O 20mM EDTA PH7.4)
20% SDS
Hybridization Solution(5×SSPE,0.5% SDS)
Wash Solution(2.5×SSPE,0.1%SDS)
Enzyme Conjugate:HRP-SA
Chromogen:TMB Solution
3 探针设计:由美国Perkin-Elmer公司合成已制备成探针条。
4、操作步骤
1 准备
打开干热器调温度至95
调节恒温水浴摇床温度至55.5,检查水量是否适合,放入HSWS
95%乙醇清洗实验台面以及所以器械;
用铅笔标记探针条。
2)步骤(以一个样本为例)
扩增DNA 95变性10分钟;
每个杂交槽中加入3.0ml HS加入2μl 变性的扩增DNA,放入标记探针条(此步骤需在20秒内完成),55.5恒温水浴摇床孵育15分钟;
弃去HS,加5.0mlWS洗数秒,弃去WS
3.0ml ECS液(3.0ml Hybridizition Solution,25μl Enzyme Corjugate:HRP-SA,55.5孵化5分钟,弃去ECS液;
can总线busoff加5.0ml WS洗涤数秒,弃去WS
5.0ml WS55.5恒温水浴摇床洗涤12分钟,弃去WS一次性台布
5.0ml WS,洗涤数秒,弃去WS
注意:杂交缓冲液和洗液使用前固体成份必须55.5水浴完全溶解并混匀。
5、显、判读结果并折照
1 主要配制试剂
Citrate buffer (0.1M Trisodium Citrate PH5.0)
Color Development Solution(用前10分钟内配制家具保护垫)
5.0ml Citrate buffer
5.0μl 3% Hydrogen Peroxide
0.25ml Chromogen:TMB Solution
2 操作步骤
5.0ml Citrate buffer于杂交槽,置Rocker platform上室温振荡5分钟,弃去Citrate buffer
5.0ml新配制Color Development buffer于每一杂交槽内,置杂交槽于Rocker platform
上室温振荡20-30分钟(此步应蔽光);
停止显,弃去Color Development buffer,每槽内加5.0ml去离子水或蒸馏水,置于Rocker platform上室温振荡5-10分钟;
重复步骤3)至少两次,以降低探针条背景颜;
将湿的已有分型结果DNA探针条置平滑黑物体表面,观察判读结果并拍照。

本文发布于:2024-09-24 16:28:30,感谢您对本站的认可!

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